黑龙江省博士后基金(LBH-Z05013)
- 作品数:5 被引量:56H指数:5
- 相关作者:接伟光蔡柏岩葛菁萍阎秀峰王雪更多>>
- 相关机构:黑龙江大学东北林业大学黑龙江东方学院更多>>
- 发文基金:黑龙江省博士后基金博士科研启动基金更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 不同生境黄檗AM真菌菌群结构分析被引量:6
- 2012年
- 以3个不同生境黄檗菌根为研究对象,采用酸性品红染色法分析黄檗根系AM真菌侵染情况;利用PCR-DGGE技术并结合DGGE图谱分析、DNA测序及系统发育分析,研究黄檗菌根AM真菌菌群组成及多样性,揭示不同生境黄檗AM真菌菌群动态变化规律,为黄檗菌根功能菌群的研究奠定基础。结果表明:不同生境黄檗根系与AM真菌均能形成良好的共生关系,并且侵染率、DGGE图谱条带丰度和优势度存在差异。城市人工林地区菌根的侵染率、丰度、优势度、多样性指数均高于天然次生林和天然原始林,且天然原始林地区菌根各项检测指标最低。DGGE条带测序和系统发育分析显示:全部序列可分为4类菌群,即球囊霉属、盾孢囊霉属、多孢囊霉属和肉盘菌科。城市人工林、天然次生林和天然原始林黄檗根系样品中最具优势的AM真菌均为Glomus属。
- 王雪接伟光蔡柏岩
- 关键词:黄檗AM真菌PCR-DGGE菌群结构
- 黄檗根围丛枝菌根真菌菌群组成被引量:15
- 2009年
- 从东北林业大学林场采集黄檗Phellodendron amurense根系及根围土壤,采用Nested-PCR技术扩增黄檗菌根及根围土壤AM真菌18SrDNA NS31/Glol区域,利用该产物进行DGGE分析,并结合DNA测序、系统发育分析及DGGE图谱分析技术对黄檗AM真菌菌群组成进行分析。结果表明:Nested-PCR技术具有较高的灵敏性,可有效地从微量DNA中扩增出约230bp的目的片段;黄檗根系及根围土壤具有不同的DGGE指纹图谱特征,DGGE带谱在条带的数量、亮度、优势度等方面均存在较大差异,全部序列可分为3类菌群,即球囊霉属Glomus、盾孢囊霉属Scutellospora及植物病原菌黄杨亚赤壳Hyponectria buxi,其中Glomus sp.(EF177624)和Glomus sp.(DQ085205)分别为黄檗根系和根围土壤样品中最具优势的AM真菌。
- 蔡柏岩葛菁萍接伟光阎秀峰
- 关键词:RDNA变性梯度凝胶电泳系统发育分析
- 黄檗丛枝菌根真菌鉴定被引量:7
- 2007年
- 目的:利用形态学特征与Nested-PCR技术鉴定黄檗丛枝菌根真菌。方法:采用酸性品红染色法挑选黄檗丛枝菌根。同时,利用湿筛法获得AM真菌孢子,进行形态学鉴定。运用Nested-PCR技术,对黄檗粗提DNA进行特异性扩增,采用blastn进行序列相似性比较,并构建系统进化树,确定侵染黄檗根系的AM真菌。结果:编号为HDAM-1的AM真菌孢子,形态特征与G.intraradices的特征描述一致。Nested-PCR检测到约455bp的目的片段,其序列与G.intraradices(DQ469118)相似性最高,达97.8%,有11个碱基的差异。系统进化树显示该序列在基于25SrDNA的进化树中与G.intraradices(DQ469118.1)处于同一分支,确定G.intraradices侵染黄檗根系。结论:将形态学特征与Nested-PCR技术相结合鉴定AM真菌,不仅简易、经济,而且能够提高研究结果的可靠性。
- 接伟光蔡柏岩葛菁萍阎秀峰
- 关键词:黄檗丛枝菌根真菌
- 黄檗根围丛枝菌根(AM)真菌的分离与分子鉴定被引量:26
- 2008年
- 从东北林业大学林场采集黄檗Phellodendron amurense根系及根围土壤,采用形态学和分子生物学方法对分离得到的丛枝菌根(arbuscular mycorrhiza,AM)真菌孢子进行了分类鉴定。依据AM真菌孢子形态特征鉴定出黄檗根围土壤中存在4种AM真菌:根内球囊霉Glomus intraradices,摩西球囊霉Glomus mosseae,美丽盾孢囊霉Scutellospora calospora和变形球囊霉Glomus versiforme,而应用nested-PCR技术从黄檗根内只检测到了G.intraradices,G.mosseae和Scu.calospora,表明G.versiforme未侵染黄檗根系。
- 蔡柏岩接伟光葛菁萍阎秀峰
- 关键词:NESTED-PCR系统发育分析
- 黄檗丛枝菌根(AM)真菌PCR-DGGE条件研究被引量:11
- 2008年
- 从东北林业大学林场采集黄檗根际土壤及菌根,采用Nested—PCR技术分别扩增黄檗菌根及根际土壤AM真菌18SrDNANS31/Glol区域,利用该扩增产物对AM真菌DGGE条件进行优化。表明Nested—PCR技术具有较高的灵敏性,可有效的从微量DNA中扩增出约230bp的目标片段;经DGGE条件优化,确定AM真菌最佳DGGE条件为丙烯酰胺浓度8.0%,纯化后的PCR产物作为DGGE上样样品,凝胶变性梯度范围30%~60%,电泳电压130V,电泳时间8h,电泳温度60℃。
- 接伟光蔡柏岩葛菁萍阎秀峰
- 关键词:黄檗丛枝菌根真菌变性梯度凝胶电泳