国家科技基础条件平台建设计划(2005DKA21005-27)
- 作品数:4 被引量:69H指数:4
- 相关作者:陆超忠曾辉邹明宏杜丽清郭凌飞更多>>
- 相关机构:中国热带农业科学院广西壮族自治区甘蔗研究所广西壮族自治区亚热带作物研究所更多>>
- 发文基金:云南省科技计划项目国家科技部农业科技成果转化资金国家科技基础条件平台建设计划更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 顽拗植物澳洲坚果成熟叶片DNA提取方法比较被引量:8
- 2008年
- 目的:针对澳洲坚果成熟叶片中富含多糖、多酚等杂质的特点,建立澳洲坚果成熟叶片中提取高质量DNA的方法。方法:采用改良CTAB法和改良SDS法提取澳洲坚果样品的总DNA,并对产物进行紫外、电泳及PCR扩增检测。结果:改良CTAB法的平均产率为13.6μg/g,略低于改良SDS法18.5μg/g,但改良CTAB法可有效去除多糖等杂质,获得的基因组DNA质量高。OD260/OD280均在1.7—1.9之间。进行LCSR扩增可获得清晰、多态性好的条带。结论:改良CTAB法较之改良SDS法更适合于从澳洲坚果成熟叶片中提取高质量DNA。
- 郭凌飞邹明宏曾辉杜丽清陆超忠
- 关键词:澳洲坚果DNA提取改良CTAB法
- 利用ISSR分析澳洲坚果的亲缘关系被引量:14
- 2011年
- 从100条ISSR引物中筛选出19条重复性好,扩增条带清晰的引物对17份澳洲坚果种质进行亲缘关系分析。19条引物共扩增出369个位点,多态性位点249个(67.5%)。利用UPGMA法得到的聚类的结果表明17份种质分为4个类群,所有夏威夷选育出的品种在最大的一个类群中归于两个亚类,而在澳大利亚选育出的品种则分别聚为独立的类群,因此推测夏威夷选育出的品种很可能起源于两个遗传多样性不同的群体;而澳大利亚选育的品种其遗传背景和选育史与夏威夷的品种不同。
- 郭凌飞邹明宏杜丽清曾辉陆超忠刘晓静
- 关键词:澳洲坚果亲缘关系ISSR
- 均匀设计优化澳洲坚果SRAP反应体系被引量:29
- 2008年
- 以澳洲坚果部分种质为试材,采用U25(55)均匀设计表,对SRAP-PCR反应体系中Taq DNA聚合酶、模板DNA、dNTPs、Mg2+、引物5个组分的浓度进行优化。结果表明澳洲坚果25μL的SRAP反应体系的最佳组分包括2.5μL10×PCR buffer、1 UTaq DNA聚合酶、40 ng模板DNA、0.2 mmol/LdNTPs、0.2μmol/L引物和3.0 mmol/LMg2+。利用所确立的体系对部分澳洲坚果种质进行扩增的结果清晰可靠,多态性好。
- 郭凌飞邹明宏杜丽清曾辉陆超忠
- 关键词:澳洲坚果SRAP均匀设计
- 利用改良CTAB法提取澳洲坚果成熟叶片高质量DNA被引量:19
- 2007年
- 澳洲坚果的成熟叶片中次生物质含量很高,因此给DNA的提取造成很大困难。CTAB法可有效去除多糖等杂质,但常规CTAB法的提取效果并不好。为此,我们在此基础上进行改进。采用改良后的CTAB法提取了7个澳洲坚果样品的总DNA。结果表明:使用CTAB free缓冲液进行前处理可去除大部分的杂质。所获得的DNA纯度较高,OD_(260)/OD_(280)均在1.7~1.9之间,RNA消化彻底,DNA无明显降解,进行ISSR分析(UBC-835)条带清晰,多态性好。说明该方法获得的基因组DNA适合于进行以PCR为基础的DNA多态性的研究。
- 郭凌飞邹明宏曾辉杜丽清陆超忠
- 关键词:澳洲坚果DNA提取改良CTAB法