国家科技重大专项(2008ZX10004-006)
- 作品数：16 被引量：48H指数：5
- 相关作者：朱庆义胡朝晖赵利伟陈文聪石晓路更多>>
- 相关机构：广州金域医学检验中心有限公司深圳市疾病预防控制中心深圳市慢性病防治中心更多>>
- 发文基金：国家科技重大专项国家标准化管理委员会项目深圳市科技计划项目更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学农业科学更多>>
- 生物信息学的进展及其在分子微生物学研究中的应用被引量：10
- 2011年
- 生物信息学的飞速发展,为其他生命学科的研究提供了新的平台。随着微生物基因组、蛋白质组的数据日益丰富,生物信息学方法在分子微生物学研究中应用越来越广泛,为人类疾病防治带来了不可估量的影响。本文概述了生物信息学的研究概况和生物信息学在分子微生物学研究领域中的应用,如微生物鉴定、溯源分析、新型疫苗研究,以及微生物致病机理的研究等具有重要意义。
- 陈文聪胡朝晖朱庆义
- 关键词：生物信息学
- 军团菌病国内流行概况和预防被引量：3
- 2013年
- 军团菌病（Legionnairedisease）于1976年在美国费城召开的退伍军人大会首次暴发流行，导致221人患病，34人死亡。随后欧洲、澳洲等不同国家和地区相继发现军团茵病例报道，我国于1982年在南京首次发现军团菌病例。近30年来，军团菌病在世界各地时有暴发流行，受到各国政府和卫生部门的高度重视。
- 陈文聪胡朝晖朱庆义
- 关键词：军团菌病病例报道退伍军人卫生部门
- 军团菌病常用治疗药物的敏感性研究被引量：1
- 2012年
- 嗜肺军团菌是引起人类军团病的重要病原体,治疗军团病的首选药物是红霉素。近年来,新大环内酯类抗生素及喹诺酮类抗生素被推荐用于军团病的治疗。本文就嗜肺军团菌对大环内酯类和喹诺酮类药物的抗菌机制、药代动力学及其敏感性做一简要概述。
- 刘洋敏胡朝晖朱庆义
- 关键词：军团菌大环内酯类喹诺酮类药物敏感性
- 伤寒沙门菌PFGE分子分型及耐药性研究被引量：4
- 2012年
- 目的对深圳市2004-2011年伤寒沙门菌进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型及耐药性分析,为临床用药和追踪传染源提供依据。方法采用K-B法对42株伤寒沙门菌进行20种抗菌药物敏感性测试,并用PFGE对其进行分子分型。结果 42株伤寒沙门菌株对氨苄西林、阿莫西林/克拉维酸、氨苄西林/舒巴坦、头孢噻吩、头孢他啶、头孢曲松、头孢吡肟、头孢西丁、阿米卡星、庆大霉素、卡那霉素、环丙沙星、左旋氧氟沙星、复方新诺明、甲氧苄啶、氯霉素和四环素17种药物的敏感率均超过90%,对萘啶酸耐药率最高达61.5%。42株伤寒沙门菌株可分为SZ0001-SZ0028共28个PFGE型别,其中流行优势型为SZ0023型别。结论结合药物敏感试验结果和PFGE分子分型结果可以判断伤寒疫情的优势株型。
- 林一曼李迎慧扈庆华吕东月邱亚群石晓路
- 关键词：伤寒沙门菌药敏PFGE分型
- 实时荧光定量PCR及其在军团菌检测中的应用被引量：3
- 2011年
- 军团菌是一种兼性胞内寄生菌,可入侵人体巨噬细胞,并在其中繁殖,是引起人类军团菌病的重要病原体。目前已确认军团菌有50多个种,70多个血清型,其中20多种与人类疾病相关[1]。由于军团菌种类繁多,常规的检测鉴定方法已不能满足需要。近年来,随着分子技术特别是PCR技术的发展,已有许多分子生物学方法被用于军团菌的检测。
- 赵利伟胡朝晖朱庆义
- 关键词：军团菌病基因设计RRNA荧光基团荧光定量
- 环境水军团菌分离培养及其表型与分子分型研究被引量：5
- 2012年
- 目的探讨环境水系军团菌分离培养及其表型和分子分型鉴定方法。方法采用军团菌常规分离培养、生化试验、血清学分型和菌体脂肪酸成分分析、PCR试验、AFLP基因分型和SBT核酸测序分型鉴定等技术方法,对广东地区195份环境水系分离的226株军团菌进行表型和基因型分型鉴定。结果在广东地区195份环境水样中共检出军团菌226株,主要是嗜肺军团菌170株(75.22%),长滩军团菌21株(9.29%)、菲氏军团菌21株(9.29%)、橡树岭军团菌和茴芹军团菌各2株(0.89%),其他非嗜肺军团菌10株(4.42%)。125株军团菌细胞脂肪酸成分测定分嗜肺军团菌、橡树岭军团菌、长滩军团菌、菲氏军团菌等6种类型;54株嗜肺军团菌1型AFLP分型,分为25个基因型。7株不能用生化试验、细胞脂肪酸成分分析和AFLP分型做出鉴定的军团菌,用SBT核酸测序鉴定为菲氏军团菌2株、长滩军团菌3株和茴芹军团菌2株。结论广州地区环境水系军团菌分布以嗜肺军团菌为主,同时有橡树岭军团菌、菲氏军团菌、长滩军团菌和茴芹军团菌等多种军团菌种;SBT核酸测序鉴定有助于发现军团菌新种。
- 朱庆义胡朝晖赵利伟陈文聪杨瑞馥宋亚军郭兆彪
- 关键词：军团菌表型分子分型环境水
- 改良分子信标-实时荧光PCR同时检测猪霍乱沙门菌和丙型副伤寒沙门菌被引量：3
- 2011年
- 目的建立猪霍乱沙门菌和丙型副伤寒沙门菌的实时荧光PCR快速检测方法,应用于食品和食物中毒病人标本的猪霍乱沙门菌检测以及沙门菌属C群的鉴别诊断。方法根据GenBank公布的猪霍乱沙门菌和丙型副伤寒沙门菌的保守序列(CP000857.1),设计引物和改良分子信标探针,优化PCR程序和PCR成分,以11种细菌为对照,建立实时荧光PCR检测方法,并用71株常见血清型的沙门菌评价该方法的灵敏度和特异性,所建立的方法应用于70份食品样品的检测。结果该改良分子信标—荧光PCR方法的DNA最低检出限为10fg/反应体系,菌液最低检出限为20 CFU/反应体系;无交叉荧光信号产生。针对目标菌均出现特异荧光信号。对71株沙门菌属的检测,该方法的灵敏度和特异度为100%。70份食品样品用荧光PCR和传统方法检测猪霍乱沙门菌和丙型副伤寒沙门菌,结果均为阴性。该方法从菌株的核酸提取到检测仅需1.5小时,从样品处理到检测仅需1天时间。结论建立的实时PCR检测方法快速、灵敏度高、特异性强,可用于食品及食物中毒标本的猪霍乱沙门菌检测以及沙门菌属C群的鉴别诊断,保障食品安全。
- 林一曼石晓路朱玉梅邱亚群李迎慧吕东月扈庆华
- 关键词：实时荧光PCR猪霍乱沙门菌丙型副伤寒沙门菌
- 实时荧光PCR检测军团菌研究进展被引量：5
- 2010年
- 实时荧光定量PCR(polymerase chain reaction,聚合酶链反应)能对目标基因进行定性分析,同时也可以对其起始浓度进行定量,且有可减少交叉污染和缩短样品检测时间、无需对PCR终产物进行凝胶电泳分析、高敏感性和特异性等优点,近年来被广泛用于军团菌分型检测。本文对用于军团菌实时荧光YPCR检测的目的基因和检测方法作简要综述,并对其优劣和实用价值进行探讨。
- 王娟方存磊朱庆义胡朝晖
- 关键词：聚合酶链反应
- 实时荧光定量PCR检测痰标本中军团菌属被引量：4
- 2011年
- 目的建立荧光定量PCR方法,用于检测军团菌属特异性16S rRNA基因,并探讨广州地区军团菌属感染状况。方法利用军团菌属特异性16S rRNA基因保守序列设计引物和探针,优化反应条件和反应体系,对嗜肺军团菌、非嗜肺军团菌及其他细菌进行检测,验证该方法的特异性、敏感性、重复性,对广东省中医院采集的532例肺部感染患者痰液标本进行检测。结果该方法检测军团菌属所有标准菌株均出现阳性信号,其他非军团菌属细菌检测结果均为阴性;检测灵敏度为102CFU/ml,临床检测532例肺部感染患者的痰液标本,荧光法检出军团菌阳性43例,阳性率为8.08%,16S rRNA PCR法加基因测序验证阳性率为7.71%,两者检测结果差异无统计学意义,表明其具有较好的符合性和等效性。结论 16S rRNA基因荧光定量PCR法检测患者痰液标本中军团菌属,具有快速、敏感、特异等特点,适用于临床军团菌属感染调查及快速检测。
- 黄宪章周华友唐小龙熊玉娟胡朝晖刘洋敏宣瑞红赵利伟李连青朱庆义
- 关键词：荧光定量聚合酶链反应痰液
- 荧光定量聚合酶链反应检测临床痰液标本中军团菌
- 2010年
- 目的建立快速、特异、敏感的TaqMan探针荧光定量聚合酶链反应(PCR)方法,用于检测军团菌16SRNA基因。方法军团菌标准菌株购自美国标准菌种收藏所,临床痰标本取自南方医科大学南方医院257例病原不明肺炎住院患者。提取菌种DNA及临床痰标本DNA,通过对标准菌株及临床痰液标本DNA分别进行待考核试剂与16SrRNAPCR检测及测序,验证待考核试剂方法的敏感性、特异性。结果荧光定量PCR检测灵敏度为10cfu/mL,比16SrRNA定性PCR检测灵敏度381cfu/mL高38倍。257例病原不明肺炎患者的临床痰标本细菌培养检出嗜肺军团菌血清型1型1例。待考核试剂和16SrRNAPCR方法检测阳性率分别为8.95(23/257)和8.95(23/257),其中2例不符合,1例待考核试剂阳性16SrRNAPCR方法阴性,另一例16SrRNAPCR方法阳性,待考核试剂阴性。二者总符合率为99.22(255/257),其中阳性符合率为95.65(22/23),阴性符合率为99.57(233/234)。结论待考核试剂荧光定量PCR检测军团菌标准菌种敏感性强,特异性好,用于临床痰标本军团菌检测时假阳性率为4.35,与16SrRNAPCR方法及测序比较具有较好的符合性和等效性。
- 裘宇容芮勇宇耿穗娜苏斌胡朝晖刘洋敏宣瑞红赵利伟朱庆义
- 关键词：聚合酶链反应
