四川省应用基础研究计划项目(03JY029-074-1)
- 作品数:4 被引量:32H指数:2
- 相关作者:张林李英碧廖淼陈国弟侯一平更多>>
- 相关机构:四川大学更多>>
- 发文基金:四川省应用基础研究计划项目美国中华医学基金更多>>
- 相关领域:医药卫生生物学政治法律更多>>
- 6FAM-HEX-TMR-ROX四色荧光分析体系的构建被引量:2
- 2006年
- 目的 为在310基因分析仪上进行6FAM—HEX—TMR—ROX四色荧光STR复合扩增分型建立基础条件。方法 以pGEM载体作为靶DNA,设计引物扩增获得500~80bp的13个长度不等DNA片段,以这些片段纯化物作为模板DNA,分别扩增获得6FAM、HEX、TMR和ROX标记的Matrix标准物,用4种Matrix标准物在310基因分析仪上构建可用于6FAM-HEX-TMR-ROX四色荧光分析的Matrix文件。结果 扩增所得的13个非标记片段,长度分别为80、100、120、140、160、180、200、220、260、300、340、400、500bp,在非变性聚丙烯酰胺凝胶连续电泳-银染凝胶上均表现为单条带,6FAM、HEX、TMR、ROX分别标记的片段通过310基因分析仪检测均为单峰。混合ROX标记的80、120、180、220、260、300bp的6个片段获得的内标,显示出良好的线性关系。结论 建立了有效的6FAM-HEX-TMR-ROX四色荧光分析Matrix,为进行多个STR基因座荧光标记复合扩增检测奠定了基础。
- 刘莉吴谨侯一平张霁戴浩霖廖淼张林陈国弟李英碧
- 关键词:法医物证学荧光分析内标
- STR基因座荧光标记复合扩增检测及其法医学应用被引量:9
- 2005年
- 目的建立荧光标记复合扩增检测4个STR基因座的方法,应用于法医学亲权鉴定与个人识别。方法用6-FAM标记D3S1754引物,HEX标记D4S2366和D12S375引物,TMR标记D1S549引物,PCR复合扩增,310基因分析仪电泳自动收集电泳结果数据,GeneScanAnalysisSoftware3.7NT计算扩增产物片段相对大小,Genotyper誖3.7NT软件进行样本基因型分型。将该方法应用于法医学亲权鉴定与个人识别。结果建立了荧光标记复合扩增检测4个STR基因座基因型的方法,具有良好的稳定性和较好的灵敏度,分型结果准确。结论研究建立的方法操作简便,分型结果稳定可靠,可用于遗传多态性研究和法医学亲权鉴定与个人识别。
- 李英碧吴谨侯一平张霁廖淼张林陈国弟
- 关键词:STR基因座法医学应用GENESCAN亲权鉴定分型结果基因型分型
- 荧光标记复合扩增检测4个STR基因座多态性被引量:1
- 2005年
- 目的建立荧光标记复合扩增D1S2142,D13S1492,D14S306,D15S659基因座检测分型方法,并对成都汉族群体4个基因座的遗传多态性进行调查。方法用6-FAM标记D1S2142和D15S659引物,HEX、TMR分别标记D14S306和D13S1492引物,PCR复合扩增,310基因分析仪电泳自动收集电泳结果数据,GeneScan Analysis Software3.7NT软件计算扩增产物片段相对大小,Genotyper(3.7NT软件进行样本基因型分型,建立了荧光标记复合扩增检测4个STR基因座基因型的方法,对145名成都汉族无关个体样本进行分型。结果荧光标记复合扩增D1S2142,D13S1492,D14S306,D15S659基因座,每个STR基因座都获得了清晰的基因型分型结果。145份样本,4个STR基因座分别检出10,14,7,12个等位基因和22,54,21,39种基因型,其基因型分布均符合Hardy-W e inberg平衡。4个基因座在成都汉族群体的杂合度分别依次为0.7793,0.8345,0.7793和0.8345;多态信息含量分别依次为:0.7656,0.8730,0.7470和0.8312。累计非父排除率为0.9783,累计个人识别机率为0.9999 917。结论荧光标记复合扩增D1S2142,D13S1492,D14S306,D15S659基因座,可实现对每个基因座准确分型;成都汉族群体该4个基因座的遗传学数据,可为群体遗传学和法医学研究与应用提供基础资料。
- 李英碧吴谨侯一平张霁廖淼张林陈国弟
- 关键词:法医物证学复合扩增基因座基因频率
- 成都汉族群体15个短串联重复序列基因座遗传多态性被引量:20
- 2005年
- 目的 获得15个短串联重复(short tandem repeat,STR)基因座在成都汉族群体的群体遗传学数据。方法 2 10份EDTA抗凝血样采自成都地区无血缘关系的汉族个体。Chelex法提取DNA,PCR复合扩增,自动基因分析仪电泳收集电泳结果数据,基因扫描分析软件计算扩增产物片段相对大小,基因分型软件进行样本基因型分型。结果 全部样本的每个STR基因座都获得了清晰的基因型分型结果。15个STR基因座的杂合度介于0 .5 2 9~0 .881之间。累计非父排除率和累计个人识别机率为0 .999998和7.3×10 - 1 7。结论 经一次扩增电泳可获得15个STR基因座的基因型分型结果并明确样本性别。累计非父排除率和累计个人识别机率较高,适用于法医学亲权鉴定和个人识别。
- 李英碧吴谨侯一平张霁廖淼张林陈国弟
- 关键词:汉族群体遗传多态性EDTA抗凝无血缘关系基因型分型
- 常染色体STR基因座的荧光标记复合扩增检测
- 目的检测常染色体STR基因座遗传标记,建立荧光标记复合扩增STR基因座分型技术。方法以310基因分析仪为平台,建立了进行6FAM-HEX-TMR-ROX四色荧光分析的技术条件,用6FAM、HEX和TMR标记STR基因座引...
- 李英碧吴谨侯一平张霁廖淼张林陈国弟
- 文献传递