国家科技重大专项(2008-ZX10004-011)
- 作品数:4 被引量:25H指数:3
- 相关作者:廖琳曹得萍陈建平陈达丽李菊林更多>>
- 相关机构:青海大学四川大学江苏省血吸虫病防治研究所更多>>
- 发文基金:国家科技重大专项国家自然科学基金江苏省卫生厅重点科研课题更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 核糖体小亚基RNA和细胞色素氧化酶亚单位Ⅱ基因在中国利什曼原虫系统发育学分析中应用的比较被引量:1
- 2014年
- 目的比较核糖体小亚基RNA(small subunit ribosomal RNA.SSUrRNA)和细胞色素氧化酶亚单位Ⅱ(cytochrome oxidaseⅡ,COXⅡ)这2种分子标志在中国利什曼原虫系统发育学分析中的不同。方法提取利什曼原虫各虫株核基因组和线粒体基因组.PCR方法扩增中国不同地区利什曼原虫SSUrRNA和COXⅡ基因.扩增产物送上海生工生物工程技术服务有限公司测序.序列碱基通过Clustal X软件比对,用DAMBE软件进行单倍型分析、Mega4软件计算遗传距离,Mrbayes3.1.2软件构建贝叶斯进化树。结果COXⅡ分析结果表明.流行于中国的利什曼原虫虫株未形成一个单系群:GS7和XJ771属于杜氏利什曼原虫复合体;10株利什曼原虫形成的6个单倍型(MHOM/CN/93/GS7,IPHL/CN/77/XJ771,MHOM/CN/84/JS1和MGER/CN/60/GS.GER20除外)形成1个单系群:而SSUrRNA分析结果表明:11株利什曼原虫(IPHL/CN/77/XJ771,MHOM/CN,93/GS7,MRH0/CN/88/KXG-2,MHOM/CN/84/JS1.MGER/CN/60/GS.GER20除外)形成一个独立枝;江苏株JS1和热带利什曼原虫聚在一起,不与杜氏利什曼原虫聚在一起。结论SSUrRNA和COXⅡ得出的结果较一致.但COXⅡ基因在分析利什曼原虫的系统发育关系时.可能是一个更可靠的遗传标志。
- 曹得萍廖琳陈达丽陈建平
- 关键词:前鞭毛体系统发育学
- 不同温度条件对中华按蚊发育的影响被引量:14
- 2010年
- 目的观察不同温度下中华按蚊的发育与繁殖情况,为疟疾的流行病学及适时灭蚊提供科学依据。方法在温度为16、19、22、25、28、31℃的条件下,观察实验室饲养中华按蚊的卵期、幼虫、蛹期和生殖营养周期,计算不同温度下的全代发育时间。结果中华按蚊在16℃时不能完成全发育周期,在温度为19、22、25、28、31℃时,全代发育时间分别为30.7、23.3、15.5、13.5d和12.5d。结论在温度范围为16~31℃时,中华按蚊的发育期随温度升高而缩短。
- 王伟明李菊林周华云曹俊杨坤顾亚萍朱国鼎刘耀宝
- 关键词:中华按蚊温度
- 利用SSU rRNA分子探讨中国利什曼原虫分子系统发育学被引量:3
- 2013年
- 目的利用SSU rRNA分子探讨中国利什曼原虫基因多态性及其分子系统发育学。方法采用PCR法获得中国不同地区利什曼原虫SSU rDNA,通过Clustal X软件比对序列碱基,构建贝叶斯进化树。结果中国不同地区流行利什曼原虫分属于不同的支序,在中国除了有杜氏利什曼原虫外,还有热带利什曼原虫和一支在国际上还没有定种的未定种存在。结论在中国有未定种利什曼原虫存在。
- 曹得萍廖琳陈达丽陈建平
- 关键词:系统发育学核糖体小亚基
- 湖北钉螺线粒体基因组全序列测定研究被引量:8
- 2009年
- 目的测定并分析湖北钉螺(Oncomelania hupensis)线粒体基因组全序列。方法利用特异引物和通用引物分别扩增湖北钉螺线粒体细胞色素C氧化酶Ⅰ(COⅠ)、细胞色素b(Cytb)、16SrRNA(16S)和细胞色素C氧化酶Ⅲ(COⅢ)基因片段,在此基础上利用长PCR技术扩增上述4个基因间的长片段,纯化克隆后采用引物步移法测序。结果湖北钉螺线粒体基因组全序列为15182bp(GenBank登记号为FJ997214),为闭合环状分子,A+T含量为67.3%;包括13个蛋白基因、22个tRNA基因、2个RNA基因和一段72bp的A+T富集区;蛋白质编码基因均以ATG为启动子,除呼吸链NADH脱氢酶的第一亚单位(ND1)基因以潜在的T作为终止密码子外,其余基因均以典型的TAA或TAG为终止子;基因重叠区有2处,分别为4bp和7bp;基因间隔区共21处合计145bp,长度范围为1~30bp;22个tRNA中,除2个tRNASer和tRNAGln、tRNAIle以外均能形成典型的二级结构。结论获得了湖北钉螺的线粒体基因组全序列。
- 李石柱王艺秀刘琴吕山王强吴缨张仪周晓农
- 关键词:湖北钉螺线粒体基因组