河北省科技厅科技计划项目(0624240011) 作品数:4 被引量:4 H指数:1 相关作者: 王家庆 李代宗 郭冉 王志平 刘晓慧 更多>> 相关机构: 河北农业大学 厦门大学 沈阳工学院 更多>> 发文基金: 河北省科技厅科技计划项目 秦皇岛市科技计划项目 更多>> 相关领域: 农业科学 更多>>
虹鳟腺苷酸转移酶基因2(ant2)cDNA克隆与蛋白结构分析 被引量:3 2009年 腺苷酸转移酶(ANT)是位于线粒体内膜上参与能量分子传导的转运蛋白,在细胞凋亡调控网络中发挥重要作用.以虹鳟鱼(Oncorhynchus mykiss)为研究材料,使用RT-PCR和RACE法分离和克隆了虹鳟鱼ant2基因cDNA的全长序列(GenBank登录号:FJ591153).该序列全长1 276 bp,其中5′端非翻译区长66 bp,3′端非翻译区长316 bp,开放性阅读框长894 bp,编码297个氨基酸.该蛋白具有3个保守的线粒体穿膜功能结构域和3个转膜区.通过与其他脊椎动物腺苷酸转移酶蛋白序列的比较,发现该基因具有高度保守性,氨基酸序列的同源性均在90%左右.同源模建显示其与牛的线粒体ADP/ATP载体,chain A蛋白有相同的孔洞(cavity)结构. 王家庆 刘晓慧 李代宗 宋波澜 王志平 郭冉关键词:虹鳟鱼 RT-PCR CDNA末端快速扩增 虹鳟PDCD6基因cDNA全长的克隆与功能预测 2013年 程序性死亡因子6(PDCD6)基因编码1个含EF-hand结构域的钙离子结合蛋白。应用逆转录PCR及cDNA末端快速扩增(RACE)技术从虹鳟(Oncorhynchus mykiss)脑组织中克隆了PDCD6基因cDNA的全序列(GenBank No:FJ591154)。序列全长1 179bp,其中5’端非翻译区长48bp,3’端非翻译区长567bp,开放性阅读框长564bp,编码187个氨基酸。电子表达谱分析结果表明该基因在4种脊椎动物的多个部位或组织中均有表达。同源模建蛋白三级结构显示该蛋白具有8个主要的α螺旋结构。虹鳟PDCD6蛋白序列与斑马鱼、非洲爪蟾、人、小鼠和鸡的同源性均高于85%,表明PDCD6基因在进化过程中是高度保守的,在细胞程序性死亡过程中发挥重要作用。 王家庆 李振刚 边佳 李代宗 马爽 那广宁关键词:虹鳟 RT-PCR RACE 虹鳟抗细胞凋亡因子(DAD1)基因全长cDNA克隆与进化分析 被引量:1 2013年 抗细胞凋亡因子1(Defender against cell death 1,DAD1)是内质网内膜上糖基转移酶复合体亚基之一。本文通过RT-PCR及RACE技术从虹鳟脑组织中克隆到DAD1基因cDNA全长序列(GenBank登录号:FJ849061)。该基因包括88 bp 5'-UTR、292 bp 3'-UTR以及342 bp开放阅读框(ORF)。该基因编码113个氨基酸,存在三个明显跨膜区,无信号肽序列。通过蛋白序列比对显示虹鳟DAD1蛋白序列与大西洋鲑、白斑狗鱼、斑马鱼以及裸盖鱼同源性均在90%以上。系统发育分析显示DAD1蛋白主要聚成两个群:脊椎动物DAD1群与无脊椎动物DAD1群。虹鳟DAD1与大西洋鲑DAD1蛋白亲源关系最近。 王家庆 李振刚 马爽 李代宗 王虹玲 王亮关键词:虹鳟 基因克隆 进化分析 虹鳟鱼NDK-1基因cDNA的克隆与序列特征分析 2009年 以虹鳟鱼(Oncorhynchus mykiss)为研究材料,使用RT-PCR和RACE法分离和克隆了虹鳟鱼NDK-1基因cDNA的全长序列(GenBank登录号:(FJ607868)。序列全长953 bp,其中5′端非翻译区(5-′UTR)长45 bp,3′端非翻译区(3′-UTR)长284 bp,开放性阅读框(ORF)长624 bp,编码207个氨基酸。虹鳟鱼NDPK蛋白序列与几种脊椎动物台湾樱花钩吻鲑、斑马鱼、西方爪蟾、非洲爪蟾、人和黑青斑河的同源性分别为95%,72%,68%,68%,65%和64%,表明NDK-1基因在进化过程中是高度保守的。 王家庆 刘晓慧 李代宗 韩进诚 郭冉 王岳鸿 王志平关键词:虹鳟鱼 RT-PCR RACE