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国家自然科学基金(81373922)

作品数:11 被引量:206H指数:9
相关作者:宋经元辛天怡姚辉雷美艳马晓冲更多>>
相关机构:中国医学科学院北京协和医学院重庆市药物种植研究所中国中医科学院更多>>
发文基金:国家自然科学基金国家科技支撑计划山东省高等学校科技计划项目更多>>
相关领域:医药卫生农业科学经济管理生物学更多>>

文献类型

  • 11篇期刊文章
  • 1篇学位论文

领域

  • 10篇医药卫生
  • 1篇经济管理
  • 1篇生物学
  • 1篇农业科学

主题

  • 10篇ITS2
  • 9篇DNA条形码
  • 7篇药材
  • 6篇中药
  • 6篇中药材
  • 4篇形码
  • 4篇条形码
  • 4篇伪品
  • 4篇混伪品
  • 3篇市售
  • 2篇泽泻
  • 1篇地骨皮
  • 1篇冬葵子
  • 1篇续断
  • 1篇药用
  • 1篇药用植物
  • 1篇植物
  • 1篇植物药
  • 1篇中成药
  • 1篇数据库

机构

  • 10篇中国医学科学...
  • 6篇重庆市药物种...
  • 3篇中国中医科学...
  • 1篇南京中医药大...
  • 1篇青岛农业大学
  • 1篇北京协和医学...

作者

  • 10篇宋经元
  • 7篇辛天怡
  • 4篇姚辉
  • 3篇雷美艳
  • 3篇陈晓辰
  • 3篇马晓冲
  • 2篇向丽
  • 2篇易思荣
  • 2篇张娜娜
  • 1篇谷巍
  • 1篇陈士林
  • 1篇邬兰
  • 1篇韩建萍
  • 1篇石林春
  • 1篇竭航
  • 1篇钱齐妮
  • 1篇金钺
  • 1篇张军
  • 1篇李西文
  • 1篇高婷

传媒

  • 2篇中国药学杂志
  • 2篇中国中药杂志
  • 1篇中草药
  • 1篇四川农业大学...
  • 1篇Acta P...
  • 1篇世界科学技术...
  • 1篇中国现代中药
  • 1篇中国科学:生...
  • 1篇植物科学学报

年份

  • 1篇2019
  • 1篇2018
  • 2篇2017
  • 1篇2016
  • 4篇2015
  • 3篇2014
11 条 记 录,以下是 1-10
排序方式:
中药材二维DNA条形码流通监管体系研究被引量:61
2015年
中药材品种复杂混乱给中药材流通监管造成不便,加强中药材及饮片质量监管、保证公众用药安全备受关注.本研究将二维DNA条形码技术应用于中药材流通监管领域,建立中药材二维DNA条形码流通监管体系.该体系包括DNA条形码序列获得与DNA条形码信息跨平台转换两大部分内容,以亚麻子、黑芝麻、火麻仁、蓖麻子和苘麻子5种药材共计109份样本为例研究建立该体系:依照中药材DNA条形码分子鉴定法获得待检样本DNA条形码序列;基于开源代码PHP QR Code的编码方式对实验所得DNA条形码序列进行编码,转换成二维码图片;使用移动终端扫描识读该二维码信息,并通过网页浏览器提交至中药材DNA条形码数据库获知鉴定结果.将二维码技术与DNA条形码技术相结合,为每个药材基原物种提供标准二维DNA条形码,有利于DNA条形码信息在不同平台间转换,为二维DNA条形码技术在实际流通监管工作中的应用提供理论基础,能有效实现对中药材流通的数字化监管,推动中药材流通监管现代化、国际化进程.
辛天怡李西文姚辉韩建萍宋经元陈士林
关键词:DNA条形码二维码ITS2
中药材DNA条形码鉴定研究进展被引量:70
2015年
DNA条形码技术给中药鉴定学发展带来新的机遇,中药材DNA条形码鉴定数据库及中草药DNA条形码生物鉴定体系的创建有利于推进中药鉴定标准化和国际化。中药材DNA条形码分子鉴定法指导原则已纳入《中华人民共和国药典》2010版第三增补本,为中药材基原物种鉴定提供强有力的科技支撑,将在中药材及中成药流通监管、道地药材鉴别、保健食品和食品质量安全控制等领域发挥重要作用。将中药材DNA条形码分子鉴定法与中国药典规定的其他鉴别方法相结合,能够对药品质量进行综合评价与有效监控。
辛天怡雷美艳宋经元
关键词:中药材DNA条形码ITS2PSBA-TRNHCOI
基于DNA条形码鉴定植物药常山及其混伪品被引量:5
2017年
虎耳草科(Saxifragaceae)常山属(Dichroa)植物常山(Dichroa febrifuga Lour.)是我国著名的抗疟药物。但目前全国各地使用较为混乱,代用品、混淆品多,鉴定困难。本研究收集常山及其混伪品6种,共64份样品,利用DNA条形码和二维DNA条形码技术进行物种鉴定研究。研究结果表明,DNA条形码技术可准确鉴定常山及其混伪品,20%的常山样品存在混伪现象,混伪品主要为阔叶十大功劳(Mahonia bealei(Fort.)Carr.)。常山ITS2序列长度为230 bp,种内K2P遗传距离为0~0.0253,常山及其混伪品种间K2P遗传距离为0.152~0.748。基于ITS2序列构建的NJ树显示,常山及其混伪品能够明显区分,可为临床安全用药提供科学依据。成功构建常山的二维DNA条形码鉴定体系,实现"互联网+"的跨平台信息交换,可为二维DNA条形码技术在流通监管领域的实践应用提供理论基础。
雷美艳张娜娜张军辛天怡易思荣宋经元
关键词:DNA条形码ITS2
Biomonitoring for traditional herbal medicinal products using DNA metabarcoding and single molecule, real-time sequencing被引量:23
2018年
Global concerns have been paid to the potential hazard of traditional herbal medicinal products(THMPs). Substandard and counterfeit THMPs, including traditional Chinese patent medicine, health foods, dietary supplements, etc. are potential threats to public health. Recent marketplace studies using DNA barcoding have determined that the current quality control methods are not sufficient for ensuring the presence of authentic herbal ingredients and detection of contaminants/adulterants. An efficient biomonitoring method for THMPs is of great needed. Herein, metabarcoding and single-molecule, realtime(SMRT) sequencing were used to detect the multiple ingredients in Jiuwei Qianghuo Wan(JWQHW), a classical herbal prescription widely used in China for the last 800 years. Reference experimental mixtures and commercial JWQHW products from the marketplace were used to confirm the method. Successful SMRT sequencing results recovered 5416 and 4342 circular-consensus sequencing(CCS) reads belonging to the ITS2 and psb A-trn H regions. The results suggest that with the combination of metabarcoding and SMRT sequencing, it is repeatable, reliable, and sensitive enough to detect species in the THMPs, and the error in SMRT sequencing did not affect the ability to identify multiple prescribed species and several adulterants/contaminants. It has the potential for becoming a valuable tool for the biomonitoring of multi-ingredient THMPs.
Tianyi XinZhichao XuJing JiaChristine LeonSongnian HuYulin LinSubramanyam RagupathyJingyuan SongSteven G.Newmaster
基于中药材DNA条形码系统的泽泻种子鉴别研究被引量:15
2016年
目的:以泽泻种子为研究对象,利用中药材DNA条形码鉴定系统区分不同产地泽泻的基原物种。方法:采用植物基因组DNA提取试剂盒提取总DNA,扩增核内部转录间隔区ITS2序列并进行测序。利用软件CodonCode Aligner 6.0.2和MEGA 5.1对序列进行拼接,并用体式显微镜观察记录种子外观形态特征。结果:泽泻Alisma plantago-aquatica和东方泽泻Alisma orientale种子外观形态相似;两个物种的ITS2序列长度均为311 bp,GC含量为56.9%,ITS2序列在165 bp处存在T-A变异。该鉴定结果显示,20份四川产泽泻种子样本序列为泽泻A.plantago-aquatica,其他产区36份样本均为东方泽泻A.orientale。结论:中药材DNA条形码鉴定系统可为选择正确基原的泽泻种质提供指导,该系统在泽泻人工栽培生产中具有重要应用价值,可为其他中药材种子鉴定提供示范。
张娜娜辛天怡金钺谷巍宋经元
关键词:DNA条形码泽泻种子鉴定ITS2
基于ITS2条形码序列鉴定中药材续断及其混伪品被引量:4
2014年
【目的】利用ITS2序列对中药材续断及其混伪品进行DNA条形码鉴定,从而确保用药安全。【方法】对续断及其混伪品ITS2进行扩增并双向测序,经CodonCode Aligner V3.7.1拼接比对后,用MEGA 5.0计算种内种间K2P遗传距离,并构建NJ系统聚类树进行鉴定分析。【结果】续断药材ITS2序列比对后长度为218bp;种内K2P遗传距离分布于0-0.009 4,种间K2P遗传距离分布于0.033-0.188 2,NJ树显示续断药材及混伪品可明显区分,表现较好的单系性。【结论】ITS2序列作为DNA条形码能准确鉴别续断药材。
雷美艳陈晓辰马晓冲钱齐妮竭航易思荣宋经元
关键词:续断DNA条形码ITS2
木香、川木香、土木香、青木香和红木香药材的ITS2条形码分子鉴定被引量:15
2014年
通过分析木香、川木香、土木香、青木香、红木香药材的ITS2(internal transcribed spacer 2)条形码序列,探讨木香类药材鉴定新方法。对60份样品提取基因组DNA,PCR扩增ITS2序列并进行双向测序,所得序列经CodonCode Aligner拼接后,采用MEGA5.0软件进行序列比对,计算种内和种间遗传距离(K2P),构建邻接树(neighbor-joing tree,NJ Tree)。结果表明,无论是菊科的木香、川木香、土木香,还是马兜铃科的青木香和五味子科的红木香,ITS2序列种内变异均小于种间变异,ITS2序列所有单倍型比对后长度为272 bp,变异位点达到162个;遗传距离显示物种种内平均K2P远远小于种间平均K2P;NJ树结果显示木香、川木香、土木香、青木香和红木香药材可明显区分,且能鉴别川木香的2个基原物种。因此,ITS2序列可用于鉴定木香、川木香、土木香、青木香、红木香药材,为临床安全用药提供依据。
马晓冲姚辉邬兰向丽陈晓辰宋经元
关键词:马兜铃科五味子科
基于ITS2条形码的中药材天南星及其混伪品DNA分子鉴定被引量:16
2014年
该研究收集天南星及其混伪品7种,共58份样品,通过DNA提取和PCR扩增,经注释后获得其ITS2条形码,然后进行序列变异分析和NJ树聚类分析。结果表明天南星3种基原天南星、异叶天南星和东北天南星的种内K2P距离均小于其种间K2P距离,在NJ聚类树上天南星3种基原分别聚为独立的支。天南星3种基原与天南星混伪品聚为不同的支。因此,ITS2作为DNA条形码可以鉴定天南星3种基原及其混伪品,DNA条形码技术可为天南星及其混伪品的鉴定提供新的方法。
石林春陈俊向丽宋经元姚辉
关键词:天南星ITS2DNA条形码
基于ITS2序列鉴定市售地骨皮药材及其混伪品被引量:12
2015年
目的基于中药材DNA条形码分子鉴定法鉴定市售地骨皮药材及其混伪品。方法本实验对象共计137份,依照中药材DNA条形码分子鉴定法标准操作流程(DNAbarcodingSOP)获取各样本ITS2序列,构建地骨皮药材及其混伪品DNA条形码数据库,对市售地骨皮药材及饮片进行鉴定。结果地骨皮药材ITS2序列长度为212—230bp,能够明显区分地骨皮药材及其混伪品。50%市售药材及饮片能够获得可用于分析的条形码序列,应用地骨皮药材及其混伪品DNA条形码数据库鉴定结果显示所得序列均为枸杞。结论ITS2序列能够作为地骨皮药材及其混伪品鉴定的DNA条形码,本实验所建立的地骨皮药材及其混伪品DNA条形码数据库能够用于市售地骨皮药材及饮片的鉴定。
辛天怡赵莎宋经元
关键词:地骨皮DNA条形码
基于DNA条形码SNP鉴别东方泽泻、泽泻及市售泽泻药材被引量:18
2015年
目的建立基于单核苷酸多态性(SNP)分子标记鉴定泽泻药材的方法。方法采用改良的试剂盒法提取药材基因组DNA,PCR扩增ITS2序列,通过分析比对东方泽泻和泽泻ITS2序列,确定SNP位点,并对商品泽泻药材进行鉴定分析。结果东方泽泻和泽泻ITS2序列长度为311 bp,二者均无种内变异,但种间在165 bp有稳定的A-T变异,NJ树鉴定结果亦表明二者可以准确区分;基于SNP分子条形码鉴定和NJ树鉴定市售泽泻药材,仅有7%药材样本为东方泽泻,93%的市售药材样本均非《中国药典》规定基原。结论基于SNP标记能准确鉴定中药材泽泻,为保护泽泻种质资源和指导药材生产种植提供可靠依据。
马晓冲姚辉辛天怡陈晓辰宋经元
关键词:SNPITS2分子鉴定
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