中央高校基本科研业务费专项资金(2012ZM0060) 作品数:4 被引量:21 H指数:2 相关作者: 李琳 李冰 徐振波 邓阳 刘晓晨 更多>> 相关机构: 马里兰大学 华南理工大学 更多>> 发文基金: 中央高校基本科研业务费专项资金 国家自然科学基金 国家重点基础研究发展计划 更多>> 相关领域: 轻工技术与工程 医药卫生 更多>>
De novo测序技术在啤酒易感乳杆菌全基因组研究中的应用 被引量:2 2015年 本文应用De novo测序技术对一种未经测序的啤酒易感乳杆菌进行全基因组研究,包括全基因组遗传信息的首次获取以及基因功能的生物信息学分析与注释。通过对1株从啤酒中分离获得的乳杆菌基因组DNA进行提取与纯化,构建了符合质量要求的测序文库,并进行了De novo测序;通过对De novo测序数据进行筛选与质量评价,进一步对筛选后的数据进行了De novo组装与结果评价,最后获得乳杆菌全基因组序列;在获得全基因组序列的基础上,对全基因组序列进行基因预测,并对预测基因进行GO基因功能注释、COG基因功能注释与KEGG生物通路注释,获取了该乳杆菌的基因序列与基因功能信息。该乳杆菌全基因组测序数据与组装结果良好,获得的序列中共有1,824个预测基因,其中分别有545、1,303、120条预测基因有相应的GO、COG、KEGG注释。本研究为该啤酒易感乳杆菌功能基因的研究与生物信息学分析提供了基础数据和技术参考。 刘君彦 李琳 李冰 邓阳 徐振波关键词:DE 金黄色葡萄球菌耐药性与生物被膜能力的鉴定 被引量:13 2014年 本文选择常见的典型食源性微生物金黄色葡萄球菌,从食品微生物安全角度出发,对127株葡萄球菌的菌株特性、耐药性与生物被膜生长能力进行研究,包括菌株生化鉴定;PCR扩增葡萄球菌特异16S rRNA与金葡菌特异femA基因,通过对耐药基因mecA和orfX检测确定菌株的耐药特性;最后,运用结晶紫染色法进行生物被膜能力检测。127株菌株包括119株金葡菌(均携带16S rRNA与femA)与8株凝固酶阴性葡萄球菌8株(仅携带16S rRNA)。119株金葡菌中,107株携带mecA基因与orfX基因,为耐甲氧西林金葡球菌(MRSA);8株凝固酶阴性葡萄球菌中,均携带mecA基因。所有菌株均能生成生物被膜,其中能形成强、中等与弱粘附生物被膜能力菌株分别有5(3.9%)、47(37.0%)和75(59.1%)株。金葡菌中耐药性与生物被膜较为普遍,由于食源性微生物形成生物被膜后,具有逃逸常规消毒和杀菌手段的能力,成为食品安全中的潜在隐患。 桂中玉 李琳 李冰 徐振波关键词:金黄色葡萄球菌 耐药性 细菌生物被膜 食品安全 金黄色葡萄球菌基因组岛对多重耐药表型与生物被膜能力的影响机制 被引量:1 2015年 本文选择常见的典型食源性微生物金黄色葡萄球菌,从耐药性微生物感染防控角度出发,对广州地区临床分离的127株葡萄球菌的耐药表型、基因组岛分型与生物被膜生长能力进行研究。通过微量肉汤稀释法检测确定菌株对26种抗菌药物的药敏结果;PCR扩增葡萄球菌属特异性基因16S r RNA、金黄色葡萄球菌菌株特异性基因fem A、耐药基因mec A以检测确定菌株耐药特性;多重PCR检测金葡菌基因组岛SCCmec基因元件中ccr复合物,mec复合物以对其进行分型。107株耐药型金葡菌均为多重耐药,且呈耐9种或以上抗生素占76.1%(86/113)。113株葡萄球菌SCCmec分型结果为:I型0株,II型12株,III型73株,IV型10株,V型11株,5株为无法分型;本文对基因组岛和金黄色葡萄球菌耐药表型与生物被膜能力的相关性进行分析与探讨,为进一步对各种食源性微生物引起的食品污染进行安全控制,提供了研究基础。 邓阳 梁晏瑞 苗健 李琳 李冰 徐振波关键词:金黄色葡萄球菌 多重耐药性 生物被膜 防控措施 食源性微生物MRSA及其检测方法在食品安全中的研究进展 被引量:5 2015年 食品安全在世界卫生组织的定义是指所有食品中有毒、有害物质对人体健康影响的公共卫生问题。2008年"三聚氰胺"事件后,在近几年的全国两会上,食品安全问题连续成为焦点话题;而同期全国人大常委会通过的《食品安全法》,更显示了食品安全的严重与令人担忧,其监测与控制显得迫在眉睫。作为典型的食源性微生物,金葡菌尤其是耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(Methicillin-resistant Staphylococcus aureus,MRSA)其新型的耐药特点显示了细菌耐药性的发展和进化可能是由于大量抗生素在畜牧业中的滥用而造成的。由于抗菌药物的研制周期跟不上耐药性出现的速度,使得细菌治疗面临越来越严峻的考验,甚至出现无药可用的情况,严重威胁人类健康。本文结合食品安全抗生素滥用问题与最近出现的超级细菌耐药问题,根据在相关领域多年的研究数据,对常见的食源性微生物MRSA及其检测方法在食品安全中的研究进展进行综述。 邓阳 刘晓晨 李冰 李琳 徐振波关键词:食品安全