国家自然科学基金(20673011)
- 作品数：3 被引量：2H指数：1
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- 相关机构：北京师范大学北京矿冶研究总院更多>>
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- 铂类抗肿瘤药物ZD0473和顺铂识别碱基的能量基础
- 2007年
- 用分子力学与量子化学相结合的方法HF/lanl2dz//MM/uff及密度泛函方法B3LYP/lanl2dz//6-31g*探讨了ZD0473和顺铂分别与四个DNA片段识别所形成的GG,3′AG5′,3′GA5′及AA复合物的差异.结果表明,两种药物与GG碱基对的结合能力明显强于其他碱基对,从而显示出对GG碱基对更强的识别能力,而且由ZD0473构成的每种复合物的药物部分与DNA的相互作用能都比顺铂所形成的相应复合物的作用能大,说明ZD0473与DNA的结合能力强,抗肿瘤活性高.形成3′GA5′复合物而难以形成3′AG5′复合物的原因主要在于药物分子首先识别碱基G形成单配物,其次与单配物的结构变迁相关.
- 郝兰李熙琛谭宏伟陈光巨贾木欣
- 咪唑桥连双核铜SOD模拟物的电子结构及催化活性的理论研究被引量：2
- 2008年
- 利用半经验PM3和密度泛函B3LYP方法研究了β环糊精咪唑桥连双核铜SOD模拟物({[Cu(L).(H2O)(β-CD)]2(im)}3+)、模拟物的衍生物及模拟物与底物分子结合的复合物分子的电子结构,运用自然键轨道(NBO)方法对该体系的电荷分布及成键特征进行了分析.计算结果表明,该模拟物中核心Cu离子与配体H2O分子的结合较弱,在进行超氧阴离子自由基催化反应中可被其它配体所取代.胍基的存在使得超氧化物歧化酶中Cu所带的正电荷增多,而有利于催化反应的进行.与其它配位原子相比,与两个五元环连接的N原子与Cu配位能力相对下降,这也将有利于提高Cu离子与底物的结合能力.由于自由基分子形式,使得超氧化物歧化酶模拟物与反应底物(O.2-)在酸性条件下结合后的络合物中五重态构型比相应的单重态构型更加稳定.同时双核之间的咪唑桥环也对稳定该模拟物的构型起到了一定的作用.
- 陆清霞谭宏伟陈光巨王艳
- 关键词：自然键轨道理论
- 金属核酸酶及寡聚酰胺与双链DNA分子对接模式的理论研究
- 2009年
- 采用分子对接软件AutoDock分别研究了金属核酸酶、寡聚酰胺与DNA对接模式.研究结果表明,金属核酸酶、寡聚酰胺与DNA对接结果与实验数据吻合得较好.在金属核酸酶与DNA的对接中,最优构型都是金属核酸酶对接在DNA的小沟内.随着中心金属上电荷的增加,最大对接能呈现上升趋势.尤其是配体体积较小的金属核酸酶,最佳对接位点受中心金属上电荷影响较大,即随着中心金属上电荷的从少到多,最佳对接位点呈现多样化的趋势.在柔性分子寡聚酰胺与双链DNA分子的对接中,分子随DNA小沟的柔性变形是对接结合的关键.其最佳的结合物位点也都是在DNA的小沟内,其对接结果与晶体结构一致.
- 朱艳艳苏延伟漆遥谭宏伟王艳陈光巨
- 关键词：分子对接寡聚酰胺
