您的位置： 专家智库 > >

黑龙江省自然科学基金(F2004-02)

作品数：5 被引量：16H指数：2
相关作者：李霞张瑞杰肖云宫滨生饶绍奇更多>>
相关机构：哈尔滨医科大学同济大学哈尔滨工程大学更多>>
发文基金：黑龙江省自然科学基金国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
相关领域：生物学医药卫生自动化与计算机技术更多>>

文献类型

  • 5篇中文期刊文章

领域

  • 3篇生物学
  • 1篇自动化与计算...
  • 1篇医药卫生

主题

  • 3篇基因
  • 2篇支持向量
  • 2篇支持向量机
  • 2篇向量
  • 2篇向量机
  • 2篇基因挖掘
  • 1篇单体型
  • 1篇蛋白
  • 1篇蛋白质
  • 1篇移动AGEN...
  • 1篇知识
  • 1篇知识体系
  • 1篇中毒
  • 1篇识体
  • 1篇微阵列
  • 1篇进化
  • 1篇酒精
  • 1篇酒精中毒
  • 1篇基因表达
  • 1篇基因表达谱

机构

  • 4篇哈尔滨医科大...
  • 1篇哈尔滨工程大...
  • 1篇首都医科大学
  • 1篇同济大学

作者

  • 4篇李霞
  • 3篇张瑞杰
  • 2篇宫滨生
  • 2篇饶绍奇
  • 2篇肖云
  • 1篇李传星
  • 1篇刘桂友
  • 1篇张帆
  • 1篇张杰
  • 1篇姜永帅
  • 1篇陈义汉
  • 1篇杨德印
  • 1篇于海龙
  • 1篇姜伟
  • 1篇郝大鹏
  • 1篇张健沛
  • 1篇程丽丽
  • 1篇李丽
  • 1篇郭政

传媒

  • 2篇遗传
  • 1篇中国科学（C...
  • 1篇计算机工程
  • 1篇生物信息学

年份

  • 1篇2008
  • 2篇2007
  • 2篇2006
共 5 条 记 录，以下是 1-5
全选 清除 导出
排序方式：
结合已有知识体系的酒精中毒相关的SNP单体型及其相关基因挖掘被引量：1
2008年
高通量的单核苷酸多态(single nucleotide polym orphism,SNP)检测技术与已有的知识体系(如KEGG,GO数据库等)为与疾病相关的SNP单体型及相关基因挖掘提供了有力支撑.本研究对高通量SNP基因型数据,采用4种SNP单体型板块(block)识别方法(置信区间、FGT、连锁不平衡的稳定连接以及单体型板块融合技术),用聚类分析方法验证其效能,通过风险分析方法确定酒精中毒相关的SNP单体型,并基于已有知识体系建立SNP单体型与基因的映射,通过查询NCBI SNP与gene数据库定位SNP单体型板块,确定候选基因,最后结合KEGG,Biocarta及GO数据库进行基因功能注释.在对人类22对常染色体的分析中,寻找到可能与酒精中毒相关的159个单体型板块,包含227个SNP单体型,并预测其中102个SNP单体型可能会增加酒精中毒的发病风险.挖掘得到了121个酒精中毒相关基因,并进一步进行可靠的生物学功能注释验证.结果提示:采用聚类效果验证及风险分析的单体型识别机制,基于单体型的疾病相关基因定位并结合已有知识体系的疾病相关基因挖掘策略,不仅能大大缩减SNP数据挖掘的工作量,实现复杂疾病相关基因的精细定位,而且对于多因素复杂疾病发病机制的探索将更有指导意义.
张瑞杰李霞姜永帅刘桂友李传星张帆肖云宫滨生
关键词：酒精中毒基因定位
复杂疾病驱使的融合SDA-SVM集成基因挖掘方法被引量：4
2007年
提出了一种新颖的复杂疾病驱使的融合SDA-SVM(Stepwise Discriminant Analysis-Support Vector Machine,SDA-SVM)技术的集成基因挖掘方法。该集成方法融合逐步判别分析和支持向量机的优点,能够有效地进行复杂疾病相关基因的深度挖掘,使得挖掘出的基因能够较好地识别疾病类型和亚型。通过将该方法应用于一套弥散性大B细胞淋巴瘤DNA表达谱数据,并与其它基因挖掘方法对比,结果表明该方法挖掘出的基因具有较高的疾病相关性和较强的疾病类型识别能力。
杨德印李霞郝大鹏张杰张瑞杰饶绍奇
关键词：微阵列基因挖掘支持向量机
基于耦合双向聚类技术的DLBCL异质性分析被引量：2
2006年
基因芯片技术为疾病异质性研究提供了有力的工具。当前基于传统聚类分析的方法一般利用芯片上大量基因作为特征来发现疾病的亚型,因此它们没有考虑到特征中包含的大量无关基因会掩盖有意义的疾病样本的分割。为了避免这个缺点,提出了基于耦合双向聚类的异质性分析方法(Heterogeneous Analysis Based on Coupled Two-WayClustering,HCTWC)来搜索有意义的基因簇以便发现样本的内在分割。该方法被应用于弥漫性大B细胞淋巴瘤(diffuselargeB-celllymphomaDLBCL)芯片数据集,通过识别的基因簇作为特征对DLBCL样本聚类发现生存期分别为55%和25%的两类DLBCL亚型(P<0.05),因此,HCTWC方法在解决疾病异质性是有效的。
李丽李霞陈义汉郭政姜伟张瑞杰饶绍奇
关键词：基因表达谱
毒蕈乙酰胆碱受体亚型关系的研究被引量：7
2007年
利用不同类型的生物学数据,运用生物信息学方法和策略,从分子进化、序列相似性、表达相关性以及蛋白互作4个层面对M受体亚型之间的关系进行了比较全面的研究。分析表明,从分子进化和序列相似性角度,毒蕈乙酰胆碱受体5种亚型可分为2个亚类,分别为M1、M3、M5亚类(第一亚类)与M2、M4亚类(第二亚类),每一亚类内部亚型之间进化距离相对较近,序列相似性较高。在表达层面发现第一亚类中受体亚型与第二亚类中受体亚型在某些组织中正表达相关,呈现共表达趋势。在互作层面发现两亚类之间受体亚型存在着间接互作的关系,呈现协同作用的现象。
于海龙肖云艾静李霞宫滨生
关键词：分子进化
基于支持向量机的移动Agent迁移策略被引量：2
2006年
迁移策略为移动Agent规划出最佳迁移路径,保证移动Agent正确、高效地完成任务。文章分析了现有移动Agent系统中采用的几种代表性迁移策略,提出了基于支持向量机的移动Agent迁移策略。模拟实验结果表明,与其它迁移策略相比该策略能够以较大的概率得到最优的结果,从而验证了算法的有效性和可行性。
马骏张健沛程丽丽
关键词：移动AGENT支持向量机
全选 清除 导出
共1页<1>
聚类工具0