国家自然科学基金(81371746) 作品数:14 被引量:9 H指数:1 相关作者: 黄怀球 张静 黄丽林 高文超 黄家敏 更多>> 相关机构: 中山大学附属第三医院 中山大学孙逸仙纪念医院 中山大学 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 广东省科技计划工业攻关项目 广东省自然科学基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 更多>>
白念珠菌Mdr1基因生物信息学分析 2017年 目的:探讨白念珠菌多重耐药基因(Mdr1)DNA、mRNA、蛋白的潜在生物学性质。方法:采用生物信息学方法对白念珠菌Mdr1基因DNA、mRNA、蛋白序列进行分析。结果:Mdr1 DNA中无内含子,Mdr1 mRNA中含有多个调控元件和腺苷酸化位点、AU富集区,对二级结构分析显示,Mdr1 mRNA全长序列可形成棒状结构。蛋白质的理化性质分析显示MDR1蛋白稳定系数为37.14,提示MDR1蛋白较为稳定。Target P 1.1和Signal P 4.1预测结果显示MDR1蛋白不含有线粒体定位序列和分泌信号肽。SWISS-MODEL 3D建模,MDR1蛋白质的3D结构类似于通道管状形态。Motif Scan分析结果显示,MDR1蛋白第116-557个氨基酸构成主要协同转运蛋白超家族,TMHMM预测在此范围内含有12个跨膜区间,为跨膜蛋白。结论:Mdr1基因的表达可能受其它基因的调控,MDR1蛋白为主要协同转运蛋白超家族成员,其功能域或为潜在的药物靶点。 何泰龙 高文超 孙瑶 黄家敏 黄丽林 张静 张云青 李美荣 尹颂超 黄怀球关键词:白念珠菌 MDR1基因 生物信息学 申克孢子丝菌TPS基因生物信息学分析 被引量:1 2018年 目的:分析和预测申克孢子丝菌海藻糖磷酸合成酶(TPS)基因及其编码蛋白的生物信息学特征及功能。方法:利用生物信息学软件和网站分析预测申克孢子丝菌TPS基因及其编码蛋白的结构和功能特征。结果:申克孢子丝菌TPS基因全长为2 864 bp,编码905个氨基酸。Target P和MotifScan预测该蛋白定位于胞浆中,具有糖基转移酶、海藻糖磷酸酶两大功能域及丰富的修饰位点,其中磷酸化位点尤为丰富,包含cAMP依赖性磷酸激酶、蛋白激酶C(PKC)和酪氨酸激酶(CK2)磷酸化位点。TPS蛋白是亲水性蛋白,无跨膜结构,未发现信号肽。结论:预测申克孢子丝菌TPS基因编码蛋白位于胞浆中,具有糖基转移酶、海藻糖磷酸酶两大功能域及丰富的修饰位点的结构功能特点,可行相应小分子抑制剂筛选以开发新型抗真菌药物。 黄家敏 李玉哲 高文超 吴晓雁 孙瑶 黄丽林 张静 李美荣 胡南 旷翠娥 刘佳庆 黄怀球关键词:申克孢子丝菌 生物信息学 申克孢子丝菌4Hppd基因结构功能的生物信息学分析 2020年 目的:初步预测及分析申克孢子丝菌(Sporothrix schenckii,Ss.)对羟苯基丙酮酸双加氧酶基因(4Hppd)编码蛋白的结构和生物学功能特征。方法:应用生物信息学在线工具预测分析Ss.4Hppd编码蛋白的理化性质及功能特征。结果:Ss.4Hppd基因编码蛋白含对羟苯基丙酮酸双加氧酶保守域,由477个氨基酸构成,理论分子量为52.0 kD,等电点为5.98,半衰期较长,该蛋白为非分泌蛋白,定位于线粒体中。其二级结构以无规则卷曲及α-螺旋为主,另外还存在乙二醛酶功能域及丰富的磷酸化位点,与其他致病真菌同源蛋白有较高的相似度。结论:预测Ss.4HppD位于线粒体中,具有乙二醛酶功能域结构功能特点及丰富修饰位点,可为其表达、晶体结构分析及小分子抑制剂开发提供参考。 吴晓雁 张静 黄家敏 孙瑶 黄晓雯 高文超 吴榕 陈三妹 黄怀球关键词:申克孢子丝菌 生物信息学分析 申克孢子丝菌Sec14基因相关功能和药物靶点分析 2020年 目的初步了解申克孢子丝菌Sec14基因DNA、m RNA、蛋白的生物学特征及功能位点。方法生物信息学方法分析申克孢子丝菌Sec14基因DNA、m RNA、蛋白的生物学特征。结果申克孢子丝菌Sec14基因启动子可能位于其基因编码区起始位点前224~274 bp处,包含转录起始位点-265 bp,该基因无内含子;Sec14 mRNA含有丰富转录调节元件,并含有microRNA结合位点;Sec14p样蛋白由351个氨基酸残基构成,分子量为39×10^3Mr,理论等电点为5.25,二级结构主要由α-螺旋和无规卷曲构成,Sec14p样蛋白的三级结构呈现典型的球状结构,包裹一个疏水性口袋,该区域含有磷脂分子结合区域,蛋白还分布着丰富的磷酸化位点及2个二分裂核定位信号。吡啶酰胺小分子化合物在磷脂分子结合区域与蛋白相作用,结合能为-6.5 kcal/mol,蛋白还具有丰富的抗原表位。Sec14p样蛋白序列在大部分真菌中一致性较好,同源性高。结论申克孢子丝菌Sec14基因具有典型真菌基因组基因特征,mRNA可变性高,其编码蛋白的磷脂分子结合位点可作为新型小分子的药物靶点。 吴晓雁 张静 高文超 李玉哲 吴榕 陈三妹 黄怀球关键词:申克孢子丝菌 生物信息学分析 吡啶酰胺 Toll样受体2和4在抗孢子丝菌早期免疫阶段小鼠皮肤中的表达 被引量:1 2015年 目的探讨小鼠皮肤Toll样受体(TLR)2和TLR4在抗孢子丝菌早期免疫阶段的表达。方法实时荧光定量PCR检测BALB/c小鼠皮肤早期免疫阶段的TLR2和TLR4mRNA表达水平,同时通过免疫组化检测两者蛋白表达水平。结果孢子丝菌分生孢子接种小鼠皮肤后,TLR2mRNA转录水平在6h后逐渐升高至对照组的18.8倍,24h达高峰,为对照组的34倍;TLR4mRNA转录水平在6h内达高峰,为对照组的56.7倍,此后逐渐下降。免疫组化结果显示,孢子丝菌处理组小鼠皮肤角质形成细胞及巨噬细胞均可表达TLR2和TLR4蛋白,对照组不表达。血清中白细胞介素12及肿瘤坏死因子α在实验组和对照组的表达差异无统计学意义。结论TLR2和TLR4参与了小鼠皮肤角质形成细胞和巨噬细胞对孢子丝菌的识别,有助于免疫防御作用。 张静 黄丽林 张晓辉 钟毅 何泰龙 袁立燕 黄怀球关键词:TOLL样受体2 TOLL样受体4 球形孢子丝菌伊曲康唑耐药株在大蜡螟模型中的毒力和耐药性评价 被引量:1 2020年 目的:使用大蜡螟模型评价球形孢子丝菌伊曲康唑耐药株的毒力和对伊曲康唑的敏感性。方法:使用球形孢子丝菌伊曲康唑耐药株和敏感株分别建立大蜡螟幼虫感染模型,观察大蜡螟幼虫的外观变化、身体反馈及存活情况。向感染球形孢子丝菌的大蜡螟幼虫体内分别以20 mg/kg和40 mg/kg的剂量注射伊曲康唑,检测大蜡螟幼虫的存活情况和载菌量。结果:观察终点时,大蜡螟幼虫耐药株组和敏感株组之间的生存曲线无统计学差异(χ^2=2.37,P=0.124);注射40 mg/kg的伊曲康唑后,感染球形孢子丝菌耐药株和敏感株的大蜡螟生存率分别提高40%和60%,两者之间无统计学差异(χ^2=1.20,P=0.466),敏感株感染的大蜡螟菌落计数降低更为明显(t=-18.64,P<0.001)。结论:在大蜡螟模型中,球形孢子丝菌伊曲康唑耐药株的毒力和敏感株无差异,耐药株对伊曲康唑的敏感性低于敏感株。 张静 何泰龙 吴晓雁 黄晓雯 黄怀球关键词:大蜡螟 毒力 伊曲康唑 重组华支睾吸虫亲环素A的免疫保护作用 2018年 目的探讨华支睾吸虫亲环素A(CsCyPA)免疫对华支睾吸虫感染及其所致肝损伤的保护作用。方法将10只雄性SD大鼠随机分成两组,实验组进行重组华支睾吸虫亲环素A(rCsCyPA)免疫,对照组注射同等体积的磷酸盐缓冲液(PBS),实验组平均抗体滴度达到1∶20 000后,对实验组和对照组大鼠进行囊蚴灌胃感染(300个囊蚴/只)。40 d后,连续3 d粪检计算减卵率;3个月后处死大鼠,回收成虫计算减虫率,收集血清检测丙氨酸氨基转移酶(ALT)和天门冬氨酸氨基转移酶(AST)水平,并取肝脏胆管周围组织进行HE及Masson染色。结果实验组大鼠相对于对照组减虫率及减卵率分别为31.5%和46.2%;实验组大鼠血清中肝脏功能生化指标AST、ALT水平较对照组得到有效控制,而相对于正常大鼠差异无统计学意义(P>0.05);HE及Masson染色显示实验组大鼠肝脏胆管周围腺瘤样病变、炎性细胞浸润、胶原沉积的程度相对对照组明显减轻。结论 rCsCyPA是一个较好的抗感染和抗病理损伤的保护性抗原。 蒋娟 蒋娟 余新炳 尹红玲 胡旭初关键词:华支睾吸虫病 亲环素A 免疫保护 孢子丝菌病及其病原真菌的再认识 被引量:1 2021年 孢子丝菌病是由双相型真菌孢子丝菌复合体引起的皮肤黏膜、皮下组织及局部淋巴系统的慢性感染性疾病,可播散至全身引起多系统损害,是一种全球性的人畜共患真菌病,临床表现以固定型和淋巴管型为主。病原真菌孢子丝菌复合体包含多种孢子丝菌,它们在微观形态学、遗传学、流行病学、耐药性和致病性等方面存在差异。孢子丝菌复合体的致病性与其本身的黑素、粘附因子及几丁质等毒力因素有关。课题组参与了孢子丝菌复合体的全基因组和转录组的测序分析工作和对孢子丝菌毒力因素研究,为孢子丝菌病的发病机制研究提供了基础。 黄怀球关键词:孢子丝菌病 基因组学 转录组学 翻译控制肿瘤相关蛋白 被引量:1 2013年 翻译控制肿瘤相关蛋白在细胞内和细胞外均起作用。它在翻译和转录水平受到胞外的各种信号调控,在肿瘤、凋亡、免疫等多个方面发挥重要作用。本文对该蛋白的结构组成、生物功能、受调控的机制等方面进行综述。 李文娟 袁立燕 黄怀球 周俊杰关键词:免疫 肿瘤 须癣毛癣菌感染致女童眼周面癣1例 2014年 患儿,女,7岁,右眼睑周围皮肤红斑丘疹伴瘙痒2周,外用糖皮质激素药膏后加重,皮疹扩大。取患者皮疹边缘皮屑行真菌学检查,直接镜检可见透明有隔真菌菌丝,真菌培养结果鉴定为须癣毛癣菌生长;取患儿家庭所饲养宠物兔耳部皮损皮屑及毛发行真菌学检查,直接镜检可见发内链状孢子,真菌培养结果为须癣毛癣菌。提取病原菌DNA,利用引物ITS4和ITS5进行r DNA ITS区序列的PCR扩增,扩增产物测序后在Genbank核酸数据库中进行同源性比对。证实患者面癣病原菌与家兔被毛所携带的须癣毛癣菌同源性达99%。患者经抗真菌治疗后痊愈。 李美荣 张云青 尹颂超 黄丽林 周俊杰 叶聪秀 谢淑霞 赖维 黄怀球关键词:须癣毛癣菌 面癣 人兽共患病