国家科技重大专项(2002BA711A09)
- 作品数:3 被引量:48H指数:3
- 相关作者:赵辉曾长青李俊于军李启寨更多>>
- 相关机构:中国科学院更多>>
- 发文基金:国家科技重大专项中国科学院知识创新工程重要方向项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 高通量飞行时间质谱基因分型方法的研究被引量:21
- 2005年
- 为了考察飞行时间质谱基因分型方法(MALDI-TOF)的位点分型成功率和分型结果质量的关系,分析了96个SNPs位点的近10000个基因分型数据(用MALDI-TOF“4重”实验方法检测).结果显示,位点分型成功率和分型结果的质量显著正相关.分型成功率低于82%的SNP位点,其高质量结果占的比例开始逐渐降低.提示82%的分型成功率可以作为衡量分型结果质量的数据点.为了进一步提高通量并降低成本,在MALDI-TOF“4重”实验方法的基础上,发展了两种“准8重”实验方法.用新的实验方法检测了95个样本的32个SNPs位点.结果显示“混合准8重”实验方法与“4重”实验方法相比无显著差异,而“复点准8重”的结果差于“4重”分型方法.
- 赵辉王威张清润高扬赵洪斌周珺林伟曾长青
- 关键词:飞行时间质谱基因分型
- 应用FP-TDI技术进行高通量单核苷酸多态分型被引量:4
- 2004年
- FP TDI (fluorescencepolarizationtemplate directeddye terminatorincorporation)是一种操作简单、实验投入少、适于高通量反应的单核苷酸多态等位基因分型技术 .使用两种评价分型图像质量的数值指标 ,可以有效地对分型结果进行评价 ,使该技术得到了改进 .在此基础上优化了实验条件 ,并应用该技术 ,对人类基因组 3号染色体上随机选取的 337个单核苷酸多态性位点进行了高通量分型 ,反应的一次成功率达到 5 9 94 % .
- 罗春清邓立彬周珺林伟曾长青
- 关键词:基因分型单核苷酸多态功能基因组学SNP