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多重耐药临床菌株中整合子结构的检测与分析被引量：26: 2007年; 目的研究广州暨南大学附属第一医院2004年部分临床菌株样本的整合子及其基因盒的分布特性。方法多重PCR检测与细菌耐药关系密切的1、2、3类整合酶基因,进一步对阳性样本可变区的基因盒序列鉴定分析。结果随机抽取109株临床菌株,整合酶阳性检出率为97.2%(106/109),其中1类整合酶阳性菌100株(91.7%),2类整合酶阳性菌1株(0.92%),此外有5株(4.6%)同时检出1、2类整合酶,没有检测到3类整合酶;基因盒鉴定结果显示,插入基因盒以dfrA(甲氧苄氨嘧啶耐药相关)和aadA(氨基糖苷类耐药相关)基因家族为主,也在少数菌株中发现了aacA4、cmlA1、catB3以及sat1基因盒。其中又以dfrA12、orfF和aadA2组合最为常见,耐药基因盒PCR扩增片段为1913bp(64.6%);此外,还发现了同时存在两种整合子结构的菌株。结论整合子普遍存在于临床菌株中,可通过基因水平转移在不同菌属间传播,提示各医药单位必须加强耐药监测及合理选择抗菌药物,以减少多重耐药细菌的发生和发展。; 石磊陈洵肖增璜; 关键词：整合子整合酶细菌耐药临床分离株

细菌耐药整合子intI分类的多重PCR方法的建立及应用被引量：15: 2005年; 目的建立快速筛选细菌耐药整合子的分类方法,并对21株来自临床的菌株进行整合子筛选和分类。方法根据G enB ank/EM BL内的第一、第二和第三类的整合酶序列,通过软件C lustalW的多重比对分析设计出各类整合子的特异性引物,用对照菌株建立多重PCR方法并对21株临床菌株进行PCR扩增,通过其PCR扩增产物片段大小的不同进行整合子分类。结果对照菌株实验结果显示,21株临床分离菌株中,15株在565bp处有扩增片段,即为含有第一类整合酶基因;4株在403bp处有扩增片段,即含有第二类整合酶基因;1株在565bp和403bp处均有扩增片段,提示其同时含有第一、二类整合酶基因;1株没有得到任何扩增片段,即不含有这三类整合酶基因;在被测菌株中未发现第三类整合酶基因的阳性菌株。结论本文报道的筛选细菌耐药整合酶基因分类的多重PCR方法效果良好,具有可行性,为更加全面细致研究整合子类型以及整合子介导的细菌耐药机制提供了一种简单易行、快捷有效的方法。; 冯洁石磊肖增璜李琳陈洵苏健裕李心晖郑美萍邱春嫦付强; 关键词：多重PCR 整合子整合酶基因

PCR技术在金黄色葡萄球菌中的研究进展被引量：11: 2008年; 金黄色葡萄球菌是造成人类食物中毒的常见致病菌之一,对其进行检测与鉴定显得尤为重要。随着PCR技术的发展,金葡菌也得以深入研究。本文主要就应用于金黄色葡萄球菌的PCR技术进行简要综述。; 张凤笑石磊; 关键词：金黄色葡萄球菌 PCR技术

分离自环境与临床患者耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的基因分型被引量：10: 2007年; 目的:对分离自环境与临床患者的6株MRSA通过多种方法进行基因分型。方法:应用多重PCR方法检测该6株金葡菌是否MRSA,然后通过SCCmec typing,MLST,spaA typing,coa typing,AP-PCR,RAPD和ERIC-PCR等多种方法进行基因分型。结果:6株金葡菌均为MRSA,均携带Ⅲ型SCCmec,序列型为ST239,spaA型为GKAOMQ,coa型为HI-JKL,AP-PCR,RAPD和ERIC-PCR的指纹图谱均显示其带型一致,来源于同一克隆系,病原上具有高度同源性。结论:MRSA可能通过环境与患者之间传播而引起感染,并且如果该克隆的MRSA携带上毒素基因,则可能爆发非常严重和危险的院内感染。; 徐振波徐小平梁浩晖严冰江鹏飞石磊; 关键词：MRSA 基因分型 SCCMEC

大肠埃希菌中新的耐药基因盒aadA23的变异被引量：2: 2005年; 目的基于整合子-细菌耐药系统在细菌耐药机制中的重要作用,对成人腹泻患者的大肠埃希菌Ⅰ类整合子阳性菌株携带的耐药基因盒的基因特征进行分析。方法应用聚合酶链反应(PCR)检测Ⅰ类整合酶基因intI阳性菌株并对其整合的耐药基因进行测序及用生物信息软件对序列进行分析。结果5株Ⅰ类整合酶基因阳性菌株的耐药基因盒PCR扩增得到1009 bp的产物。序列分析结果表明,1009 bp序列含有780 bp的开放阅读框,与已知的aadA23和aadA21分别有99.6%和99.5%的相似性,与aadA5只有66.4%相似,为对氨基糖苷类抗菌药物壮观霉素、链霉素产生耐药的基因盒,建议命名为aadA23b。结论随着选择环境不同,整合子整合的基因盒会发生变异,提示我们要用分子生物学的手段从基因水平分析耐药基因的遗传与变异。; 苏健裕石磊杨连生陈洵张婷寇娅丽; 关键词：大肠埃希菌整合子类耐药基因盒

铜绿假单胞菌基因型与生物被膜形成能力的分析被引量：2: 2006年; 通过改良的组织平板培养法及ERIC-PCR方法对48株PA生物被膜的形成进行定量分析并绘制其指纹图谱。结果发现48株PA菌株生物被膜形成能力不同,且在17%相似水平上分为A、B、C、D、E五个基因型,其中生物被膜形成能力较弱的菌株大多属于前三个基因型,而D和E基因型则包含了大部分生物被膜形成能力较强的菌株,这表明不同生物被膜形成能力的PA在5个基因型中的分布并非随机的,菌株生物被膜形成能力和基因型之间具有一定的相关性。; 石磊寇娅丽; 关键词：铜绿假单胞菌生物被膜基因型

致病菌耐药因子分布及特征分析被引量：1: 2006年; 目的对临床菌株中的整合子分布及其携带耐药基因盒的结构特征进行分析。方法应用多重PCR方法检测55株临床菌株中的3类整合酶基因intI,并对intI阳性菌株耐药基因盒进行测序及序列分析。结果55株临床菌株均为第1类整合酶基因阳性(100%)。耐药基因盒特异PCR扩增发现,27株革兰阳性菌株和22株革兰阴性菌株均得到1 913 bp的扩增产物,携带基因盒为dhfro、rfF和aadA 2;6株革兰阴性菌得到1 664 bp的产物,携带基因盒为aadA 5和dfr 17。aadA 2和aadA 5均为编码对氨基糖苷类抗生素产生耐药的基因盒,dhfr和dfr 17均为编码对磺胺类药物甲氧苄氨嘧啶产生耐药的基因盒;orfF为未知功能的开放阅读框。结论临床致病革兰阳性菌和革兰阴性菌株均广泛存在着整合子结构,应加强对耐药基因在细菌种属间水平转移的监测工作。; 苏健裕石磊杨连生肖增璜邱春嫦付强郑美萍冯洁; 关键词：整合子整合酶耐药基因盒

多重PCR筛选临床细菌耐药整合子基因被引量：10: 2005年; 目的:建立多重PCR方法并对临床菌株进行扩增及整合子分类。方法:采用多重PCR对21株来自临床的耐药菌株进行了第一、二和三类整合酶基因(intI)筛选。结果:16株携带第一类整合酶基因;1株携带第一和第二类整合酶基因;2株含第二类整合酶基因;1株含第三类整合酶基因;1株不含第一、二和三类整合酶基因。结论:筛选细菌耐药整合子基因分类的多重PCR方法简便可靠;整合子广泛存在于临床耐药细菌中。; 肖增璜石磊邱春嫦付强苏健裕冯洁陈洵李琳; 关键词：整合子整合酶基因耐药菌株合子细菌 PCR方法

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广州市科技计划项目(2004J1-C0161)