中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(2010-ts-07)
- 作品数：2 被引量：8H指数：2
- 相关作者：杨爱国吴彪周丽青田吉腾刘志鸿更多>>
- 相关机构：中国水产科学研究院黄海水产研究所上海海洋大学中国水产科学研究院长岛增殖实验站更多>>
- 发文基金：山东省科技发展计划项目中央级公益性科研院所基本科研业务费专项国家科技基础条件平台建设计划更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 魁蚶4个地理群体ITS序列变异及系统发生分析被引量：4
- 2012年
- 为充分了解我国魁蚶种质资源状况,准确定位魁蚶的养殖育种模式,本研究采用聚合酶链式反应(PCR)对采自山东蓬莱(PL)、山东黄岛(HD)、江苏前三岛(QSD)及韩国统营(KTY)4个地理群体魁蚶样本的核糖体RNA两个内转录间隔区域(ITS-1和ITS-2)进行扩增,经测序比对后分别获得长度为468bp和541bp(包含引物、插入/缺失位点)的序列。序列比对结果表明,ITS区序列变异相对较高,但4个群体的碱基组成基本一致;4个群体的ITS区序列均表现出丰富的遗传多样性,HD群体最为丰富,该群体在ITS区序列上的变异位点数也最多,HD和QSD群体共同变异位点多且集中。对不同个体间的遗传距离和分子系统树分析结果表明,ITS序列在魁蚶不同地理群体间甚至个体间存在差异,且ITS-1和ITS-2的变异频率是不一样的,4个群体合计55个个体基于ITS-1序列没有发生明显聚类现象,这4个群体合计56个个体基于ITS-2序列明显聚为PL/KTY、HD/QSD两大类,基于ITS-2序列进行系统发生分析的结果同于课题组之前基于形态度量学分析和分子标记分析的结果;HD群体遗传多样性丰富,而KTY群体遗传变异相对较少,各群体之间存在一定的遗传差异,综合考虑不同群体相对优良的生物学特征,可开展选择或杂交培育良种的研究。
- 周丽青杨爱国王清印吴彪于涛
- 关键词：魁蚶地理群体ITS-2
- 魁蚶4个地理群体遗传多样性微卫星分析被引量：5
- 2013年
- 利用多态性好的20对微卫星引物，对中国日照、黄岛、蓬莱和韩国的4个魁蚶地理群体进行了遗传多样性分析。结果显示，20个位点在4个群体中的等位基因数为3～17，平均等位基因数为8．35，平均有效等位基因数为6．2306；观测杂合度（He）为0．4667～0．9667；期望杂合度（H。）为0．6198～0．9318；多态信息含量（PIC）为0．5301～0．9093，表现出高的遗传多样性水平。4个群体间的遗传分化指数（Fst）在0．0132～0．0314之间，呈现出较低的遗传分化。群体间的遗传距离在0．1255～0．2458之间；通过构建UPGMA聚类树，显示日照群体和黄岛群体最先聚类，再与蓬莱群体聚类，最后与韩国群体聚类，说明中国群体与韩国群体亲缘关系较远。
- 田吉腾刘志鸿杨爱国吴彪周丽青
- 关键词：魁蚶微卫星地理群体
