广东省科技攻关计划(2003A308401) 作品数:9 被引量:81 H指数:5 相关作者: 丁彦青 廖秋林 赵亮 陈晓东 梁莉 更多>> 相关机构: 南方医科大学 广州军区广州总医院 南京军区福州总医院 更多>> 发文基金: 广东省科技攻关计划 国家自然科学基金 国家重点基础研究发展计划 更多>> 相关领域: 医药卫生 更多>>
鼻咽癌血清比较蛋白质组学研究 被引量:23 2008年 目的采用双向电泳-质谱技术优化肿瘤抗原筛选方法,筛选鼻咽癌肿瘤抗原。方法鼻咽癌转移组、鼻咽癌未转移组和正常对照组血清先采用高丰度蛋白去除、脱盐预处理等以优化双向电泳,图像分析3组血清图谱寻找差异蛋白质点,基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱对差异蛋白质点进行鉴定。结果通过调整、优化各个阶段的实验条件,实验结果比较稳定,重复性也比较好,分辨率得到一定的提高。图谱比较所得29个差异蛋白质点,成功鉴定了23种蛋白质。与正常组比较,转铁蛋白、锌指蛋白544、甲状腺激素结合蛋白、NM23-H1蛋白和FAD合成酶在两组鼻咽癌患者中低表达,12-脂氧合酶、血清淀粉样蛋白A1前体、细胞色素P450、sICAM-1、组织蛋白酶G和组蛋白赖氨酸特异性脱甲基酶1等在两组鼻咽癌中均高表达,其中12-脂氧合酶、sICAM-1、组织蛋白酶G和组蛋白赖氨酸特异性脱甲基酶1在鼻咽癌转移组中比未转移组中表达增高,而热休克蛋白70则只在鼻咽癌转移组表达。结论双向电泳-质谱技术可发现鼻咽癌发生发展过程中血清蛋白表达谱质或量的变化,从而为鼻咽癌的早期诊断和治疗奠定基础。 廖秋林 陈晓东 赵亮 丁彦青关键词:鼻咽肿瘤 血清蛋白质组学 热休克蛋白70 比较蛋白质组学在肿瘤研究中的应用 被引量:2 2006年 随着人类基因组草图的完成,从基因水平向蛋白质水平的深化已成为生命科学研究的迫切需要和新任务。蛋白质组学的建立为研究蛋白质水平的生命活动提供了新的有效的研究手段,而比较蛋白质组学研究则是该领域的前沿方向之一。从蛋白质整体水平上研究肿瘤发生与转移,寻找与肿瘤发生及转移相关的新蛋白质、肿瘤特异性的标志物及肿瘤药物治疗的靶标,对肿瘤的诊治将起到重要作用。 赵亮 丁彦青关键词:肿瘤转移 肿瘤标记 生物学 蛋白质组 环氧化酶2基因异常表达与大肠癌转移的关系 被引量:10 2006年 目的研究环氧化酶2在人大肠癌细胞系及大肠癌组织中的异常表达与意义。方法培养不同转移能力的人大肠癌细胞系SW480和SW620细胞,收集50例大肠癌石蜡组织,50例淋巴结转移性大肠癌石蜡组织;分别用免疫组织化学、Real-timePCR的方法研究环氧化酶2在不同转移能力人大肠癌细胞系及原发人大肠癌组织和大肠淋巴结转移组织中的表达。结果环氧化酶2蛋白在SW480和SW620细胞株中均阳性表达;环氧化酶2mRNA在SW620比SW480细胞中表达增高,表达量的平均倍比关系为2.268。环氧化酶2蛋白在淋巴结转移癌组的异常表达高于原发大肠癌石蜡组织,相关性具有统计学意义(P<0.05)。结论环氧化酶2异常表达可能与大肠癌淋巴结转移相关。 李祖国 刘腾飞 谢卫兵 周军 余力 丁彦青关键词:环氧化酶2 大肠癌 大肠癌组织中annexinⅠ mRNA及蛋白的表达和意义 被引量:1 2007年 目的探讨大肠癌组织中annexinⅠ(AnxⅠ)的表达及意义。方法应用原位杂交和免疫组化方法,从mRNA及蛋白两个水平上检测95例大肠癌及35例正常大肠黏膜组织AnxⅠ的表达情况。结果大肠癌组AnxⅠmRNA表达较正常组下调,而大肠癌组AnxⅠ蛋白表达较正常组上调,两组差异极显著(P<0.01)。在mRNA水平,表达与肿瘤分化程度呈正相关(P<0.05),与有无淋巴结转移和组织学类型无关。在蛋白水平,表达与淋巴结转移呈正相关(P<0.05),与组织学类型和分化程度无关。原发癌与淋巴结转移癌两个水平表达差异均不显著(P>0.05)。结论AnxⅠ与大肠癌发生发展和转移密切相关,可作为反映大肠癌生物学行为和判断预后的重要指征。 曲利娟 梁莉 丁彦青关键词:大肠癌 MRNA 血清蛋白质组学技术及研究进展 被引量:26 2008年 In recent years,great progress has been made in the theory and technology of proteomics.As embranchment of proteomics,serum proteomics has been payed more and more attention also.The advanced techniques have been applied in serum proteomics research,which promote the development of the methodology.A great advance has been made in serum proteomics research for seeking associated tumor markers,pharmacy and some non-cancer diseases. 廖秋林 陈晓东 丁彦青关键词:蛋白质组 双向凝胶电泳 光谱分析 血清 血清蛋白质组学研究中高丰度蛋白去除方法的建立 被引量:6 2007年 目的建立血清蛋白质组学研究中高丰度蛋白的去除方法并评价其去除效果。方法应用Sigma公司2006年最新推出的血清白蛋白和IgG去除试剂盒(ProteoPrep Immunoaffinity Albumin and IgG Depletion Kit)去除血清中高丰度的白蛋白和IgG等,再用双向凝胶电泳(2-DE)分析去除的效果。结果本实验建立的血清中高丰度蛋白的去除方法,约95%的白蛋白和IgG能够被去除,2-DE图谱中蛋白质点更加清楚,部分低丰度蛋白得以显现。结论成功建立血清中高丰度蛋白的去除方法,可为今后的血清蛋白质组学研究奠定基础。 廖秋林 丁彦青 赵亮关键词:血清蛋白质组学 双向凝胶电泳 高丰度蛋白 白蛋白 大肠癌组织中AnnexinⅠ蛋白的表达及意义 被引量:1 2006年 目的探讨AnnexinⅠ(AnxⅠ)蛋白在大肠癌组织中的表达及其与大肠癌发生、发展和转移的关系。方法应用SP免疫组化法检测95例大肠癌及35例正常大肠黏膜组织中AnxⅠ蛋白的表达情况。结果正常组AnxⅠ蛋白不表达,大肠癌无淋巴结转移组和淋巴结转移组AnxⅠ蛋白表达率分别为28·6%(10/35)和53·3%(32/60),三组间表达差异具有显著性(P<0·01);其中,转移组表达率高于无转移组(P<0·05),无转移组表达率高于正常组(P<0·01)。其表达与淋巴结转移呈正相关(P<0·05),但与组织学分型及病理分级无关(P>0·05)。大肠癌转移组淋巴结转移癌AnxⅠ蛋白表达率(42·9%,15/35)较原发癌(51·4%,18/35)低,但二者差异无显著性(P>0·05)。结论AnxⅠ蛋白表达上调与大肠癌发生发展和转移密切相关,可作为反映大肠癌生物学行为和判断预后的重要指征。 曲利娟 梁莉 丁彦青关键词:结直肠肿瘤 肿瘤转移 人大肠癌不同转移潜能细胞株SW620及SW480的差异蛋白质组分析 被引量:9 2005年 目的分析比较人大肠癌不同转移潜能细胞株的差异表达蛋白质图谱,筛选并探讨肿瘤转移相关蛋白与大肠癌发生发展转移的关系.方法利用双向凝胶电泳(2-DE)和基质辅助激光解析离子化-飞行时间-质谱技术,分析高低转移性细胞株SW620和SW480蛋白质图谱的差异表达,查询数据库筛选大肠癌转移相关蛋白质.结果MalenieⅢ软件分析3次相同条件下的2-DE图谱,结果显示重复性、匹配性较好.SW620检测到(1316±62)个蛋白点,平均匹配率82%;SW480检测到(1332±74)个蛋白点,平均匹配率80%;蛋白点分布以PI 4~7、相对分子质量20 000~70 000范围内最多.两种细胞株25个差异蛋白点(SW620 14个、SW480 11个)胰酶胶内酶解、质谱分析获得23张肽质量指纹谱;数据库查询结果高度匹配已知蛋白质3个,初步匹配已知蛋白质或片段14个.在这些差异表达的蛋白质中,部分与基因转录、细胞周期、信号转导、细胞凋亡有关,可能参与大肠癌的分化、增殖、侵袭、黏附和转移等多种生物学行为.结论人大肠癌不同转移潜能细胞株SW620和SW480的2-DE蛋白质图谱具有明显的差异表达,提示大肠癌转移过程的发生是多种蛋白质功能共同作用的结果. 曲利娟 丁彦青 梁莉关键词:大肠肿瘤 SW480 SW620 蛋白质组 肽质量指纹谱 血清双向凝胶电泳技术的建立和优化 被引量:5 2008年 目的建立起较好及较稳定的的血清双向凝胶电泳技术。方法对血清双向凝胶电泳中血清标本的收集、保存,血清高丰度蛋白的去除,电泳条件,上样量,IPG干胶条的选择及缓冲液的配制等多种条件和技术方法进行调整和优化。结果建立了较稳定和较好重复性的血清双向凝胶电泳技术,分辨率得到一定的提高,有效分离的蛋白质点明显增多,许多低丰度蛋白被分离出来。结论通过不断的摸索和验证,可以建立起较好的血清双向凝胶电泳技术,为进一步的分析、鉴定和寻找与疾病相关的血清蛋白质奠定一定基础。 廖秋林 陈晓东 赵亮 丁彦青关键词:血清蛋白质组学 双向凝胶电泳 白蛋白 IGG