国家自然科学基金(39630190)
- 作品数:6 被引量:129H指数:5
- 相关作者:朱立煌翟文学王文明郑先武江光怀更多>>
- 相关机构:中国科学院遗传与发育生物学研究所中国农业科学院作物科学研究所中国科学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域:生物学更多>>
- 水稻第六染色体长臂亚端粒区遗传图与物理图的整合被引量:4
- 2000年
- 生物染色体亚端粒区域在物种进化过程中是高度活跃的。为了认识水稻染色体亚端粒区域的组织结构,用水稻第六染色体长臂亚端粒区的 RFLP标记 G342和 R1167作探针筛选BAC文库,以得到的阳性BAC克隆为起点进行染色体步行,构建了覆盖这2个分子标记区域约500kb的BAC跨叠克隆群,将这一区域的遗传图和物理图进行了整合。对14个BAC克隆插入末端进行了亚克隆,鉴定的7个亚克隆末端为单拷贝或低拷贝序列,其中5个定位于G342和R1167的侧翼区域。用覆盖这一区域的BAC插入片段作探针对cDNA文库进行初步筛选,获得4个不同的阳性cDNA克隆。
- 王文明翟文学陈纯贤郑先武严长杰李晓兵朱立煌
- 关键词:水稻RFLP标记BAC
- Mapplotter—— 一个输出遗传图谱、图示基因型和QTL曲线图形的软件被引量:11
- 2000年
- 沈利爽郑先武朱立煌
- 水稻抗白叶枯病基因Xa4位点跨叠BAC克隆群的构建被引量:6
- 2001年
- 水稻白叶枯病抗性基因Xa4已被定位于第11染色体长臂末端的分子标记G181和L1044之间,并与抗性基因同源序列片段RS13共分离.利用这3个标记筛选IRBB56的BAC文库,共得到128个阳性BAC克隆,其中RS13获得18个阳性克隆,这IS个克隆中有4个和6个克隆分别同时为G181和L1044的阳性克隆.选其中的12个克隆进行分析,构建了一个从G181到L1044区间的BAC跨叠克隆群,全长420kb,并且56M22、106P13和104B15 3个BAC克隆可覆盖整个跨叠克隆群。这一研究结果为进一步分离Xa4基因打下了基础。
- 江光怀王文明谢兵翟文学鲁润龙朱立煌
- 关键词:白叶枯病细菌人工染色体抗病性水稻
- 高覆盖率水稻BAC库的构建及抗病基因相关克隆的筛选被引量:41
- 2001年
- 利用含Xa4、xa5和xa13 3个水稻白叶枯病抗性基因的累加系IRBB56构建了一个水稻细菌人工染色体文库。该文库包含55 296个克隆,平均插入片段为132kb。按水稻基因组为450Mb计,该文库覆盖14倍基因组,筛选出任一水稻基因或序列的概率为99.99%。用均匀分布的3个叶绿体基因和4个线粒体基因克隆作探针筛选文库,结果显示该文库中含细胞器基因组DNA同源序列的克隆数小于1%。用分布于水稻3条不同染色体、分别与Xa4、xa5和xa13连锁的DNA标记筛选文库,分别检测出11~106个阳性克隆,为克隆这些基因打下了基础。 该文库对水稻基因组的高度覆盖率和较大的插入片段,非常适合于物理作图和基因的分离和克隆。
- 王文明江光怀王世全朱立煌翟文学
- 关键词:细菌人工染色体(BAC)文库基因组克隆抗病水稻抗病基因
- 水稻NBS-LRR类R基因同源序列被引量:57
- 2001年
- 根据多数抗病基因(R)编码蛋白质的核苷酸结合区(nucleotide binding site, NBS)和富含亮氨酸重复(leucine-rich repeat, LRR)保守区域特点, 设计PCR特异扩增引物, 从水稻中克隆了大小约为520 bpDNA片段23个. 通过序列同源比较分析发现, 它们编码的蛋白质氨基酸序列包括有NBS-LRR类基因所具有的kinase-1a, kinase-2a, kinase-3a和保守的domain 2区域, 它们属于R基因同源序列(R gene homologous sequence, 简称RS). 聚类结果发现它们分为4类. 遗传定位结果表明它们分布在1, 3, 4, 7~11染色体上, 其中10个RS位于已知R基因所在的染色体区间. 用水稻抗白叶枯病基因Xa4的近等基因系和基因累加系对克隆的NBS-LRR同源序列进行RFLP分析, 发现序列RS13可能来自Xa4基因家族.
- 郑先武翟文学李晓兵王文君徐吉臣刘国振朱立煌
- 关键词:水稻抗病基因
- 水稻抗白叶枯病基因Xa-4的精细定位及其共分离分子标记被引量:19
- 2000年
- 利用Xa-4的近等基因系IR24和IRBB4构建F_2群体,通过抗性鉴定筛选出感病植株,利用水稻高密度图谱上的分子标记和候选抗病基因片段进行分析,构建了抗白叶枯病基因Xa-4的遗传图谱,并获得了与 Xa-4共分离的分子标记 RS13.构建的遗传图谱还包含另外5个紧密连锁的分子标记,其中1个是PCR标记,4个是国际通用的水稻高密度图谱上的RFLP标记.为图位克隆Xa-4打下了基础,也为分子标记辅助选择育种提供了有效的分子标记。
- 王文明周永力江光怀马伯军陈学伟章琦朱立煌翟文学
- 关键词:水稻分子标记