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国家自然科学基金(31270663)

作品数:15 被引量:41H指数:4
相关作者:张凌云张通孙帆李长江周燕妮更多>>
相关机构:北京林业大学吉林大学山东省农业科学院更多>>
发文基金:国家自然科学基金国家科技重大专项转基因生物新品种培育专项更多>>
相关领域:农业科学生物学更多>>

文献类型

  • 15篇中文期刊文章

领域

  • 13篇农业科学
  • 3篇生物学

主题

  • 8篇胁迫
  • 7篇胁迫响应
  • 7篇基因
  • 5篇生物信息
  • 5篇生物信息学
  • 4篇生物信息学分...
  • 3篇植物
  • 3篇植物激素
  • 3篇逆境
  • 2篇蛋白
  • 2篇蛋白基因
  • 2篇逆境响应
  • 2篇转录
  • 2篇转录因子
  • 2篇克隆
  • 2篇蓝莓
  • 2篇基因表达
  • 2篇基因克隆
  • 2篇果实
  • 1篇抑制蛋白

机构

  • 14篇北京林业大学
  • 2篇吉林大学
  • 1篇山东省农业科...
  • 1篇西北农林科技...
  • 1篇教育部

作者

  • 14篇张凌云
  • 5篇李长江
  • 5篇孙帆
  • 5篇张通
  • 4篇周燕妮
  • 3篇崔晓燕
  • 3篇罗朝兵
  • 2篇李艳芳
  • 2篇鞠丹
  • 1篇张世宏
  • 1篇聂佩显
  • 1篇陈坤明
  • 1篇李巧玲
  • 1篇王红阳
  • 1篇张杰
  • 1篇胡安妮

传媒

  • 3篇林业科学
  • 3篇植物生理学报
  • 2篇北京林业大学...
  • 2篇东北林业大学...
  • 2篇生物技术通报
  • 1篇南京林业大学...
  • 1篇西北农林科技...
  • 1篇Journa...

年份

  • 1篇2020
  • 2篇2017
  • 3篇2016
  • 3篇2015
  • 5篇2014
  • 1篇2013
15 条 记 录,以下是 1-10
排序方式:
蓝莓转录因子VcMYB21在果实着色及幼苗UV处理中的响应被引量:5
2017年
本研究通过RACE-PCR从蓝莓中克隆得到一个R2R3-MYB转录因子,命名为Vc MYB21,该基因全长1 373 bp,编码区722 bp,编码233个氨基酸。生物信息学分析发现其理论分子量为58.37 k Da,p I值为5.12,中部有1个2Fe-2S结合域和1个EGF-like结构域,属于膜外蛋白,结构不稳定。酵母双杂交实验表明Vc MYB21蛋白无自激活活性,能自身形成同源二聚体。组织特异性表达实验显示Vc MYB21主要在蓝莓的果皮和叶片中表达。在蓝莓果实发育过程中,Vc MYB21基因的表达量整体呈下降趋势,在果实发育早期表达量最高,之后迅速下降,全红果时期略微上升;花青素的含量随果实发育持续上升,在紫果期达到最大。UV-B与UV-C处理均显著诱导Vc MYB21在蓝莓幼苗叶片组织中的表达,其中对UV-B处理更为敏感。UV-B处理5 min以及UV-C处理10 min均能显著诱导该基因的表达,随处理时间的延长,基因表达量下降;花青素的含量在基因表达量下降后迅速上升,之后花青素分解,积累量下降。这些研究结果表明Vc MYB21在UV处理后叶片花青素积累过程及蓝莓果实着色过程中可能发挥着负调控作用。
刘中帅袁义杭张通张凌云
关键词:蓝莓基因表达逆境响应
青杄CYP1基因的克隆与表达被引量:1
2015年
以青杄(Picea wilsonii)的c DNA文库为模板,根据青杄基因Pw CYP1的EST序列设计引物,通过RACE-PCR方法获取Pw CYP1的全长c DNA序列。生物信息学分析表明:Pw CYP1全长c DNA为962 bp,编码框为516 bp组成,编码一个171氨基酸的多肽,Protparam工具预测蛋白的分子量约为17.98 k Da,理论等点为8.34。组织特异性试验表明,Pw CYP1在青杄花粉中的表达量最高,种子中最少。花粉萌发试验显示,Pw CYP1在青杄花粉萌发中表达量先下降,在后期表达量重新上调。在青杄种子萌发试验中,Pw CYP1表达量先下降,在第4天达到最低值后表达量被上调。同时,Pw CYP1受脱落酸(abscisic acid,ABA)、茉莉酸甲酯(methyl jasmonate,Me JA)、赤霉素(Gibberellin,GA)、干旱和盐胁迫的诱导且表达量上调,这些结果显示Pw CYP1参与了发育及多种逆境胁迫和对激素的响应过程。
罗朝兵鞠丹刘中帅张凌云
关键词:植物激素
青杄PwUSP2基因的克隆和表达分析被引量:6
2015年
广泛逆境胁迫蛋白(USPs)参与碳缺乏、缺氧、干旱和高盐等多种非生物胁迫,但在植物中的研究尚不深入。本文通过RACE-PCR的方法获得青杄PwUSP2基因的c DNA全长,共987bp,其中编码区723 bp,共编码240个氨基酸。利用生物信息学工具对其理化性质、二级结构和三级结构进行分析,结果显示,该蛋白理论分子质量为26.84 kDa,理论等电点为4.61,有丝氨酸和苏氨酸结合位点,为非跨膜的亲水蛋白。PwUSP2具有USP家族典型的Usp A结构域,但无典型的ATP结合位点G-2X-G-9X-G[S/T]。RT-qPCR分析表明,PwUSP2在青杄花粉、果实、种子、成熟叶、幼叶、成茎中均有表达,在果实中表达量较高。同时,PwUSP2在脱落酸(ABA)、茉莉酸甲酯(MeJA)等非生物胁迫下表达量有明显变化,推测PwUSP2可能参与青杄对逆境胁迫的响应。
周燕妮李艳芳张通张凌云
关键词:胁迫响应
Cloning and expression analysis of a homologous expansin gene EXP2 in Picea wilsonii被引量:1
2016年
Expansins are cell-wall-loosening proteins that have multiple roles during plant development and stress- related processes. In this study, a novel expansin gene PwEXP2 was cloned by rapid amplification of cDNA ends based on the cDNA library of Picea wilsonii and EST fragment of PwEXP2. It was found that PwEXP2 coded 253 amino acids, and putative signal peptides exist at the N-terminal, followed by 8 cysteines, a HFD (His-Phe-Asp) conserved domain, and 4 tryptophan residues at the C-terminal. PwEXP2 was located in cytoplasm and nucleus when transformed in an onion epidermal cell. Quantitative real-time PCR assays showed that PwEXP2 was expressed in various tissues with a relatively high level in needles and low level in mature pollen. The expression level of PwEXP2 dramatically increased after seed germination. Gene expression profiles in abiotic stresses showed that PwEXP2 was induced by high temperature and osmotic stress but not involved in ABA-dependent signaling path- way. These results display the important roles of the PwEXP2 in plant development and multiple adversity stresses.
Tong ZhangYanfang LiYanni ZhouLingyun Zhang
关键词:EXPANSIN
青杆PwUSP1基因的克隆及表达模式分析被引量:2
2014年
广泛逆境胁迫蛋白(universal stress protein,USP)在非生物胁迫响应中起重要作用,但在植物中其功能还大部分未知。本研究通过BLAST分析青杆EST文库,得到USP基因的EST序列,通过RACE PCR方法获取USP基因的末端序列,经过与EST序列拼接得到USP基因的cDNA全长序列,命名为PwUSP1。分析发现PwUSP1全长cDNA为1 167 bp,编码区为519bp,编码172个氨基酸残基。生物信息学分析显示,PwUSP1编码的蛋白相对分子质量为19.07 kDa,理论等电点为6.38,为非跨膜的亲水性蛋白。PwUSP1具有USP家族典型的UspA结构域和ATP结合位点G-(2X)-G-(9X)-G(S/T)。半定量RT-PCR与RT-qPCR分析表明,PwUSP1在青杆的根、茎、针叶、花粉、种子中均有表达,在根和花粉中表达量较高。同时,PwUSP1受干旱和盐胁迫的诱导表达上调,均在处理6 h后表达量较高,推测该基因可能在青杆逆境胁迫响应中发挥作用。
崔晓燕李长江孙帆张世宏张凌云
关键词:青杆生物信息学分析胁迫响应
青杄PwPSAF基因的克隆与组织表达分析被引量:5
2013年
PSAF是绿色植物光系统Ⅰ反应中心F亚基,在光合作用电子迁移过程中起着重要作用。以青杄cDNA文库为模板,根据PwPSAF的EST序列设计引物,进行5'-RACE和3'-RACE试验,以获得青杄PwPSAF的末端序列,经过与EST序列进行拼接获取青杄PwPSAF的全长cDNA序列。基于其氨基酸序列,利用Expasy tools、DNAMAN、ClustalX和MEGA等工具,进行理化性质、二级结构和三级结构的生物信息学分析。结果表明:PwPSAF是一个由253 aa组成的蛋白质,理论分子量为27.04 kDa,等电点为9.57,预测蛋白有2个跨膜区域,蛋白质的C端具有保守的结构。RT-qPCR试验显示PwPSAF主要在青杄的针叶中表达。在种子萌发过程中吸胀期(0~ 2天)表达量最高,在4天时表达量降低,随着子叶的不断长出,其表达量又逐渐增高。在干旱和盐胁迫下,针叶中的PwPSAF的表达量被大幅下调。研究结果显示PwPSAF在青杄种子萌发及非生物逆境胁迫下的光合过程中起着重要作用。
李长江孙帆张通张凌云
关键词:生物信息学分析胁迫响应
青杄生长素抑制蛋白基因PwARP-1的克隆及表达分析被引量:3
2014年
从青杄的cDNA文库中筛选出一个生长素抑制蛋白基因PwARP-1(Auxin-repressed protein 1),并通过RACE-PCR技术获得PwARP-1 cDNA全长。生物信息学分析显示,PwARP-1基因编码155个氨基酸残基的蛋白,分子量为17.1 kD,理论等电点为10.07,富含无规则卷曲。以多年生青杄和青杄幼苗为研究材料,通过RT-qPCR技术检测PwARP-1的组织特异性表达、激素的响应模式及种子萌发过程中的表达量模式。结果表明,PwARP-1在青杄各个组织中均有表达,在花粉中表达量最高,在种子中的表达量最低。PwARP-1在种子萌发过程中表达量呈先上升,在第10天表达量达到最高后开始下降。进一步试验表明,PwARP-1能响应多种逆境胁迫和激素处理。在赤霉素(GA)和生长素(IAA)处理下PwARP-1的表达量被抑制。在干旱胁迫和油菜素内酯(BR)激素处理下PwARP-1的表达量逐渐升高,而在在盐胁迫、茉莉酸甲酯(MeJA)和脱落酸(ABA)等激素处理下PwARP-1的表达量先下降后上升。这些结果显示PwARP-1可能参与了植物种子萌发、多种逆境胁迫和激素响应过程。
孙帆罗朝兵周燕妮张凌云
关键词:植物激素
青杄干旱诱导基因PwWDS1的cDNA分离与表达分析被引量:2
2014年
植物干旱诱导蛋白是植物体在遭遇干旱胁迫或缺水胁迫时被诱导表达或者表达量被上调的一类蛋白,通过直接作用或者调节其他基因的表达来使植物适应干旱逆境(Desclos et al.,2008;Urao et al.,1994)。这类蛋白在功能上分为2类:其一为功能蛋白,在细胞内直接参与保护作用。
李长江崔晓燕孙帆张凌云
关键词:WDS生物信息学分析胁迫响应
青杄PwWrbA基因克隆及表达分析被引量:1
2014年
色氨酸阻遏结合蛋白(tryptophan repressor-binding protein,WrbA)是一种重要的抗氧化酶类,参与了多种逆境反应。笔者通过RACE-PCR的方法克隆得到青杄WrbA基因的cDNA全长,共1 045 bp,编码区651 bp,编码203个氨基酸。利用生物信息学工具对其进行理化性质、二级结构和三级结构的分析,该蛋白理论分子质量21.80 ku,pI值6.43,N端11—15位氨基酸和C端112—165位氨基酸是FMN结合位点。荧光定量PCR和半定量RT-PCR发现青杄PwWrbA在各组织中都有表达,但在针叶中表达量最高。同时,PwWrbA在NaCl和ABA胁迫处理后表达量升高,H2O2也会影响其表达的改变,H2O2处理6 h后表达量上调。因此,PwWrbA是一个新的WrbA基因,推测其可能在青杄逆境胁迫应答中发挥作用。
张通周燕妮李长江张凌云
关键词:生物信息学胁迫响应
蓝莓果实花青苷积累与内源激素含量动态变化被引量:14
2017年
为明确蓝莓果实花青苷积累与内源激素含量动态变化,本研究以5年生高丛蓝莓品种‘日出’和‘喜来’的果实为试验材料,运用高效液相色谱法(HPLC)、气相色谱法、示差法等技术,测定了果实中花青苷含量、可溶性糖含量与5大内源激素(玉米素(ZT)、脱落酸(ABA)、吲哚乙酸(IAA)、赤霉素(GA3)、乙烯(ETH))含量的变化规律并分析其相关性。结果表明,对整个蓝莓果实生长发育期间可溶性糖含量进行HPLC分析测定显示,蓝莓果实发育过程中主要以积累葡萄糖和果糖为主,蓝莓果实中可溶性糖的积累主要在果实发育后期。通过气相色谱测定蓝莓果实的ETH含量和ELISA试剂盒测定IAA、GA3、ZT、ABA显示,GA3与ZT含量较低,整体是先上升后下降的趋势,在果实发育中期出现一个峰值,IAA含量在蓝莓生长发育的过程中整体呈下降趋势,与之相反,蓝莓果实内ABA与ETH的含量变化总体呈上升的趋势。对整个蓝莓果实生长发育期间的花青苷含量、可溶性糖含量和内源激素含量3者之间进行相关性分析显示,ABA和ETH为糖类物质重要诱导因子,共同促进果实成熟和花青苷积累,IAA抑制糖类物质的积累和花青苷的合成,而GA3对糖类物质及花青苷的合成积累调控作用不明显,ABA、IAA和ETH等激素协同调控果实成熟过程。
李艳芳聂佩显张鹤华王力王红阳张凌云
关键词:蓝莓果实花青苷可溶性糖内源激素
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