山东省高等学校科技计划项目(J09LC18) 作品数:9 被引量:18 H指数:3 相关作者: 徐金会 徐来祥 薛慧良 陈蕾 卜凡莉 更多>> 相关机构: 曲阜师范大学 更多>> 发文基金: 山东省高等学校科技计划项目 国家自然科学基金 山东省优秀中青年科学家科研奖励基金 更多>> 相关领域: 生物学 农业科学 更多>>
黑线仓鼠AVP基因部分序列的系统进化及结构分析 2011年 根据GenBank中黑线仓鼠(Cricetulus barabensis)同源物种的AVPcDNA序列设计引物,利用RT-PCR技术得到了黑线仓鼠精氨酸加压素(AVP)基因部分cDNA序列,包括外显子2的全部序列和外显子1、3的部分序列,共433bp,并注册到GenBank(登录号:JN227681)。该段序列共编码143个氨基酸,二级结构预测显示片段中含较多的α螺旋。该序列与其他物种相应区域的比较结果表明其同源性为84%~92%,氨基酸序列同源性为82%~93%。系统进化分析结果与物种亲缘关系的远近一致,该序列的克隆为研究AVP的表达调控机制奠定了基础,将有助于AVP的作用机制的研究及功能分析,同时该cDNA序列可作为物种亲缘关系或遗传距离研究的理想标记。 王永安 卜凡莉 徐金会 薛慧良 徐来祥关键词:黑线仓鼠 AVP 克隆 系统进化 黑线仓鼠KiSS-1基因的生物信息学与系统进化研究 被引量:2 2012年 采用RT-PCR技术克隆得到黑线仓鼠(Cricetulus barabensis)KiSS-1基因的部分序列,并进行生物信息学分析。结果表明:该段序列共429bp,包含部分5'非翻译区、转录起始位点、信号肽序列以及主要的活性区域。黑线仓鼠KiSS-1编码的蛋白质是一种胞外分泌的亲水性蛋白质,N端含有19个氨基酸组成的信号肽序列,67、121-122位各有一个水解位点,68、69处的磷酸化位点可能与蛋白质活性的获得有关。二级结构预测含有较多的α螺旋和自由卷曲,115-119位的α螺旋在与受体结合中有重要作用。系统进化分析证实该序列与其他物种有较高的同源性,说明该基因在进化中相对保守。通过生物信息学与系统进化分析,有助于进一步揭示KiSS-1的转运加工途径及作用机制。 张强 卜凡莉 徐金会 薛慧良 杨月伟 徐来祥关键词:黑线仓鼠 KISS-1 生物信息学 系统进化分析 GnRH在黑线仓鼠不同器官中的差异表达 2013年 该研究以野生黑线仓鼠为材料,用实时定量PCR方法检测GnRH在下丘脑和部分生殖器官(睾丸、附睾、储精囊、卵巢、子宫)中的表达量,并分析个体间的表达差异.研究结果表明:①GnRH在黑线仓鼠的下丘脑、睾丸、附睾、储精囊、卵巢、子宫中均有表达,其中在下丘脑中的表达量相对较高而在生殖器官则表达量较低;②在雄性个体中,GnRH在下丘脑、睾丸、附睾、储精囊四种组织中表达量的比值为1∶0.166∶0.189∶0.073;③在雌性个体中,GnRH在下丘脑、卵巢.子宫三种组织中表达量的比值为1∶0.304∶0.040.研究结果显示,GnRH在不同组织和不同个体间均存在差异性表达,提示GnRH既可以通过下丘脑直接影响生殖功能,又可以直接参与生殖系统功能的调控,但其调控机制可能有所不同.研究结果将为研究GnRH在黑线仓鼠的功能及分子调控机制奠定基础,为探究野生黑线仓鼠繁殖动态的遗传调控机制提供理论保障,并为农田鼠害的综合防治提供科学依据. 王硕 徐晓飞 徐金会 薛慧良 张璇 徐来祥关键词:GNRH 黑线仓鼠 实时荧光定量PCR 分子机制 黑线仓鼠PPARβ部分编码区克隆与结构特征 2012年 参考黑线仓鼠(Cricetulus barabensis)近缘种PPARβ的cDNA序列设计引物,采用RT-PCR法克隆得到黑线仓鼠PPARβ部分序列,并翻译成氨基酸.利用该结果与其他物种核苷酸及氨基酸序列进行相似性比较、构建系统进化树、一级结构分析、二级结构和空间结构预测.结果表明:得到的480 bp PPARβ序列包括部分外显子4,全部外显子5、6及部分外显子7;共编码159个氨基酸;除人之外,黑线仓鼠PPARβ基因与其他物种的核苷酸相似性均在88%-94%之间,氨基酸相似性均在90%以上;构建进化树得出,黑线仓鼠与鼠类亲缘关系最近,与人的亲缘关系最远;疏水性分析、二级结构预显示该编码区亲水性较强;二级结构、空间结构预测显示该序列含α螺旋较多;空间结构预测看出该段区域含两个典型的锌指结构. 郑莹莹 徐来祥 徐金会 薛慧良 陈蕾关键词:黑线仓鼠 克隆 系统进化 空间结构 锌指结构 三种鼠类消化道长度和重量的比较 被引量:4 2010年 为了解动物消化道形态可塑性的变化与食性、食物质量之间的关系,对黑线仓鼠、棕色田鼠和小白鼠的消化道形态进行了比较分析.研究结果表明:三种鼠类的消化道形态存在差异;消化道长度不仅仅取决于食性,还受食物质量的影响;食性和食物质量的差异可能会引起不同消化器官形态结构产生适应性反应.胃的形态结构主要与生活习性有关,小肠与食物质量关系紧密,盲肠和大肠与则主要反映食性的差别. 刘璐 徐金会 孔杰 毛云锐 徐来祥关键词:鼠类 消化道 食性 种间差异 黑线仓鼠CRH基因的编码序列及系统进化分析 被引量:3 2012年 为探究黑线仓鼠(Cricetulus barabensis)繁殖功能与促肾上腺皮质激素释放激素(CRH)基因结构的关系,参考近缘种的cDNA序列设计引物,采用RT-PCR法克隆得到了黑线仓鼠CRH基因的部分序列,克隆得到长度为1 112 bp,为外显子1和外显子2的部分序列,包括全部编码区序列564 bp;编码区共编码187个氨基酸,GenBank登录号为JQ416143。利用编码区序列构建系统进化树,结果显示,黑线仓鼠与大鼠、小鼠亲缘关系最近,与其他哺乳动物亲缘关系较近,而与原鸡亲缘关系最远,此结果与物种的进化关系相一致。同时对其编码的蛋白质进行一级结构分析及二级、三级结构预测,得到了CRH的信号肽序列和41个氨基酸组成。本研究首次报道了黑线仓鼠的CRH基因序列,为进一步探究CRH基因奠定基础,对系统分析CRH的功能具有重要的参考价值,同时该cDNA序列可作为物种亲缘关系或遗传距离研究的理想标记。 张琪 薛慧良 徐金会 陈蕾 徐来祥关键词:黑线仓鼠 系统进化 野生黑线仓鼠脏器重量的增龄变化 被引量:6 2010年 为研究黑线仓鼠对环境生态的适应情况,对山东省的野生黑线仓鼠Cricetulus barabensis内脏器官的重量进行了测量,并对其增龄变化进行了比较。结果表明:黑线仓鼠内脏器官的重量随年龄的增长而增长,在调整动物体重后,这种差异不再显著,显示脏器重量与体重有相似的变化趋势。各脏器系数在年龄间差异显著,表现为随年龄的增长而减小,表明脏器生长速率低于体重的增长。脏器重量和脏器系数可能受到年龄、环境等因素的影响。 王洪伟 徐金会 靳鹏 陈秋兰 徐来祥关键词:黑线仓鼠 脏器系数 年龄 黑线仓鼠LHR部分序列的克隆与分析 被引量:2 2011年 以大鼠、小鼠、金仓鼠(Mesocricetus auratus)的同源保守序列设计了黑线仓鼠(Cricetulus barabensis)黄体生成素受体基因(LHR)的引物,经PCR扩增得到了154 bp的目的产物,通过Blast证实该片段是黑线仓鼠的LHR序列.该段序列处于第11外显子的5’端,编码51个氨基酸,包含部分铰链区和第一个跨膜α螺旋(TM1)区.疏水性氨基酸所占比例相当高,其中缬氨酸、异亮氨酸各占9.80%,亮氨酸为19.61%,通过疏水性分析,TM1区具有典型的α螺旋特征.与大鼠、小鼠、金仓鼠等物种同源比对,核苷酸和氨基酸的同源性分别达到了83%-98%,82%-100%.α螺旋跨膜区的氨基酸同源性超过82%具有很强的保守性,但在26,41,44,48位点上仍然表现出种属之间的差异性.该研究用PCR的方法克隆出了黑线仓鼠LHR的部分序列,并对其进行了同源性分析,为今后黑线仓鼠种群繁殖机制、种群扩散模式等的研究奠定一定理论基础. 谢海燕 薛慧良 徐金会 王哲 徐来祥关键词:黑线仓鼠 克隆分析 催乳素受体与黑线仓鼠胎产仔数的关联性 被引量:1 2013年 黑线仓鼠是生态系统的主要功能群之一,胎产仔数是影响黑线仓鼠种群数量的一个主要因素,催乳素受体(PRLR)又是控制动物胎产仔数的一个主效基因,但PRLR与黑线仓鼠胎产仔数的关联性还不清楚。本研究以具有胎产仔数记录的90只黑线仓鼠为材料,检测PRLR 5'端的SNP,并分析单倍型结构,同时检测试验个体发情期卵巢PRLR的表达量。分析了PRLR 5'端的单倍型结构和发情期卵巢PRLR的表达量与胎产仔数的关联性。结果表明,在黑线仓鼠PRLR 5'端共检测到3个多态性位点,5种单倍型结构;在不同的单倍型结构间,胎产仔数均存在显著差异;除H1和H2之间、H4和H5之间外,其余单倍型间,黑线仓鼠发情期卵巢PRLR的表达量均存在显著差异;并且发情期卵巢PRLR的表达量与胎产仔数存在显著正相关(r=0.982)。因此,在PRLR 5'端检测到的多态性位点显著影响黑线仓鼠的胎产仔数,这为有效控制黑线仓鼠种群数量从分子水平上提供了理论依据。 薛慧良 王东宽 徐金会 徐来祥关键词:黑线仓鼠 催乳素受体 胎产仔数