中国科学院知识创新工程重要方向项目(KSCX2-SW-207)
- 作品数：2 被引量：42H指数：2
- 相关作者：曾长青林伟丁惠国赵洪斌周珺更多>>
- 相关机构：中国科学院首都医科大学附属北京佑安医院中国科学院研究生院更多>>
- 发文基金：中国科学院知识创新工程重要方向项目国家科技重大专项更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 高通量飞行时间质谱基因分型方法的研究被引量：21
- 2005年
- 为了考察飞行时间质谱基因分型方法(MALDI-TOF)的位点分型成功率和分型结果质量的关系,分析了96个SNPs位点的近10000个基因分型数据(用MALDI-TOF“4重”实验方法检测).结果显示,位点分型成功率和分型结果的质量显著正相关.分型成功率低于82%的SNP位点,其高质量结果占的比例开始逐渐降低.提示82%的分型成功率可以作为衡量分型结果质量的数据点.为了进一步提高通量并降低成本,在MALDI-TOF“4重”实验方法的基础上,发展了两种“准8重”实验方法.用新的实验方法检测了95个样本的32个SNPs位点.结果显示“混合准8重”实验方法与“4重”实验方法相比无显著差异,而“复点准8重”的结果差于“4重”分型方法.
- 赵辉王威张清润高扬赵洪斌周珺林伟曾长青
- 关键词：飞行时间质谱基因分型
- 公共核酸数据库乙肝病毒全基因组序列概况和中国HBV参照序列的建立被引量：21
- 2008年
- 截至2007年1月,世界三大核酸数据库(GenBank,EMBL,DDBJ)库中已经登录来自46个国家和地区的HBV全基因组的8种基因型近900条序列.文中对公共核酸数据库中现有的HBV全部基因组序列进行了统计分析并从基因型的地理分布及其临床特征等方面进行了评述,为进一步研究病毒与宿主的关系,以及HBV的人群分布和进化历史提供帮助.同时,通过系统进化分析对所有登录的229条中国地区HBV全基因组序列及其课题组新近完成的59条全基因组序列进行了基因分型,并根据这些序列建立了中国地区B基因型和C基因型的参照序列,为中国地区HBV的突变研究提供了DNA序列参照体系.此外,对于目前不同数据库信息内容和登录情况进行了分析,提出全面结合宿主临床信息和HBV基因组信息研究的建议.
- 吴光华丁惠国曾长青
- 关键词：基因型
