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质检公益性行业科研专项项目(20120055)
作品数:
1
被引量:3
H指数:1
相关作者:
张朋
申斯思
康林
郑晓聪
余剑敏
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相关机构:
华中农业大学
深圳出入境检验检疫局
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作者
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何俊强
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贾鹏
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兰文升
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刘荭
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2012
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两株传染性造血器官坏死病病毒的分离及其糖蛋白基因序列分析
被引量:3
2012年
对所分离编号为20101008和20101032的两株传染性造血器官坏死病病毒(IHNV)的糖蛋白编码基因进行遗传进化分析,以揭示我国毒株与其他不同国家和地区毒株间的遗传进化关系。以反转录RCR(RT-PCR)法扩增其糖蛋白(G)编码基因,然后克隆入PMD-18T载体并测序。应用DNAStar和MEGA4.0软件,将20101008和20101032的G基因与多株GenBank中已发表的IHNV毒株相应基因进行比较。结果表明两株病毒间G编码基因的核苷酸和推导出来的氨基酸同源性分别为98%和81.9%,其氨基酸序列分别发生了35和20处氨基酸的替换。20101008和20101032与日本、韩国分离株同源性较高,核苷酸及推导出来的氨基酸同源性分别为93.3%~96.4%和75.9%~84.6%;两株病毒在进化关系上亲缘关系最近,属于同一分支,均为基因U型传染性造血器官坏死病病毒,但其G基因的核苷酸序列以及推导出来的氨基酸序列与已知的基因U型IHNV都有一定的差异。
申斯思
郑晓聪
刘荭
史秀杰
贾鹏
兰文升
何俊强
张朋
余剑敏
杜娟
肖启明
康林
关键词:
糖蛋白
同源性
进化分析
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