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甜瓜β-氨基己糖苷酶基因家族的全基因组分析被引量：2: 2014年; β-氨基己糖苷酶(β-Hexosaminidase,β-Hex,EC 3.2.1.52)是生物界广泛存在的一种糖苷水解酶。通过全基因组信息鉴定甜瓜β-氨基己糖苷酶基因家族,初步在甜瓜全基因组数据库中发现5个β-Hex基因成员,采用Pfam等在线软件预测候选蛋白的结构域,去除2个不完整的基因,最后将筛选出的3个基因与拟南芥、青椒、番茄、可可树、谷子、葡萄和黄瓜的相应基因编码的蛋白序列进行进化分析比对、建立系统发生树和保守基序的预测分析。结果表明,进化树亚族成员中基序相同,并且在保守区序列高度相似;亚族之间基序差异也较小,保守区序列也具有较高相似性。; 赵爱奇刘嘉荣郝金凤哈斯阿古拉; 关键词：甜瓜进化分析生物信息学

甜瓜α-甘露糖苷酶基因家族的全基因组分析被引量：1: 2014年; α-甘露糖苷酶(α-mannosidases,α-Man)是生物界广泛存在的一种糖苷水解酶。通过已公布的甜瓜基因组数据库预测α-Man基因家族成员,其蛋白序列都含有完整的Glyco_hydro_47或Glyco_hydro_38保守结构域。再将筛选出的成员与拟南芥、大豆、番茄、可可树、葡萄、黄瓜、马铃薯、谷子的相应基因编码的蛋白序列进行进化分析比对,建立系统发生树和保守基序的预测分析。结果表明,甜瓜基因组中含有8个α-man基因,分为Ⅰ类和Ⅱ类,并分成5个亚族。同一类成员的蛋白结构域具有较高相似性与保守性,并且大部分成员基序的顺序和种类相同,不同类的成员之间基序差距较大。对甜瓜α-甘露糖苷酶基因家族的系统分析鉴定,有助于甜瓜α-甘露糖苷酶基因克隆和功能的进一步研究,为研究其他植物α-甘露糖苷酶基因家族的功能和进化提供参考依据。; 乌斯呼吉日嘎拉赵爱奇莘少红郝金凤哈斯阿古拉; 关键词：甜瓜进化分析生物信息学

甜瓜α-甘露糖苷酶亚家族基因的克隆及分析: 2018年; 在植物体中,α-甘露糖苷酶（α-man,α-mannosidase）是N-聚糖加工、修饰的关键酶,而N聚糖的加工对于植物生长发育是必不可少的,同时在果实成熟过程中起着重要作用。对甜瓜Ⅱ类α-甘露糖苷酶家族基因的结构特点和表达模式进行分析,为探讨α-甘露糖苷酶基因家族各成员在甜瓜不同组织器官发育中可能存在的作用奠定基础。本研究以甜瓜品种河套蜜瓜为材料,采用RT-PCR方法克隆了该家族的3个成员：Cm MAN1、Cm MAN2和Cm MAN3的全长c DNA,应用生物信息学方法对其相应蛋白质的理化性质、系统发育、保守基序进行了分析。分析研究表明,Cm MAN1、Cm MAN2和Cm MAN3的开放阅读框分别为3 063 bp、3 483 bp和3 024 bp,分别编码1 020、1 160和1 007个氨基酸,均为酸性蛋白质,且在不同物种间具有高度保守性。利用RT-q PCR方法检测了这些基因的表达模式,发现Cm MAN1在成熟甜瓜果实中表达量最高,Cm MAN2在叶、花和子房中表达量相对较高,Cm MAN3在子房中表达量较高,表明α-甘露糖苷酶各基因在甜瓜发育中可能具有不同的作用。; 郝鑫田立莉王琳博哈斯阿古拉郝金凤; 关键词：甜瓜

甜瓜α–甘露糖苷酶基因促进果实成熟功能的瞬时表达分析被引量：5: 2014年; 为了研究α–甘露糖苷酶(α-Man)基因在甜瓜果实成熟过程中的功能,应用农杆菌介导的瞬时表达技术,分别将含有甜瓜α–甘露糖苷酶基因超表达载体pPZP221-Man、两个RNAi载体pART-Man1和pART-Man2的农杆菌菌液注射至甜瓜绿熟期果实,通过观察果实成熟表型初步鉴定该基因的功能。结果表明,菌液浓度OD600=1.2时果实表型比率最高,在果实蒂部表型居多。α–甘露糖苷酶活性测定结果显示,与非注射部位相比,注射超表达载体部位的组织α–甘露糖苷酶活性较高,而注射RNAi载体的组织α–甘露糖苷酶活性较低。RT-qPCR结果显示,与非注射部位相比,注射pPZP221-Man的部位α-Man基因表达约是对照的1.2倍,而注射pART-Man1和pART-Man2的部位α-Man基因的表达均有所下降,分别是对照的47%和37%。同时对甜瓜果实成熟相关的6个候选基因在注射部位的表达情况进行了分析,结果显示,这些基因在注射超表达载体的果实部位均上调表达;而在注射两种RNAi载体的果实部位均下调表达。这些结果表明甜瓜α–甘露糖苷酶基因在果实成熟过程中具有促进成熟的作用。; 乌斯呼吉日嘎拉·达赖胡郝金凤张立全赵爱奇哈斯阿古拉; 关键词：甜瓜 RT-QPCR

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