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国家重点基础研究发展计划(2011CB100700)

作品数:20 被引量:117H指数:5
相关作者:戴小枫陈捷胤张国良柳少燕李蕾更多>>
相关机构:中国农业科学院作物科学研究所淮阴工学院中国农业科学院农产品加工研究所更多>>
发文基金:国家重点基础研究发展计划国家自然科学基金国家重点实验室开放基金更多>>
相关领域:农业科学生物学化学工程更多>>

文献类型

  • 20篇期刊文章
  • 3篇会议论文

领域

  • 20篇农业科学
  • 5篇生物学
  • 1篇化学工程
  • 1篇医药卫生

主题

  • 7篇蛋白
  • 5篇水稻
  • 5篇基因
  • 4篇免疫
  • 3篇轮枝
  • 3篇轮枝菌
  • 3篇酵母
  • 3篇酵母双杂交
  • 3篇病原
  • 3篇病原菌
  • 3篇大丽轮枝菌
  • 2篇蛋白筛选
  • 2篇蛋白质
  • 2篇育种
  • 2篇植物免疫
  • 2篇水化合物
  • 2篇碳水化合物
  • 2篇突变体
  • 2篇酶类
  • 2篇免疫反应

机构

  • 5篇中国农业科学...
  • 4篇淮阴工学院
  • 4篇中国农业科学...
  • 3篇中国科学院上...
  • 3篇中国农业科学...
  • 1篇福建农林大学
  • 1篇南京林业大学
  • 1篇中国科学院
  • 1篇云南农业大学
  • 1篇四川省农业科...
  • 1篇江苏天丰种业...

作者

  • 5篇陈捷胤
  • 5篇戴小枫
  • 3篇李蕾
  • 3篇柳少燕
  • 3篇何祖华
  • 3篇张国良
  • 2篇陈华民
  • 2篇邱德文
  • 2篇田芳
  • 2篇虞玲锦
  • 2篇于清
  • 2篇何晨阳
  • 1篇田李
  • 1篇钱韦
  • 1篇刘莹
  • 1篇鲁国东
  • 1篇汪佳妮
  • 1篇陈相永
  • 1篇王新艳
  • 1篇谢寅峰

传媒

  • 4篇Journa...
  • 3篇中国农业科学
  • 2篇江苏农业科学
  • 2篇植物生理学报
  • 1篇植物保护学报
  • 1篇微生物学报
  • 1篇植物病理学报
  • 1篇中国基础科学
  • 1篇淮阴工学院学...
  • 1篇Journa...
  • 1篇Molecu...
  • 1篇基因组学与应...
  • 1篇中国科学:生...
  • 1篇中国植物保护...

年份

  • 1篇2018
  • 2篇2016
  • 3篇2015
  • 2篇2014
  • 7篇2013
  • 5篇2012
  • 3篇2011
20 条 记 录,以下是 1-10
排序方式:
棉花病原菌碳水化合物酶类注释和比较分析被引量:2
2013年
【目的】预测并分析可侵染棉花的病原菌基因组编码的碳水化合物酶类CAZymes,以内生菌绿色木霉和枯草芽孢杆菌为对照,通过碳水化合物酶类家族比较分析确定与病原菌侵染相关的植物细胞壁降解酶类,为细胞壁降解酶参与病原菌侵染机理的研究提供理论依据。【方法】利用已公布的可侵染棉花的7个病原菌全基因组编码蛋白序列,以内生菌绿色木霉为参照,应用BLASTP方法确定共有的核心基因集并构建系统发育树;通过BLASTP方法对基因组编码蛋白的CAZymes进行注释,统计并比较分析病原菌与内生菌CAZymes各个家族基因的差异,获得病原菌相对于内生菌发生扩增的植物细胞壁降解酶类家族;应用MEGA 4.0构建CAZymes亚家族的系统发育树,确定与致病性或者侵染特性相关的CAZymes。【结果】根据共有核心基因集构建了棉花病原菌的系统发育树,初步明确了侵染棉花根部和地上组织病原菌在进化上的差异。CAZymes注释和比较分析表明,病原菌编码的果胶、纤维素、淀粉和木聚糖降解酶类的数量相对于内生菌均有扩增。进一步分析发现,6个果胶降解酶类亚家族(GH35、GH78、GH105、PL1、PL3和PL4)、2个纤维素降解酶类亚家族(GH61和CBM1)、淀粉降解酶类CBM20亚家族和木聚糖降解酶类GH43亚家族相对于内生菌发生了显著扩增;同时,系统发育树分析还发现病原菌PL1和PL3亚家族衍生出了与致病性或者侵染方式相关的基因。【结论】本研究通过7个棉花病原菌与2个内生菌CAZymes的比较分析,发现了棉花病原菌基因组中10个与植物细胞壁降解相关的CAZymes亚家族(GH35、GH43、GH61、GH78、GH105、PL1、PL3、PL4、CBM1和CBM20)显著扩增,它们参与了植物细胞壁组分果胶、纤维素、淀粉和木聚糖的降解作用,初步明确了与棉花病原菌侵染相关的植物细胞壁降解酶类家族及其与病原菌侵染特性的关系。
陈捷胤柳少燕李蕾戴小枫
水稻免疫机制研究进展被引量:3
2013年
植物先天免疫主要由两部分组成:一类是通过细胞膜上的病原菌分子模式识别受体识别病原微生物表面存在的分子特征激发的免疫反应(PTI);另一类是专化性的抗病R蛋白识别病原微生物的效应蛋白,从而激发下游的病原菌小种特异性的防卫反应过程(ETI).随着水稻抗病信号途径中越来越多的抗病基因以及关键的调控基因被克隆和功能鉴定,同时多种水稻病原菌效应蛋白的发现,水稻抗病机理的研究也越来越深入.本文阐述了水稻的PTI,ETI及其下游参与免疫信号转导的关键性组分,从而形成一个初步的水稻免疫调控网络.
高明君何祖华
关键词:水稻抗病性
Distribution,Frequency and Variation of Stripe Rust Resistance Loci Yr10,Lr34/Yr18 and Yr36 in Chinese Wheat Cultivars被引量:10
2012年
Wheat stripe rust is a devastating disease in many regions of the world.In wheat,49 resistance genes for stripe rust have been officially documented,but only three genes are cloned,including the race-specific resistance Yr10 candidate gene(Yr10_(CG)) and slow-rusting genes Lr34/Yr18(hereafter designated as Yr18) and Yr36.In this study,we developed gene-specific markers for these genes and used them to screen a collection of 659 wheat accessions,including 485 Chinese cultivars.Thirteen percent and eleven percent of the tested Chinese cultivars were positive for the markers for Yr10_(CG) and Yr18_(RH)(the resistant haplotype of Yr18),respectively,but none were positive for the Yr36 marker.Since there is a limited use of the Yr10 gene in Chinese wheat,the relatively high frequency of wheat varieties with the Yr10_(CG) marker suggests that the identity of the Yr10 gene is unknown.With regards to the Yr18 gene,29%of the tested cultivars that are used in the Middle and Lower Yangtze Valleys' winter wheat zone were positive for Yr18_(RH) markers.A non-functional allele of Yr18_(RH) was identified in 'Mingxian 169',a commonly used susceptible check for studying stripe rust.The data presented here will provide useful information for marker-assisted selection for wheat stripe rust resistance.
Cuiling YuanHui JiangHonggang WangKun LiHeng TangXianbin LiDaolin Fu
关键词:分子标记辅助选择抗条锈性小麦条锈病抗性基因
鞭毛素蛋白FliCaaa诱导水稻免疫反应的活性测定
2015年
为阐明燕麦嗜酸菌(Acidovorax avenae subsp.avenae,Aaa)鞭毛素蛋白Fli Caaa及其结构域对水稻免疫反应的诱导作用,通过分子生物学和生物信息学方法,对Aaa菌株IPN1的鞭毛素进行基因克隆及其序列分析;在大肠杆菌中对该基因全长、N端和C端片段进行了原核表达,纯化了Fli Caaa蛋白及其截短肽段;采用水稻叶片浸润法测定了表达蛋白对水稻免疫反应的诱导活性。结果表明,通过特异性引物的PCR扩增,获得1 479 bp的鞭毛素基因fli Caaa,其编码产物含有492个氨基酸,分子量为49.4 k D,具有flagellin-N和-C两个保守结构域;原核诱导表达获得了Fli Caaa、Fli Caaa-N和Fli Caaa-C可溶性融合蛋白;3种纯化蛋白均能诱导水稻细胞死亡和H2O2产生等免疫反应,但诱导能力略有差异。
刘莹陈华民于清田芳鲁国东何晨阳
关键词:原核表达纯化免疫反应
拮抗菌与病原菌碳水化合物酶类比较分析被引量:11
2013年
拮抗菌通过分泌细胞壁降解酶降解病原菌细胞壁组分是其重要的拮抗方式。本研究以2个拮抗菌(绿色木霉和枯草芽孢杆菌)和7个植物病原菌为研究对象,对碳水化合物酶类CAZymes(Carbohydrate-active enzymes)进行了注释和比较分析,明确了拮抗菌相对于病原菌发生扩增的细胞壁降解酶亚家族;利用ClustalX2.0多序列比对、Mega4.0构建系统发育树和MEME软件预测保守基序的方法,分析了扩增亚家族的序列结构和进化特征。结果表明,拮抗菌中可能参与病原菌细胞壁降解酶类的亚家族CBM50、GH25和GH73发生了显著扩增,并通过序列比较和进化分析初步明确了扩增的亚家族与拮抗菌特异降解病原菌细胞壁组分之间存在关联,为拮抗菌细胞壁降解酶类亚家族CBM50、GH25和GH73参与拮抗的分子机理提供理论依据。
柳少燕陈捷胤李蕾戴小枫
关键词:拮抗菌病原菌细胞壁降解酶
泛素-26S蛋白酶体系统参与调控植物免疫研究进展被引量:4
2016年
各种植物病害严重危及全球粮食安全。植物进化出一系列防御反应机制来应对病原菌的威胁。泛素化是调控蛋白质的活性和稳定性一种重要的翻译后修饰方式。近十年来,人们越来越认识到泛素-26S蛋白酶体系统(UPS)在植物-病原菌互作中的重要调控作用。UPS在植物免疫的各个环节都发挥作用。UPS成为病原菌作用的靶标,要么抑制植物防卫反应,要么为病原菌自身服务。本文对UPS参与调控植物免疫的研究进展进行了简要的综述。
游全远何祖华
关键词:病原菌植物免疫
Suppression of edr2-mediated powdery mildew resistance, cell death and ethylene-induced senescence by mutations in ALD1 in Arabidopsis被引量:3
2011年
EDR2 在 Arabidopsis 是防卫反应和房间死亡的一个否定管理者。EDR2 的 Loss-of-function 导致提高的抵抗到粉的霉。为了在 EDR2 识别新部件,表明 transduction 小径,压制 edr2 的变化抵抗显型被屏蔽。三异种, edts5-1, edts5-2 和 edts5-3 (edr 二 suppressor 5 ) ,被识别。EDTS5 基因被基于地图的克隆识别并且以前被显示编码 aminotransferase (ALD1 ) 。因此,我们分别地重命名这三等位基因 ald1-10, ald1-11 和 ald1-12。在 ALD1 的变化压制了所有调停 edr2 的显型,包括粉的霉抵抗,规划房间死亡和导致乙烯的老朽。在 edr2 的氢过氧化物的累积被 ald1 变化也压制。防卫相关的基因的表示在 edr2 异种是起来调整的,并且在 edr2 的那些基因的起来规定在 edr2/ald1 被压制两倍异种。ald1 单身者异种显示了推迟的导致乙烯的老朽。另外, ald1 变化压制了调停 edr1 的粉的霉抵抗,但是不能压制 edr1/edr2 双异种显型。这些数据证明 ALD1 在调停 edr2 的防卫回答,和老朽起重要作用并且表明在发信号的乙烯和水杨酸酸之间的串音由 ALD1 和 EDR2 调停了。
Haozhen NieYingying WuChunpeng YaoDingzhong Tang
关键词:白粉病抗性
基因编辑技术在水稻分子育种上的应用被引量:4
2018年
介绍了先后三代基因编辑技术,即锌指核酸酶系统、类转录激活因子效应物核酸酶系统、规律成簇的间隔短回文重复序列系统;综述了基因编辑技术在水稻分子育种中的应用,以及基于CRISPR最新开发的CRISPR/Cpf1、单碱基编辑技术和无外源DNA污染的基因编辑技术;最后,对基因编辑技术将来的发展以及在水稻育种上的应用前景进行了展望。
刘浩张国良许仁良朱明超齐波高慧闫元景邢惠芳
关键词:水稻分子育种
Direct Modulation of Protein Level in Arabidopsis
2013年
Dear Editor, The general way to probe functions of a protein in vivo is to perturb its level and then observe subsequent phenotypic changes.In plants,modulation of protein level is mainly carried out at DNA or RNA level,which is indirect and thus affected by stability of the target protein.Thus,experimental approaches to perturb protein level directly are needed,but still limited in plants.In mammalian cells,a technique to modulate protein level directly has been developed.Engineered destabilizing domain (DD) of the human FKBP12 protein can confer instability to other proteins when fused to it.A small synthetic molecule ligand Shield 1 (Shld1) can bind DD and shield it from degradation.The level of DD fused protein can be controlled by adjusting Shld1 concentration (Banaszynski et a1.,2006).The DD-Shld1 system was further successfully applied in several other species,such as parasites Plasmodium falciparum (Armstrong and Goldberg,2007) and Toxoplasma gondii (Herm-G(o)tz et al.,2007).
Lei SuAining LiHuali LiChengcai ChuJin-Long Qiu
关键词:蛋白水平直接调制蛋白质水平哺乳动物细胞调节蛋白
Arabidopsis Acetyl-Amido Synthetase GH3.5 Involvement in Camalexin Biosynthesis through Conjugation of Indole-3-Carboxylic Acid and Cysteine and Upregulation of Camalexin Biosynthesis Genes被引量:2
2012年
Camalexin (3-thiazol-2 -yl-indole) is the major phytoalexin found in Arabidopsis thaliana. Several key intermediates and corresponding enzymes have been identified in camalexin biosynthesis through mutant screening and biochemical experiments. Camalexin is formed when indole-3-acetonitrile (IAN) is catalyzed by the cytochrome P450 monooxygenase CYP71A13. Here, we demonstrate that the Ara- bidopsis GH3.5 protein, a multifunctional acetyl-amido synthetase, is involved in camalexin biosynthesis via conjugating indole-3-carboxylic acid (ICA) and cysteine (Cys) and regulating camalexin biosynthesis genes. Camalexin levels were increased in the activation-tagged mutant gh3.5-1D in both Col-0 and cyp71A13-2 mutant backgrounds after pathogen infection. The recombinant GH3.5 protein catalyzed the conjugation of ICA and Cys to form a possible intermediate indole-3-acyl-cysteinate (ICA(Cys)) in vitro. In support of the in vitro reaction, feeding with ICA and Cys increased camalexin levels in Col-0 and gh3.5-1D. Dihydrocamalexic acid (DHCA), the precursor of camalexin and the substrate for PAD3, was accumulated in gh3.5-1D/pad3-1, suggesting that ICA(Cys) could be an additional precursor of DHCA for camalexin biosynthesis. Furthermore, expression of the major camalexin biosynthesis genes CYP79B2, CYP71A12, CYP71A13 and PAD3 was strongly induced in gh3.5-1D. Our study suggests that GH3.5 is involved in camalexin biosynthesis through direct catalyzation of the formation of ICA(Cys), and upregulation of the major biosynthetic pathway genes.
Mu-Yang WangXue-Ting LiuYing ChenXiao-Jing XuBiao YuShu-Qun ZhangQun LiZu-Hua He
关键词:ARABIDOPSIS
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