宁夏回族自治区自然科学基金(NZ13028)
- 作品数:4 被引量:50H指数:2
- 相关作者:马玉韬唐晓芬陈莉朱瑜红张成更多>>
- 相关机构:宁夏大学西北大学宁夏医科大学更多>>
- 发文基金:宁夏回族自治区自然科学基金宁夏高等学校科学技术研究项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:生物学电子电信农业科学自动化与计算机技术更多>>
- 密码子使用偏性量化方法研究综述被引量:45
- 2013年
- 在基因组学水平上研究密码子使用偏性模式、成因并分析进化过程中的选择压力在基因组学研究中有重要意义。文章概述了目前提出的密码子使用偏性的量化方法及实现原理。目前研究发现:有些量化密码子偏性的方法受高表达基因参考数据集未完全注释的限制,不同密码子位置对变异和选择的影响不同,以及不同密码子位置处GC含量和嘌呤含量的贡献不同。由此展望密码子偏性量化方法发展方向为:需要设计不需要相关参考基因集合先验知识的密码子使用偏性量化方法;考虑不同位置处背景核苷酸组成的密码子使用偏性的量化方法;同时考虑基因表达水平的密码子使用偏性量化方法。最后,归纳了目前可用的密码子使用偏性的量化工具和数据库。
- 唐晓芬陈莉马玉韬
- 关键词:同义密码子密码子使用偏性高表达基因
- 基因预测算法中阈值的傅里叶质谱分析
- 2014年
- 蛋白质编码区预测中阈值选择对预测结果的影响不容忽视。研究提出以归一化的功率谱密度作为判别DNA序列编码区和非编码区的阈值,以FIR(Finite impulse response,FIR)窄通带滤波器NPBF(Narrow pass band filter,NPBF)作为编码区预测算法核心,采用DNA序列集HMR195和ALLSEQ作为测试集,以碱基层的近似相关系数(Approximate correlation,AC)为预测准确率测度指标,对所提出方法与现有方法的预测结果做了比较。结果表明,采用新阈值得到的预测准确率最高,算法简单直观。
- 刘平马玉韬孙学宏张成杜勇
- 基于无线传感器网络的奶牛舍环境监测系统设计被引量:5
- 2016年
- 现代精细化奶牛养殖模式对奶牛场舍内环境信息获取的要求越来越高。为实时、有效获取牛舍内环境信息,笔者设计了基于无线传感器网络的牛舍环境监测系统,选用CC2530、CC2592芯片和LTM8901等传感器构建了由传感器节点、路由器节点、协调器节点和监控中心组成的环境监测系统,分析协调器节点、传感器节点的组网和入网过程。该系统运行成本低、适应性强,具有一定参考价值。
- 朱瑜红
- 关键词:无线传感器网络牛舍环境信息CC2530
- 一种基于改进通用梳状滤波器的基因预测算法
- 2014年
- 针对IIR滤波器在设计和使用中存在系统稳定性和群延迟造成输出滞后的问题,以通用梳状滤波器为例提出了适用于IIR NPBF的改进预测算法。在HMR195序列集上的预测结果表明,所提算法能有效提高编码区预测准确率。
- 贾艳玲马玉韬刘思远唐晓芬
- 关键词:群延迟