天津市自然科学基金(06YFJMJC10000)
- 作品数：8 被引量：77H指数：6
- 相关作者：宋文芹古瑜王春国赵前程孙德岭更多>>
- 相关机构：南开大学天津科润蔬菜研究所天津医科大学更多>>
- 发文基金：天津市自然科学基金国家重点基础研究发展计划国家教育部博士点基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 椰菜细花胞质雄性不育分子机制初步研究
- 花椰菜(Brassica oleracea var.botrytis L.)是一种重要的蔬菜类作物。利用花椰菜细胞质雄性不育系及相应的保持系、优良父本所进行的杂交优势利用,已广泛用于花椰菜高品质杂交种的生产。但在实际育种...
- 王春国宋文芹孙德岭赵前程
- 文献传递
- 花椰菜遗传图谱的构建及NBS-LRR类抗性同源基因在图谱中的定位被引量：7
- 2007年
- 利用AFLP和NBS profiling技术,以花椰菜自交系“AD白花”与高代自交不亲和系“C-8”杂交得到的F1代自交产生的F2代分离群体为材料,构建了第一个花椰菜遗传连锁图谱。该图谱由234个AFLP标记和21个NBS标记构成了9个连锁群,总图距为668.4cM,标记间平均距离为2.9cM。每个连锁群包含的位点数从12到47个,相邻两标记之间的距离范围是0～14.9cM。NBS标记分布在8个连锁群中,这些标记大部分聚在一起。本研究为今后的基因定位及重要农艺性状的分析提供框架图。此外,研究NBS profiling方法在花椰菜中的稳定性和有效性以及NBS-LRR类RGA在花椰菜基因组中的分布和特点。
- 古瑜赵前程孙德岭宋文芹
- 关键词：花椰菜NBSPROFILING遗传连锁图谱
- 大丁草(Gerbera anandria(L．)Sch Bip．)对腺嘌呤诱导的慢性肾功能衰竭大鼠TGF-β1和ET-1mRNA表达的影响被引量：10
- 2009年
- 采用Wistar大鼠灌胃腺嘌呤4周复制慢性肾衰模型后用大丁草水煎液进行灌胃治疗,4周后检测各组肾功能、肾脏组织病理学改变及转化生长因子-β1(TGF-β1)和内皮素-1(ET-1)mRNA的表达结果发现大丁草组大鼠血肌酐和尿素氮浓度分别为(89.33±15.21)μmol/L和(21.52±3.95)mmol/L与治疗前的建模组(290.33±74.55)μmol/L和(32.30±2.35)mmol/L以及病理对照组(149.67±24.95)μmol/L和(33.18±2.95)mmol/L比较有所下降,经统计P<0.05,差异具有显著性与病理对照组相比大丁草组大鼠基因TGF-β1和ET-1表达也明显降低,与看家基因GAPDH的比值分别由(0.202 6±0.050 3)和(0.1949±0.0969)下降为(0.1285±0.0447)和(0.07810±0.0229),经统计P<0.05,差异具有显著性.由此认为大丁草对腺嘌呤所致慢性肾功能衰竭大鼠肾脏有保护作用,其机制可能是通过抑制TGF-β1和ET-1的表达来缓解肾脏损伤,恢复肾功能.
- 苗绪红苏冠男饶冠华王峰张军宋文芹
- 花椰菜细胞质雄性不育系及保持系中特异序列的克隆、分析被引量：7
- 2008年
- 以细胞质雄性不育花椰菜ogura-A和相应的保持系ogura-B为材料进行ISSR及DDRT-PCR分析。选用30条ISSR引物,经扩增共产生306条清晰可辨的条带。每条引物可产生6-12条带,其中引物ISSR3在两系中呈现多态性扩增,在保持系中特异扩增出一条1100bp的片段,序列分析表明该片段与油菜、拟南芥线粒体基因组的部分序列高度相似,推测其可能来源于花椰菜线粒体基因组。在DDRT-PCR分析中,选用3条锚定引物、15条随机引物进行组合,最终共获得1122条大小在1000-50bp的带。经反向Northern杂交验证只有4条带特异的存在于两系中,分别命名为ogura-A205、ogura-A383、ogura-B307、ogura-B352。其中ogura-A205、ogura-A383只在细胞质雄性不育系中表达,而ogura-B307、ogura-B352在保持系中呈现特异性表达,分析表明四个差异序列均为首次报道。其中ogura-A205、ogura-B307至今尚未发现与之相似的序列,有待于进一步研究;ogura-A383、ogura-B352与报道的拟南芥、大白菜等的叶绿体基因的一些片段具较高相似性,推测ogura-A383、ogura-B352可能来源于花椰菜叶绿体基因组。以上结果为进一步阐明花椰菜细胞质雄性不育及育性保持的分子机制提供了新线索。
- 王春国陈小强李慧赵前程孙德岭宋文芹
- 关键词：花椰菜细胞质雄性不育ISSRDDRT-PCR
- 慢性肾功能衰竭大鼠肾皮质基因组DNA表观遗传学变化的MSAP分析被引量：3
- 2011年
- 以灌胃腺嘌呤诱导的慢性肾功能衰竭Wistar大鼠为实验材料,用高效液相色谱法(HPLC)检测了大鼠血清Hcy浓度的变化;应用甲基化敏感扩增多态性(methylation-sensitive amplification polymorphism,MSAP)技术,检测了慢性肾衰大鼠肾皮质基因组DNA甲基化程度的变化,并对MSAP差异片段进行了分析.结果发现:(1)慢性肾衰大鼠血清Hcy浓度由正常的(10.56±1.20)μmol/L上升为(16.64±1.57)μmol/L,P<0.05,差异具有显著性.(2)慢性肾衰大鼠肾皮质基因组总甲基化率由正常的(41.95±1.94)%降低为(38.43±3.27)%,P<0.05,差异具有显著性.(3)甲基化差异片段涉及多个基因,其中包括多个甲基化转移酶相关基因.结果表明慢性肾功能衰竭大鼠会出现高同型半胱氨酸血症和肾皮质基因组总甲基化水平的降低,多个基因内部或上下游DNA序列出现甲基化状态变化.
- 苗绪红苏冠男胡宝全王春国陈成彬宋文芹
- 关键词：慢性肾功能衰竭大鼠甲基化敏感扩增多态性同型半胱氨酸
- 尿毒清颗粒对腺嘌呤诱导的慢性肾功能衰竭大鼠肾皮质TGF-β_1及其下游基因mRNA表达的影响被引量：7
- 2012年
- 为了研究尿毒清颗粒的作用机制,以灌胃腺嘌呤诱导的慢性肾功能衰竭Wistar大鼠为实验材料,用SYBR Green I实时荧光定量PCR(Real-time Fluorescent Quantitative PCR,Real-time FQ-PCR)技术检测了大鼠肾皮质转化生长因子-β1(Transfer Growth Factor-β1,TGF-β1)及其下游基因mRNA的表达变化,利用免疫组织化学(Immuno Histo Chemistry,IHC)技术检测了CRF大鼠肾皮质TGF-β1蛋白表达的变化.结果发现,尿毒清颗粒可以降低慢性肾功能衰竭大鼠肾皮质TGF-β1及其下游基因mRNA的表达,能够降低大鼠肾皮质TGF-β1蛋白的表达,P<0.05,差异具有显著性.尿毒清颗粒可以通过TGF-β1通路起到缓解慢性肾功能衰竭大鼠病理变化的作用,为尿毒清颗粒治疗慢性肾功能衰竭药理机制研究提供了实验基础.
- 苗绪红饶冠华郝擘李爱胡宝全宋文芹
- 关键词：实时荧光定量PCR技术尿毒清颗粒慢性肾功能衰竭大鼠
- 花椰菜(Brassica oleracea var.botrytis)抗黑腐病差异表达cDNA片段的克隆及功能的初步研究被引量：7
- 2008年
- 采用花椰菜抗黑腐病近等基因系C731（感病系）和C712（抗病系）作为材料，利用cDNA—AFLP技术，研究了花椰菜黑腐病抗性在黑腐病菌侵染和非侵染条件下基因表达的情况．获得了两个阳性克隆M2和M6．Northern杂交和点杂交进一步证明M2是组成型表达的cDNA片段，只是在病菌侵染与非侵染条件下表达丰度不同．而M6是差异表达的cDNA片段．Southern杂交表明M6 cDNA片段在花椰菜基因组中是单拷贝序列．随后的序列分析发现M6cDNA片段与拟南芥1号染色体的BACF19P19中66665～66813bp有84％同源性，该片段编码拟南芥的2A6蛋白的部分序列．推测的氨基酸序列与拟南芥的2A6蛋白部分序列有91％同源性．用H2O2作为外源分子胁迫处理的初步功能分析发现：M6cDNA片段受H2O2诱导，在诱导早期16～24h高度表达，其在叶片中的积累呈逐渐上升趋势．根据序列分析和初步的功能分析的结果推测：M6cDNA片段可能就是编码花椰菜中类2A6蛋白的部分基因片段．是参与花椰菜抗病反应信号途径的相关调控基因片段．
- 古瑜毛英伟赵前程孙德岭刘惠静宋文芹
- 关键词：OLERACEA黑腐病
- 花椰菜抗、感黑腐病系在致病菌胁迫前后胞嘧啶甲基化的MSAP分析
- 随着人们生活水平的不断提高和对自身健康的高度关注,花椰菜的营养价值和抗病的功效逐渐被人们所认识。已经成为人们喜食的保健蔬菜之一,全世界种植的范围也在逐年增加。与同为芸薹属作物的甘蓝和白菜相比,花椰菜的分子生物学研究相对比...
- 古瑜王春国孙德岭赵前程宋文芹
- 文献传递
- 不同倍性西瓜基因组DNA甲基化水平与模式的MSAP分析被引量：32
- 2009年
- DNA甲基化是表观遗传修饰的主要方式之一,在基因表达调控中发挥重要作用。本研究以不同倍性(2x、3x、4x)西瓜为试材,采用基于DNA甲基化敏感酶的扩增多态性分析(Methyla-tion-Sensitive Amplification Polymorphism,MSAP)方法,在全基因组水平上探究西瓜同源多倍化过程中DNA序列中CCGG位点的甲基化水平及模式变化特征。研究中选用23对选扩引物,共检测到1883个基因位点。二倍体、三倍体、四倍体中检测到的位点数分别为647、655和581;其中发生甲基化的位点数分别为181、150和159,相应的扩增总甲基化率分别为28.0%、22.9%和27.4%;全甲基化位点数分别为121、80和82,相应的全甲基化率分别为18.7%、12.2%和14.1%。进一步对不同倍性西瓜DNA甲基化模式的变化特征进行分析,结果显示:四倍体西瓜与二倍体西瓜相比有超过半数的位点(54.4%)DNA甲基化模式发生了变化,其与三倍体西瓜相比也有近一半的位点(45.4%)DNA甲基化模式发生了变化,并且变化趋势都以四倍体西瓜甲基化程度升高为主;而三倍体西瓜与二倍体西瓜相比,虽然也有41.6%的位点DNA甲基化模式发生了改变,但变化趋势以三倍体西瓜甲基化程度降低略占优势;与之相似,三倍体西瓜与四倍体相比较,甲基化的变化趋势也是以三倍体西瓜甲基化程度降低为主。以上结果表明:不同倍性西瓜中DNA甲基化事件虽均有发生,但不论是从总甲基化率还是全甲基化率来看,DNA甲基化水平与倍性高低关系不大,三倍体西瓜表现出较为显著的低甲基化水平特征。DNA甲基化模式的分析也表明,与二倍体及四倍体西瓜相比,三倍体西瓜DNA甲基化模式的调整主要以去甲基化为主。显示出三倍体西瓜基因组独特的DNA甲基化特征。本研究为进一步从表观遗传学的角度探讨西瓜的三倍体优势及西瓜同源多倍化的机制奠定了基础。
- 王春国古瑜陈成彬焦定量薛振毅宋文芹
- 关键词：西瓜同源多倍体MSAPDNA甲基化
- 花椰菜(Brassica oleracea var.botrytis)黑腐病抗性基因同源序列分离及克隆的研究被引量：4
- 2007年
- 通过从 NBS 保守序列设计简并引物 PCR 的方法,以花椰菜(Brassica oleracea vat.botrytis)抗、感黑腐病的近等基因系为材料,分离得到 NBS-LRR 型抗性基因同源序列,并获得1个克隆,命名为 RGA330-7.Southern 杂交表明,该片段在近等基因系中存在明显的多态性,且该片段在抗黑腐病基因位点至少存在3个以上类似 RGA330-7的同源拷贝.序列分析结果认为该克隆与 NBS-LRR 型抗性基因的部分 CDSs 有很高的同源性,说明该片段属于 NBS-LRR 型.系统进化分析该序列与甘蓝型油菜的2个抗病同源序列归为一类,很可能这3个不同来源的抗性基因同源序列同属于一种抗性基因家族.因此推测该序列与花椰菜抗黑腐病基因紧密相关,为进一步克隆花椰菜抗黑腐病基因提供了可靠的候选基因,对分子标记辅助抗性育种具有重要意义。
- 古瑜赵前程刘松王春国孙德岭宋文芹
- 关键词：黑腐病OLERACEA
