北京市科技计划项目(H030230280190)
- 作品数:16 被引量:89H指数:6
- 相关作者:钱小红蔡耘应万涛王京兰张养军更多>>
- 相关机构:军事医学科学院北京放射与辐射医学研究所沈阳药科大学更多>>
- 发文基金:北京市科技计划项目国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域:生物学医药卫生理学更多>>
- 规模化蛋白质组表达谱的研究进展及其挑战被引量:1
- 2007年
- 介绍了规模化蛋白质组表达谱研究的基本技术和方法,简要概述了部分已完成基因组测序的生物体的蛋白质组表达谱研究进展,分析了上述研究所面临的问题和挑战。
- 陈明应万涛钱小红
- 关键词:蛋白质组
- 规模化蛋白质鉴定中的串联质谱数据评价方法
- 2005年
- 随着蛋白质组学研究的蓬勃发展,尤其是近年来对规模化表达谱作图的重视,促使大量蛋白质被鉴定出来,但同时带来了数据质量控制的问题,如何有效去除假阳性结果,提高数据的可靠性,并使得来自不同技术路线、不同质谱仪器以及不同实验室的数据具有可比性是蛋白质组学研究领域的一个热点和难点,文章就目前所使用的数据质量评价方案进行了综述。
- 杨兵应万涛董鸿晔钱小红
- 关键词:蛋白质鉴定串联质谱假阳性率蛋白质组
- 军事医学科学院蛋白质组学研究进展被引量:4
- 2011年
- 蛋白质组学是后基因组时代生命科学研究的热点和前沿领域.军事医学科学院是国内最早开展蛋白质组研究的单位之一,其蛋白质组学研究的发展不仅对中国蛋白质组研究起到重要的引领作用,也对国际蛋白质组学的发展做出了重要贡献.本文将重点介绍军事医学科学院的科学家在国际人类肝脏蛋白质组计划以及疾病蛋白质组、病原微生物蛋白质组等领域的研究成果.
- 钱小红姜颖王建朱云平李栋魏开华王恒梁
- 关键词:蛋白质组学表达谱肝病蛋白质相互作用病原微生物
- 基于生物质谱的乙酸酐稳定同位素标记定量蛋白质组学方法的建立与优化被引量:4
- 2007年
- 建立了一种基于生物质谱的乙酸酐稳定同位素标记,定量蛋白质组学研究方法,优化了影响标记效率的各种条件。在pH8.0的Na2B4O7/H3BO3缓冲体系中,当乙酸酐摩尔浓度25倍过量于肽段摩尔量,22℃反应30 min时,标记即可完全。对多对H6/D6-乙酸酐标记肽段在基质辅助激光解吸电离质谱中的动态范围及定量准确度进行了考察,并通过串联质谱分析确定了乙酰化位点。结果表明:在10倍和30倍动态范围内,线性关系良好(r=0.99,r=0.98),理论值和观测值的偏差分别为0.5%和20%。
- 刘新应万涛周春喜蔡耘钱小红
- 关键词:定量蛋白质组学生物质谱
- 基于稳定同位素标记与FT-MS技术的血浆蛋白质组数据集
- 血液是人体赖以生存的重要物质基础,其中血浆蛋白质是组成血液的重要生化物质基础,与其他重要成分一起维持了血液在沟通内外环境、维持内环境稳定、承担物质的运输、免疫防御、凝血以及抗凝血等方面的重要作用。血浆蛋白质组研究长期以来...
- 刘新应万涛张纪阳巩燕蔡耘钱小红
- 文献传递
- 基于生物质谱技术的磺酸化修饰策略及其在蛋白质组学中的应用被引量:3
- 2007年
- 对近几年报道的磺化修饰策略及其应用进行了评述。通过磺化修饰在肽段上引入带负电荷的磺酸基,不仅可以诱导肽段离子的质谱裂解,得到以y系列离子为主的序列信息丰富的串联质谱图,有利于肽段从头测序,还可以改变被修饰肽段的电荷分布,通过离子交换色谱法分离富集磺化修饰的肽段,有助于蛋白质鉴定。
- 赵丽艳周春喜张养军蔡耘钱小红
- 关键词:化学修饰蛋白质组学生物质谱
- 磷酸化蛋白质组学分析和定量技术的研究进展被引量:15
- 2007年
- 蛋白质的磷酸化是一种可逆性的蛋白质翻译后修饰,在生物体内起着极为重要的作用.近年来蛋白质翻译后修饰日益成为蛋白质组研究的热点之一.定量磷酸化蛋白质组学方法和技术的快速发展为研究蛋白质磷酸化时空动态变化,更好地了解生物学功能调节网络奠定了坚实的基础.作为蛋白质组学研究的一个重要组成部分,定量磷酸化蛋白质组学因其磷酸化蛋白质所具有的独特特征,在技术和方法研究方面将面临更为严峻的挑战.综述了磷酸化蛋白质组学定量的一些分析技术和方法的发展现状、优缺点以及未来的发展趋势.
- 隋少卉王京兰蔡耘钱小红
- 关键词:磷酸化蛋白质组学
- 基质辅助激光解吸附电离-飞行时间串联质谱研究重组人促红细胞生成素一级结构被引量:10
- 2006年
- 建立了生物质谱研究rhEPO一级结构的系列方法,包括分子量、唾液酸含量以及N-糖含量等糖基化性质的测定方法,并用于4种国产rhEPO样品的分析;在此基础上优化酶切条件,使测定的肽质量指纹谱(PMF)的覆盖率均达到98%,成功鉴定了4个样品中的全部N-糖基化位点以及对分子中两对二硫键进行了结构确证,测定4个样品分子量分别为27754.1±27.4Da、27941.4±23.2Da、27682.5±22.0Da和27914.7±22.5Da;唾液酸含量分别为5.0%、4.8%、5.6%和5.4%;糖含量分别为34.3%、34.7%、34.1%和34·6%。此外还对4种产品在O-连接糖型及N-连接糖型上的区别做了初步探讨。
- 卢庄王杉代景泉王京兰张养军应万涛徐友宣钱小红吴侔天蔡耘
- 关键词:重组人促红细胞生成素肽质量指纹谱二硫键
- 磷酸化蛋白质组研究中的富集策略被引量:1
- 2007年
- 蛋白质的磷酸化与去磷酸化过程,调控着包括信号转换、基因表达、细胞周期等诸多细胞过程。因此,对蛋白质磷酸化修饰的分析是蛋白质组研究中的重要内容。但由于磷酸化蛋白的丰度较低,难以用质谱直接检测。为了解决这个问题,改善质谱对磷酸肽的信号响应,需要对磷酸化蛋白质或磷酸肽进行富集。目前主要的富集方法包括免疫沉淀、固相金属离子亲和色谱、金属氧化物/氢氧化物亲和色谱等。
- 毕炜王京兰钱小红蔡耘
- 关键词:磷酸化蛋白质组
- 基于18O稳定同位素标记的磷酸化蛋白质组学定量方法的研究
- 生物体中蛋白的表达是高度动态的,即使同一细胞在不同生理或病理环境中,其蛋白表达也是不同的,这种差异蛋白往往是某些疾病发生的标志。利用比较蛋白质组研究技术,可以批量观察正常与疾病细胞(组织)在蛋白质表达谱上的差异,从整体水...
- 隋少卉王京兰贾伟卢庄刘金风宋丽娜蔡耘钱小红
- 关键词:QUANTITATIVE
- 文献传递