博士科研启动基金(SWUB2006042)
- 作品数:6 被引量:21H指数:3
- 相关作者:孙现超青玲杨水英安德荣周常勇更多>>
- 相关机构:西南大学中国农业科学院柑桔研究所西北农林科技大学更多>>
- 发文基金:博士科研启动基金重庆市自然科学基金中国博士后科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学文化科学更多>>
- 大麦条纹花叶病毒诱导大麦cDNA文库的构建被引量:4
- 2008年
- 构建病毒诱导的寄主植物cDNA文库是利用酵母双杂交方法筛选与病毒相互作用寄主因子的前提条件.该文以大麦条纹花叶病毒接种大麦,在ELISA跟踪检测的病毒复制和运动初期,采集大麦叶片,用TRIZOL法提取总RNA,利用SMART原理进行反转录PCR获得dscDNA,SfiⅠ/XhoⅠ共切后1.1%琼脂糖凝胶检测并分段回收dscDNA,分别与SfiⅠ/XhoⅠ共切的载体连接后,共同转化X-blue感受态细胞构建文库.文库的容量和质量检测结果表明:文库的容量为1.27×106,插入片段大于500 bp,集中在1.2 kb左右,符合酵母双杂交筛选文库的要求.
- 孙现超薛杨安德荣青玲杨水英
- 关键词:大麦条纹花叶病毒CDNA文库
- 大麦条纹花叶病毒中国株基因组RNA1的全长序列分析被引量:1
- 2008年
- 【目的】获得大麦条纹花叶病毒中国株(BSMV-CH)基因组RNA1的全长cDNA,进行序列分析,明确与国外报道株系间的亲缘关系和分类地位【。方法】以自然侵染BSMV-CH的大麦叶片中提取的总RNA为模板,用RT-PCR方法获得BSMV-CH RNA1的全长cDNA,克隆到载体pMD18并测序,用DNAstar软件将获得的序列与GenBank登录的BSMVRNA1序列进行对比,分析各株系序列RNA1之间的同源性,构建系统发育树分析BSMV-CH与国外株系间的亲缘关系。【结果】BSMV-CH的RNA1全长为3795bp(GenBank注册号:AY789693),基因组RNA15′端有一个甲基化的帽子结构,3′端有一个PolyA结构和一段239bp长的类似tRNA的保守序列,BSMV-CH基因组RNA1含有一个长度为3417bp的ORF,推测可编码一个1138个氨基酸的复制酶基因。BSMV-CH的基因组RNA1与国外报道其它株系核苷酸的同源性为95.4%~95.6%。复制酶基因同其它株系核苷酸和氨基酸的同源性分别为94.9%~95.2%和96.5%~96.8%,PolyA的长度比其它株系明显要长。【结论】BSMV-CH和CV42与CV17、ND18、TSE及TSG间的亲缘关系明显低于CV17、ND18、TSG和TSE间的亲缘关系;BSMV-CH与CV42表现相对较近的亲缘关系,但BSMB-CH是不同于CV42的一个BSMV新株系。
- 孙现超邱并生
- 关键词:大麦条纹花叶病毒同源性亲缘关系
- 柑橘碎叶病毒研究进展被引量:8
- 2009年
- 起源于我国的柑橘碎叶病是严重危害柑橘的一种重要柑橘病毒病,国内外关于柑橘碎叶病毒的研究对于控制该病害起到了重要的作用。概述了国内外关于柑橘碎叶病毒的生物学、分子生物学、病毒的株系和控制方面的研究进展,尤其是对近些年用分子生物学方法研究病毒的基因组和株系序列差异方面的情况作了详细的介绍。并对柑橘碎叶病毒研究仍未解决的问题和进一步深入研究的内容进行了分析探讨。
- 孙现超周常勇青玲杨水英
- 关键词:柑橘碎叶病毒生物学分子生物学株系
- 温州蜜柑萎缩病毒大外壳蛋白基因克隆分析
- 2010年
- 利用RT-PCR技术从感染温州蜜柑萎缩病毒的叶片中扩增出SDV大外壳蛋白(Large coat protein,CPL),将CPL克隆到pGEM-T载体后进行测序分析。DNA序列分析表明,SDV FJ的CPL基因cDNA序列全长为1329bp,编码443个氨基酸。与同属其他病毒序列对比分析结果显示,所得序列与日本报道的SDV S-58株系核苷酸和氨基酸同源性最高,分别为98.1%和98.6%。核苷酸序列与S-58相比25处发生了替换突变,其中T和C之间的替换频率最高,占绝对优势。
- 孙现超赵刚周常勇青玲
- 关键词:克隆
- 大麦条纹花叶病毒北京分离物的鉴定被引量:8
- 2007年
- 采集北京田间的大麦感病叶片,室内分离病原,血清学检测能够与BSMV新疆株抗血清反应,室内汁液摩擦接种可侵染大麦、小麦、本明烟和苋色藜,能够种子传毒,电镜观察病毒粒子为杆状,同时,国内首次利用RT-PCR扩增出597bp的BSMV外壳蛋白基因.根据以上结果确定分离到的病毒为大麦条纹花叶病毒,其寄主范围和种子带毒率与新疆株系有差别,可能属于不同株系.
- 孙现超安德荣青玲杨水英
- 关键词:大麦条纹花叶病毒株系RT-PCR
- 西南大学学生对重庆柑橘非疫区认识程度调查被引量:1
- 2010年
- 针对重庆市政府对柑橘非疫区的宣传效果,了解西南大学(以下简称"我校")学生对柑橘非疫区了解程度,为柑橘非疫区建设采取措施提供初步依据和建设性意见,并在调查的同时做进一步宣传。采用问卷调查,经统计分析,得出在我校被调查的571名学生中,只有21.37%的人曾听说过柑橘非疫区,而听说过的人当中有55.83%的同学认为政府对柑橘非疫区的宣传力度不够,但大部分表示如果条件允许愿意加入柑橘非疫区的宣传中。调查显示我校学生对柑橘非疫区了解甚少,政府需采取措施加大对大学生的宣传力度,促进重庆柑橘非疫区的建设。
- 孙现超梁丽莎李靖梅代园凤曾敏刘怀
- 关键词:大学生