国家林业公益性行业科研专项(201204403-3)
- 作品数：2 被引量：19H指数：2
- 相关作者：谭碧玥曹福亮张洪娟陶园园王星星更多>>
- 相关机构：南京林业大学更多>>
- 发文基金：国家林业公益性行业科研专项江苏省自然科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 银杏GbGGPS基因的克隆及序列分析被引量：12
- 2013年
- 利用RACE技术克隆并获得了银杏牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶基因(GbGGPS基因)。银杏GbGGPS基因的cDNA全长为1 641 bp,含有1个1 176 bp的可读框,编码391个氨基酸序列。生物信息学预测GbGGPS蛋白的分子质量为42.51 ku,理论等电点为5.98,N端有叶绿体信号肽,其二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲组成。蛋白质同源分析表明,GbGGPS含有多聚异戊二烯基合成酶家族中保守的5个特征性结构域和2个富含天冬氨酸的区域。同源建模分析显示GbGGPS序列与薄荷GGPS蛋白的三维结构及活性位点高度相似。系统进化分析表明,银杏GGPS蛋白归属植物进化支,且与加拿大红豆杉、挪威云杉、北美冷杉的GGPS蛋白归为同一分支。
- 张洪娟谭碧玥曹福亮
- 关键词：银杏萜内酯蛋白质结构生物信息学分析
- 48个果用银杏品种SSR指纹图谱构建与遗传多样性分析被引量：7
- 2017年
- 随着银杏果用品种数量逐渐增多,依靠形态学区分已十分困难,构建一个快速有效的分子指纹图谱便显得尤为重要。本研究针对48个主要的银杏果用栽培品种,从本实验室自主开发的SSR引物中筛选出40对重复性高、多态性好的SSR引物对其进行PCR扩增。结果显示,40对SSR引物共扩增出136个等位基因,平均等位基因数为3.4。48个银杏品种的Nei's基因多样性指数(H)为0.467 9,Shannon's指数(Ⅰ)则为0.828 9,遗传多样性水平偏低,且表现出较强的"地域性",这与育种材料和育种手段的单一有着密切关系。最后,仅利用8对多态性高的SSR引物组合就成功构建了能区分48个银杏品种的指纹图谱,将为银杏种质资源的鉴定和遗传利用提供高效技术手段。
- 王星星周琦陶园园胥猛郁万文徐立安
- 关键词：银杏SSR指纹图谱
