内蒙古自治区高等学校科学研究项目(NJZY08059)
- 作品数：13 被引量：12H指数：2
- 相关作者：胡秀珍王婷张怀光王春连石瑞佳更多>>
- 相关机构：内蒙古工业大学长治职业技术学院更多>>
- 发文基金：内蒙古自治区高等学校科学研究项目国家自然科学基金内蒙古自治区自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 酶亚家族类预测的一种新方法
- 2009年
- 酶是活细胞内产生的具有高度专一性和催化效率的蛋白质,又称为生物催化剂,广泛存在于各种细胞中,催化细胞生长、代谢等生命过程中几乎所有的化学反应。
- 石瑞佳胡秀珍
- 关键词：支持向量机
- 基于GO-PseAA的凋亡蛋白亚细胞定位被引量：1
- 2009年
- 亚细胞定位与蛋白质的功能紧密相关,细胞凋亡蛋白在生物体的发育和平衡状态中起着重要的作用,因此细胞凋亡蛋白的亚细胞定位是十分有意义的。
- 樊玉才胡秀珍
- 基于组合向量的支持向量机方法预测膜蛋白类型
- 2009年
- 细胞膜是细胞生命活动的必需组分。细胞膜除了作为物理屏障以外,还参与细胞中多种生理活动,包括细胞与外界的物质交换、能量传导。
- 王婷胡秀珍
- 关键词：膜蛋白支持向量机
- 一种预测膜蛋白类型的新方法
- 2009年
- 本文以紧邻氨基酸出现的频数为参数,用离散增量方法预测了6种类型膜蛋白.并用自洽、留一法和独立检验三种方法对算法进行检验,均获得了较好的预测效果.
- 王婷胡秀珍
- 关键词：膜蛋白
- 基于添加模体信息和功率谱密度的组合向量预测27类蛋白质折叠子被引量：1
- 2010年
- 以序列相似性低于40%的1895条蛋白质序列构建涵盖27个折叠类型的蛋白质折叠子数据库,从蛋白质序列出发,用模体频数值、低频功率谱密度值、氨基酸组分、预测的二级结构信息和自相关函数值构成组合向量表示蛋白质序列信息,采用支持向量机算法,基于整体分类策略,对27类蛋白质折叠子的折叠类型进行预测,独立检验的预测精度达到了66.67%。同时,以同样的特征参数和算法对27类折叠子的4个结构类型进行了预测,独立检验的预测精度达到了89.24%。将同样的方法用于前人使用过的27类折叠子数据库,得到了好于前人的预测结果。
- 刘雷胡秀珍
- 关键词：功率谱密度支持向量机
- 基于物化特性编码和离散增量的支持向量机方法预测酶的亚类被引量：1
- 2011年
- 从酶序列出发,提出了一种新的酶的亚类的预测方法。利用物化特性编码和离散增量得到特征向量来表示序列信息,并将这些特征向量输入支持向量机,对酶的6个家族类中各自的亚类进行分类。在Jacknife检验下,氧化还原酶,转移酶,水解酶,裂解酶,异构酶和连接酶中包含的亚类得到的预测精度分别为96.2%,99.2%,99.6%,95.3%,94.4%和97.7%。该方法得到的预测结果优于其它方法。
- 石瑞佳胡秀珍
- 关键词：支持向量机
- 基于改进的GO-PseAA方法的凋亡蛋白亚细胞定位
- 2012年
- 亚细胞定位与蛋白质的功能紧密相关,细胞凋亡蛋白在生物体的发育和平衡状态中起着重要的作用,因此预测凋亡蛋白的亚细胞定位是十分有意义的。本文采用一种融合GO分子功能信息和伪氨基酸组分信息的杂合算法即GO-PseAA方法,来预测凋亡蛋白亚细胞定位。采用与Chen等相同的数据集和Jackknife检验,预测成功率达到了91.4%,结果表明本文采用的改进的GO-PseAA方法是预测凋亡蛋白亚细胞位置的一种很有效的方法。
- 樊玉才胡秀珍
- 关键词：支持向量机
- 27类蛋白质折叠子的识别及其位点的统计分析
- 2010年
- 从蛋白质的氨基酸序列出发,采用"全体分类"的分类策略识别27类折叠子.当使用5种矩阵打分的方法识别27类折叠子时,预测结果并不理想,进一步使用了以矩阵打分方法得到的分值及氨基酸的二肽组分共同作为参数的离散增量算法,取得了较好预测效果.总的预测成功率达到了45.43%.
- 王春连胡秀珍
- 基于GO-PseAA的凋亡蛋白亚细胞定位
- ＜正＞亚细胞定位与蛋白质的功能紧密相关,细胞凋亡蛋白在生物体的发育和平衡状态中起着重要的作用,因此细胞凋亡蛋白的亚细胞定位是十分有意义的。
- 樊玉才胡秀珍
- 文献传递
- 改进的离散增量算法预测27类折叠子的结构类型被引量：6
- 2009年
- 蛋白质二级结构预测是三级结构预测的一个非常重要的中间步骤,而折叠子识别和结构类型的准确预测则可以提高二级结构和三级结构预测的准确度.本文从蛋白质的一级序列出发,提出了一种改进的预测算法:以二肽组分、预测的二级结构信息、伪氨基酸组分和位置权重矩阵打分值等特征分别作为参数,输入离散增量算法的单分类器中,通过加权融合单分类器的计算结果,对27类折叠子的结构类型进行了预测,取得了较好的预测结果.
- 张怀光胡秀珍
- 关键词：位置权重矩阵
