国家自然科学基金(30900933)
- 作品数:3 被引量:13H指数:2
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- 相关机构:浙江省农业科学院浙江师范大学杭州师范大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金公益性行业(农业)科研专项浙江省自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 真菌类过氧化物酶体增殖因子PEX11基因家族生物信息学研究被引量:1
- 2012年
- PEX11基因家族成员是参与过氧化物酶体增殖调控的关键因子,文章利用生物信息学方法对26种代表性真菌的PEX11基因家族成员进行了检索和进化分析。研究发现:(1)26种真菌中共有66个可能的PEX11p。酵母类真菌有1个或2个PEX11p,而大多数丝状真菌中包含2到3个,其中子囊菌中PEX11p的个数偏多,个别种类达到5个;(2)真菌PEX11p可分为3类,大多数真菌含有类型Ⅰ和类型Ⅲ的PEX11p,类型Ⅱ是盘菌亚门真菌所特有的,可能与类型Ⅰ和类型Ⅱ在功能上有冗余;(3)通过MEME分析,发现PEX11p含有多个保守区域,其中C末端的Motif8具有很高的保守性,推测可能对PEX11p发挥功能具有重要作用。文章对进一步研究真菌PEX11p的进化与功能以及过氧化物酶体的增殖具有重要意义。
- 张昕姜华王艳丽张震毛雪琴柴荣耀邱海萍杜新法王教瑜孙国昌
- 关键词:过氧化物酶体生物信息学进化分析
- 杂草和水稻梨孢菌亲缘关系研究被引量:2
- 2012年
- 利用12个引物的随机扩增多态性DNA标记(RAPD)对来自18种寄主的49个梨孢菌株进行了亲缘关系分析,从DNA电泳谱带中可以直观地看出,来自同一种或同一属或亲缘关系相近寄主上的梨孢菌带型较相似,相反,亲缘关系较远的寄主上的梨孢菌带型差异较大,茭白、碎米莎草和马唐寄主上的梨孢菌的谱带均非常特异,与牛筋草和狗尾草等其他15种寄主的梨孢菌有较大差异,牛筋草和狗尾草等15种寄主的梨孢菌存在比较多的共有谱带。对引物S380扩增的RAPD谱带进行聚类分析表明,18种寄主上的49个梨孢菌株可分为5个类群。种与种之间的DNA(RAPD谱带)电泳谱带差异非常明显,而种内品种间的带型差异比较小。
- 毛雪琴邱海萍张震姜华柴荣耀王教瑜王艳丽孙国昌杜新法
- 关键词:梨孢菌聚类分析
- 稻瘟菌无毒基因研究进展被引量:10
- 2011年
- 稻瘟菌是引起水稻稻瘟病的病原物。水稻与稻瘟菌间存在广泛而特异的相互作用,是研究寄主与病原物互作的重要模式系统。本文对稻瘟菌与水稻互作最重要的激发子―无毒基因的研究现状进行了概括,讨论了无毒基因的定位、克隆方法以及已克隆无毒基因的功能及进化研究,同时对今后无毒基因研究的重要方向进行了探讨,为深入理解无毒基因的功能及与水稻可能的互作关系奠定了基础。
- 张哲姜华王艳丽孙国昌
- 关键词:水稻稻瘟病稻瘟菌无毒基因激发子