温州市科技局科研基金(Y2005AOB)
- 作品数：3 被引量：6H指数：2
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- 相关机构：温州医学院附属第一医院温州医学院更多>>
- 发文基金：温州市科技局科研基金浙江省科技攻关计划更多>>
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- 初发鼻咽癌差异基因的染色体定位及功能分析被引量：6
- 2010年
- 目的利用基因芯片技术探索初发鼻咽癌(primary nasopharyngeal carcinoma,pNPC)与鼻咽黏膜慢性炎症组织(chronic nasopharyngitis tissue)差异基因的染色体定位和功能分析。方法用Affymetrix Gene1.0ST芯片检测pNPC与鼻咽黏膜慢性炎症组织基因表达谱差异,并利用生物信息学方法对差异基因进行染色体定位和功能分析。结果差异倍数3倍以上共有102个基因,其中表达上调25个,表达下调77个;差异基因染色体定位分析,发现5个差异基因未知其定位,其余97个差异基因在1号染色体上分布最多,包含16个,其次为3号染色体,包含13个;从差异基因功能分类看,属于酶活性基因最多,其余依次为蛋白结合、免疫、钙黏合等,以上4大类共占差异基因总数65.6%。结论 pNPC差异基因散在分布在各染色体,以1、3号染色体最多;4大类(酶活性、蛋白结合、免疫相关、钙黏合)相关基因异常在癌变过程中发挥重要作用。
- 林森黄振校李文峰张春鸿方潇碧廖志苏
- 关键词：基因表达谱染色体定位分子功能
- 初发鼻咽癌与复发鼻咽癌差异表达基因的研究
- 2009年
- 目的:通过全基因组基因芯片研究初发鼻咽癌(pNPC)与复发鼻咽癌(rNPC)之间的差异表达基因。方法:选择rNPC和pNPC组织标本,应用Affymetrix Gene1.0 ST芯片,构建表达谱,检测两者之间的差异表达基因。结果:rNPC组与pNPC组比对,发现差异基因46个,下调基因38个,上调基因8个。这些基因参与钙结合、蛋白结合、酶活性调节等过程。结论:rNPC和pNPC之间存在基因差异表达,为了解rNPC的发生机制的研究起了一定的作用。
- 黄振校李文峰杜季梅黄亚谭映霞方渭清廖志苏
- 关键词：复发鼻咽肿瘤基因芯片基因表达
- 复发鼻咽癌差异基因分析及染色体定位初步研究被引量：3
- 2010年
- 目的通过基因芯片和生物信息学来筛选复发鼻咽癌（recurrent nasopharyngeal carcinoma，rNPC）差异基因及染色体定位和功能分析。方法选择初发鼻咽癌（primary nasopharyngeal carcinonla，pNPC）和rNPC，应用Affymetrix Genel．0ST芯片筛选差异基因；应用生物信息学对差异基因进行染色体定位和功能分析。结果差异基因共44个，其中下调基因36个，上调基因8个。基因功能分类显示，下调基因大部分属于酶活性基因（10个，27．8％），其次为钙黏合基因（7个，19．4％）、蛋白结合基因（5个，13．9％），这3类基因占了下调基因总数的61．1％，另外，受体活性基因（4个，11．1％），转录因子基因和三磷酸腺苷黏合基因各2个（各占5．6％），细胞外基质黏合基因和生长因子黏合基因各1个（各占2．8％），4个基因的功能未知（11．1％）；上调基因中，3个基因的功能未知（37．5％），酶活性基因（2个，25．O％），受体活性、钙黏合、电压门压通道调控基因各1个，各占12．5％。这些差异基因分布在大多数染色体上，主要分布在1和17号染色体上。1号染色体上包含10个基因（22．7％），17号染色体包含5个基因（11．3％）。结论差异基因分布在大多数染色体上，但主要分布在1和17号染色体上，酶活性、钙黏合及蛋白结合基因这三类差异基因可能在rNPC中扮演着重要的角色，需要进一步深入研究。
- 黄振校李文峰林森黄亚杜季梅谭映霞方潇碧张春鸿方渭清廖志苏
- 关键词：鼻咽肿瘤肿瘤复发寡核苷酸序列分析染色体定位
