博士科研启动基金(X060051)
- 作品数：7 被引量：16H指数：3
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- 贵州4个山羊群体mtDNACytb基因多态性研究被引量：5
- 2010年
- 为了从核酸水平上分析贵州4个山羊群体线粒体DNA细胞色素b基因（mtDNACytb）的遗传多样性及亲缘关系,对贵州白山羊、贵州黑山羊、贵州麻羊及贵州小香羊4个山羊群体,共计55个个体mtDNACytb基因片段进行测序分析和比较。结果表明：55条山羊的Cytb基因序列均为1140bp的同源基因序列;总共发现11个变异位点,观察到10种单倍型;4个山羊群体中单倍型多样性为0.442-0.889,核苷酸多样度为0.00145-0.0025。贵州山羊的遗传多样性处于中等水平;贵州山羊可分为两大类群,即贵州黑山羊和贵州麻羊2个群体为一类;贵州白山羊和贵州小香羊2个群体为另一类。
- 黄勤华刘若余吴芸王兴群
- 关键词：线粒体细胞色素B多态性贵州山羊
- 贵州麻羊mtDNA Cytb基因遗传多样性分析被引量：2
- 2008年
- 对贵州麻羊13个个体线粒体DNA细胞色素b基因全序列进行直接测序比对。结果表明,山羊线粒体细胞色素b基因全长为1 140 bp,T、C、A和G碱基的平均含量分别为26.8%、28.2%、31.9%和13.1%,碱基组成的百分比中显示出G的相对缺乏,A+T含量(58.7%)比G+C(41.3%)含量高;总共发现6个变异位点,分别为174、576、594、721、852、1 068;观察到3种单倍型;构建了16个山羊个体的N-J树,显示贵州黔北麻羊存在2个母系起源。
- 黄勤华刘若余吴芸王兴群
- 关键词：山羊细胞色素B
- 贵州白山羊与湖南马头山羊mtDNA Cytb基因系列比较及系统进化研究被引量：2
- 2009年
- [目的]为了从核酸序列水平上分析2个山羊线粒体DNA Cytb基因的遗传多样性及系统发生地位。[方法]对贵州白山羊及马头山羊2个山羊品种，共计27个个体mtDNA Cytb基因片段进行测序分析和比较。[结果]26条山羊的Cytb基因序列均为1140bp的同源基因序列；总共发现12个变异住点，观察到10种单倍型；2个山羊品种中单倍型多样性为0．635％-0．889％，核苷酸多样度为0．189％～0．253％。[结论]2个山羊品种线粒体DNA遗传多态性为中等；贵州白山羊与湖南马头山羊同起源于胃石山羊。
- 黄勤华刘若余邓书堪
- 关键词：山羊细胞色素B
- 板角山羊mtDNA Cyt b基因变异特点及系统进化研究被引量：1
- 2009年
- 测定了板角山羊品种13个个体的细胞色素b基因全序列(1140bp),比较分析了群体中细胞色素b基因的碱基组成和序列间碱基的变异情况,结果显示:在该品种(群体)中细胞色素b基因序列中6个变异位点上观察到11次T-C间和2次A-G间的碱基转换,除了有2次T-C间碱基转换发生在密码子第2位点为非同义突变以外,其余的11次碱基转换发生在密码子第3位点,均为同义突变;有1次T-G间碱基颠换发生在密码子第2位点,为非同义突变;观察到5种单倍型,单倍型多样度为0.8077。并以绵羊为外群,与山羊属其他种的同源区序列构建系统发生树。结果显示,在系统地位上板角山羊与胃石山羊有较近的亲缘关系。
- 邓书湛刘若余吴芸
- 关键词：山羊系统进化
- 马头山羊线粒体细胞色素b基因遗传多样性研究
- 2009年
- 测定了马头山羊品种16个个体的细胞色素b基因全序列(1 140 bp),比较分析了群体中细胞色素b基因的碱基组成和序列间碱基的变异情况。结果显示:在该品种(群体)中细胞色素b基因序列中8个变异位点上观察到23次T-C间碱基转换,有11次T-G间碱基颠换发生在密码子第2位点,为非同义突变;观察到6种单倍型,单倍型多样度为0.808,核苷酸多样度为0.002 43。以绵羊为外群构建系统发生树(NJ tree)。结果显示:马头山羊有两个母系起源,其中支系A占75%(12/16),支系B占25%(4/16)。
- 邓书湛刘若余吴芸
- 关键词：山羊线粒体细胞色素B基因
- 贵州黑山羊mtDNA Cytb基因遗传多样性分析被引量：6
- 2008年
- [目的]研究分析了贵州黑山羊mtDNACytb基因的遗传多样性,为贵州黑山羊遗传资源的保护、开发及利用奠定分子遗传学方面的基础。[方法]测定贵州黑山羊品种16个个体的细胞色素b基因全序列,分析其碱基组成和序列间碱基的变异。[结果]在该品种(群体)中观察到6次T-C间发生碱基转换,其中有5个碱基替换发生在密码子第3位点,有1个碱基替换发生在密码子第1位点,且所有的变异均为同义突变;观察到4种单倍型。单倍型多样度(H)为0.442,核苷酸多样度(π值)为0.145%+0.159%。以绵羊为外群构建分子系统发生树,结果初步提示,贵州黑山羊有两个母系起源,其中支系A占81.25%(13/16),支系B占18.75%(3/16)。[结论]贵州黑山羊有两个母系起源(支系A和支系B),且该品种线粒体DNA多态度较为贫乏。
- 黄勤华刘若余吴芸王兴群
- 关键词：山羊细胞色素B
- 利用mtDNA细胞色素b分析贵州山羊的系统发育被引量：6
- 2010年
- 试验选取贵州山羊4个群体(共55只),设计引物对其mtDNA细胞色素b基因片段进行测序,测序结果与GenBank报道的8个山羊品种mtDNA细胞色素b基因进行比对分析。结果发现,在55只贵州山羊中有11个变异位点,其中转换10次,T/G颠换1次;10种单倍型中有7种单倍型为1个群体独享,3种单倍型为多个群体共享。4个山羊类群间存在较近的亲缘关系,既是独立的类群,其间也存在基因交流,其中贵州黑山羊和贵州麻羊的亲缘关系最近,与贵州白山羊的亲缘关系次之,与贵州小香羊的亲缘关系最远。从山羊品种间遗传距离构建的邻接树可见,贵州4个山羊类群均起源于镰刀状角羊骨羊。
- 黄勤华刘若余
- 关键词：贵州山羊线粒体DNA细胞色素B基因系统发育
