国家自然科学基金(31160451)
- 作品数：12 被引量：47H指数：5
- 相关作者：胡江罗玉柱刘秀张丽李少斌更多>>
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- 牦牛DGAT1基因多态性及其与乳质性状关联分析被引量：7
- 2017年
- 【目的】检测牦牛DGAT1基因多态性,评估基因突变对牦牛乳品质性状的影响,以期丰富牦牛重要经济性状的分子遗传研究基础。【方法】采用PCR-SSCP方法,检测甘南牦牛、天祝白牦牛、青海牦牛及野血牦牛DGAT1基因intron5-exon7和intron15-exon17区突变,分析基因突变对乳品质性状的影响。【结果】牦牛DGAT1基因intron5-exon7区发现c.562+32_c.562+33ins CCGCCC的插入/缺失,等位基因M、基因型MM频率最高为优势等位基因和基因型,各类群牦牛PIC<0.5属中度或低度多态;intron15-exon17区检测到c.1249-23C>T和c.1336C>T的突变,其中exon17发现的c.1336C>T突变导致编码氨基酸p.Arg447Cys转变,等位基因A频率最高为优势等位基因,甘南牦牛、天祝白牦牛和青海牦牛中基因型AA为优势基因型,野血牦牛基因型AB为优势基因型,各类群牦牛0.25
- 高小莉胡江郭淑珍石斌刚谢建鹏罗玉柱王继卿牟永娟
- 关键词：牦牛DGAT1基因多态性
- 甘南牦牛ANK1基因启动子区突变与胴体质量及肉质性状的关联分析被引量：5
- 2013年
- 试验选择721头甘南牦牛,应用PCR-SSCP技术检测ANK1基因启动子区多态性,并分析基因突变对胴体及肉质性状的影响.结果表明:甘南牦牛ANK1基因启动子区多态性丰富,检测出4处SNPs对应4种等位基因A、B、C、D,等位基因C和基因型CC频率分别为0.559 7和0.384 0,为优势等位基因及优势基因型;ANK1基因启动子区突变对各年龄甘南牦牛肉质性状影响不同,基因型CC与4岁牦牛宰后肌肉嫩度及5岁牦牛失水率显著相关(P<0.05),等位基因C与4岁甘南牦牛失水率、眼肌面积及嫩度显著(P<0.05)关联;甘南牦牛胴体及肉质性状在各基因型和等位基因间的变化趋势基本相同,即BC型个体宰后肌肉嫩度剪切力值最低而BB型最高,AA和BB型个体肌肉有较好的保持水分的能力而BC型个体最差,AA型个体眼肌面积最小,而携带等位基因C的个体肌肉嫩度剪切力值小而眼肌面积大,但肌肉失水率高.甘南牦牛ANK1基因启动子区突变可作为胴体及肉质性状的基因标记,选择BC基因型个体或等位基因C,可改善牦牛群体的宰后肌肉嫩度,增加眼肌面积,但可能使肌肉保持水分的能力下降.
- 陈海青罗玉柱胡江王继卿刘秀张丽
- 关键词：甘南牦牛多态性肉质性状
- 牦牛STAT5A和THRSP基因组织表达及其突变对乳、肉品质的影响
- 信号转导与转录激活因子5A(Signal transduction and activator of transcription 5A,STAT5A)作为调控乳蛋白表达的乳腺特异性转录因子,是产乳性能候选基因。甲状腺激素...
- 陈彦丽
- 关键词：牦牛多态性肉品质性状
- 文献传递
- 牦牛CAPN1基因intron 1多态性及其与胴体和肉质性状的关联性被引量：4
- 2016年
- 采用PCR-SSCP技术检测甘南牦牛、天祝白牦牛及大通牦牛钙蛋白酶1(CAPN1)基因单核苷酸多态性(SNPs),并分析SNPs对甘南牦牛部分胴体及肉质性状的影响。结果表明,3类群牦牛在CAPN1基因第1内含子区检测到g.100+606G>T突变,形成了AA、BB和AB 3种基因型,检测区域表现为中度多态;CAPN1基因第1内含子突变影响不同年龄段甘南牦牛肌肉嫩度、失水率和眼肌面积,AA基因型个体嫩度剪切力值较低而眼肌面积较高,其中3岁和5岁牦牛AA型个体嫩度剪切力显著低于BB或AB型(P<0.05),4岁和5岁牦牛AA型个体眼肌面积显著高于BB或AB型(P<0.05);另外6岁牦牛AA型个体失水率显著高于BB和AB型(P<0.05)。CAPN1基因g.100+606G>T突变可用为甘南牦牛此类性状潜在的遗传标记之一。
- 陈杰田知利胡江罗玉柱刘秀王继卿石红梅雷俊杰
- 关键词：甘南牦牛CAPN1基因多态性
- 牦牛脂肪型脂肪酸结合蛋白基因(A-FABP)多态性分析被引量：5
- 2012年
- 脂肪型脂肪酸结合蛋白(A-FABP)属脂肪酸结合蛋白家族(FABPs)成员,参与调节哺乳动物细胞内脂肪浓度,进而影响肌肉内脂肪含量(IMF),因此A-FABP可作为影响IMF的候选基因。本研究采用PCR-SSCP技术检测甘南牦牛、青海牦牛、天祝白牦牛(Bos grunniens)A-FABP基因部分第3内含子、第4外显子及部分3'-UTR区单核苷酸多态性(SNPs),分析检测区域分子遗传特征。结果表明,3类群牦牛引物扩增区域发现5种等位基因A-E;同普通牛A-FABP基因序列比对发现6处SNPs,其中第4外显子区存在c.4222A>G的同义突变;3'-UTR区c.*94T>A只存在于牦牛群体,是其区别于普通牛的遗传特征之一。各等位基因在群体间分布差异较大,其中天祝白牦牛只发现3种等位基因,而青海牦牛发现4种等位基因,这可能与牦牛类群的地域分布及选育程度有关。3类群牦牛A-FABP基因检测位点表现为中度多态(PIC为0.29～0.36),有效等位基因数较高,可作为潜在的牦牛肉质性状分子标记位点。
- 曹健罗玉柱胡江成述儒杨果刘秀
- 关键词：牦牛PCR-SSCPSNPS
- 牦牛STAT5A基因组织表达及其突变对乳品质性状的影响
- 2020年
- 信号转导与转录激活因子5A(signal transduction and activator of transcription 5A,STAT5A)作为调控乳蛋白表达的乳腺特异性转录因子,其基因突变影响乳品质性状。本研究应用实时荧光定量PCR(quantitative Real-time PCR,qRT-PCR)检测甘南牦牛STAT5A基因在12个组织中的相对表达量,应用聚合酶链式反应-单链构象多态性(polymerase chain reaction-single strand conformation polymorphism,PCR-SSCP)检测牦牛STAT5A基因多态性,分析基因突变对乳品质性状的影响。结果表明,STAT5A基因在甘南牦牛12个组织中均有表达,在乳腺、心脏、脾脏和肺脏高度表达且显著高于其他组织(p<0.05),在肝脏、皮下脂肪、肾脏、瘤胃、背最长肌和小肠中度表达。本研究在牦牛STAT5A基因exon 5-intron 5、exon 8-intron 8及intron9-exon 10区发现c.606G>A、c.1191+4C>T、c.1194+81T>C和c.1282-38C>T的SNPs表现为中度或低度多态。STAT5A基因突变影响部分胎次甘南牦牛乳品质性状,其中exon 5-intron 5区第3胎基因型B1B1个体及intron 9-exon 10区第2胎A3B3个体乳脂率和总固体物质百分含量均显著高于其他个体(p<0.05),第4胎intron 9-exon 10区基因型A3A3个体乳脂率也显著高于其他个体(p<0.05)。本结果为牦牛乳品质性状的分子遗传研究提供了基础数据。
- 陈彦丽蒋艳艳石斌刚赵志东王继卿刘秀李少斌胡江
- 关键词：牦牛多态性
- 牦牛CAPN3基因CDS区克隆及生物信息学分析被引量：5
- 2013年
- 根据GenBank中普通牛CAPN3基因cDNA序列,设计特异性引物,采用RT-PCR技术从牦牛总RNA中克隆获得CAPN3基因完整的CDS区及部分3′UTR序列,预测分析该基因编码蛋白的生物学信息.结果表明:牦牛CAPN3基因CDS区全长2 469bp(GenBank登入号:JX112349.1),编码822个氨基酸残基(GenBank登入号:AFP73395.1);同普通牛比对,牦牛CAPN3基因在CDS区存在10个SNPs,并导致该蛋白功能区域内3个氨基酸突变;牦牛CAPN3基因编码蛋白分子量94.58ku,理论等电点(PI)5.70,其氨基酸序列中存在较强的亲水区域,二级结构为以α-螺旋和无规卷曲为主的混合型;牦牛CAPN3基因编码氨基酸序列与普通牛、绵羊、野猪等物种间同源性较高,系统进化情况与其亲缘关系远近一致.
- 潘红梅罗玉柱胡江刘秀李少斌张丽
- 关键词：牦牛RT-PCR生物信息学
- 甘南牦牛H-FABP基因CDS区多态性及生物信息学分析被引量：14
- 2012年
- 应用PCR产物混合样本DNA池法检测甘南牦牛心脏型脂肪酸结合蛋白(H-FABP)基因CDS区多态性,并应用生物信息学方法分析甘南牦牛H-FABP蛋白质特性.结果表明:甘南牦牛H-FABP基因CDS区序列与九龙牦牛相同,而与普通牛对比在第3外显子存在*76G>A的同义突变;甘南牦牛H-FABP氨基酸序列没有明显的疏水性区域,也未形成跨膜螺旋区及信号肽,推测其主要在细胞质中发挥生物学作用;甘南牦牛H-FABP基因编码产物二级结构是以α-螺旋和β-折叠为主的mixed型;氨基酸序列与普通牛、山羊、马、人、小鼠、大鼠、鸡、草雀及绿鸭9个物种间同源性较高,与其实际亲缘关系远近一致.
- 曹健罗玉柱胡江刘秀李少斌吴应童
- 关键词：甘南牦牛H-FABP基因多态性生物信息学
- 牦牛CAPN4基因启动子区突变对胴体及肉质性状的影响被引量：2
- 2015年
- 为检测CAPN4基因在牦牛群体中的多态性,分析CAPN4基因启动子区突变对甘南牦牛胴体及肉质性状的影响,寻找与牦牛此类性状相关的分子遗传标记。采用PCR-SSCP技术检测830头甘南牦牛、大通牦牛和天祝白牦牛CAPN4基因启动子区突变并分析其多态性,运用SPSS 19.0软件中的GLM模型分析基因突变对甘南牦牛胴体及肉质性状的影响。牦牛CAPN4基因启动子区存在a.-1222G>A的单碱基突变,检测到AA、AB和BB 3种基因型。相关性分析结果表明,a.-1222G>A的突变对不同年龄甘南牦牛胴体和肉质性状有一定影响,其中4,6岁牦牛BB型个体熟肉率显著高于AA型或AB型(P<0.05);3,6岁牦牛AB型个体失水率显著高于BB型或AA型(P<0.05),而5岁牦牛BB型个体肌肉失水率显著高于AA型(P<0.05);3,5岁牦牛BB型个体的眼肌面积显著高于AA和AB型(P<0.05)。等位基因A对4,6岁牦牛熟肉率、各龄牦牛肌肉保水性和眼肌面积均存在不利影响;除5岁牦牛携带等位基因A个体的胴体重显著低于未携带者外,该突变对其他年龄段牦牛胴体重及全部牦牛个体的肌肉嫩度无显著影响。CAPN4基因启动子区a.-1222G>A突变影响不同年龄段甘南牦牛部分胴体及肉质性状,可作为甘南牦牛此类性状的遗传标记。
- 牛晓亮李彥清胡江罗玉柱郭淑珍闫伟杨树猛
- 关键词：牦牛基因多态性
