浙江省自然科学基金(R305333)
- 作品数：11 被引量：84H指数：6
- 相关作者：张德民潘志崇钱丽君王龙刚王一农更多>>
- 相关机构：宁波大学宁波出入境检验检疫局更多>>
- 发文基金：浙江省自然科学基金教育部科学技术研究重点项目宁波市科技计划项目更多>>
- 相关领域：生物学农业科学环境科学与工程化学工程更多>>
- 膜过滤细胞直接计数新方法
- 2010年
- 介绍了两种膜过滤细胞直接计数新方法,即不透明滤膜的金相显微镜细胞直接计数法和透明滤膜的生物显微镜细胞直接计数法的基本原理、仪器设备、分析和计算方法,并且将此方法与荧光显微镜细菌计数、血球计数板等方法进行了比较。实际计数结果表明,两种膜过滤细胞直接计数法配合了独特的酸碱处理法以分散聚团细胞,用于非环境样品细胞浓度的测定具有快速准确简便的特点。此外,该方法基本不受细胞大小的影响,除了适用于体型较大的藻类、酵母菌的快速计数以外,还可以清晰地分辨诸如光合细菌这样体积较小的细菌。
- 章文军张德民陆一平
- 关键词：膜过滤生物显微镜金相显微镜
- 应用DGGE分析三疣梭子蟹养殖塘底泥细菌的多样性被引量：23
- 2007年
- 将传统的菌落菌体形态分类方法与分子生物学方法相结合研究了三疣梭子蟹养殖塘底泥中一个细菌类群的多样性。首先采用平板稀释法对三疣梭子蟹养殖塘底泥中的细菌进行分离与纯化,根据各菌株的菌落形态特征初步将118株分离物分为8个类群,其中最大的一个类群的菌落基本特征为圆形、边缘整齐、表面凸起、菌落有光泽,对该类群的细菌多样性分析表明,通过芽孢染色可将产芽孢菌和不产芽孢菌区分开,不产芽孢菌根据其菌体形态又分为3个亚群,其中卵圆形细菌是最大的一个亚群,共有16株。应用PCR-DGGE方法对该类群进行菌株的遗传多样性分析。结果表明,卵圆形类群16株细菌中就有11株不同系统发育型的细菌。最后,将这11株细菌进行了16S rDNA部分序列(约750bp)的测定,并做系统发育学分析,结果显示,这些细菌的系统发育学地位相距很远,分属于γ-Proteobacteria、α-Proteobacteria和Firmicutes等类群。试验结果表明,以菌落特征的差异来挑选不同的菌株作为分析细菌多样性的第一个筛选步骤,会大大低估可培养异养细菌的多样性。
- 钱丽君张德民徐小红
- 关键词：三疣梭子蟹异养细菌RDNA
- 一株反硝化光合细菌的生物学特性及系统发育分析被引量：20
- 2011年
- 【目的】养殖水体中亚硝酸盐的过量积累会对养殖生物产生毒害作用,应用脱氮细菌去除亚硝酸盐是养殖水质调控的重要手段之一,本文意在得到一株高效去除亚硝酸盐的光合细菌。【方法】采用软琼脂稀释法分离纯化光合细菌菌株,通过电镜观察、生理生化试验研究其生物学特性、依据16S rDNA和光合反应中心M亚基基因(Gene coding for photosynthetic reaction center subunit M,pufM)序列对其做系统发育分析。【结果】从淡水养殖塘中分离筛选到一株高效还原亚硝氮的光合细菌菌株wps。该菌株为革兰氏阴性菌,细胞杆状,大小为0.4-0.6μm×1.5-4.0μm,极生丛生鞭毛,片层状光合内膜,兼性厌氧光照条件生长,单菌落及液体培养物呈红色,含细菌叶绿素a和类胡萝卜素。最适生长pH范围为5.5-8.5,最适生长盐度范围为0-2%,最适生长温度范围为25℃-38℃。菌株wps与Rhodopseudomonas palustris的16S rDNA序列相似性为98.9%,光合反应中心M亚基基因序列的相似性为94.9%,但是二者在生物学性质上有较大差异,如菌株wps在pH5.5生长,不能光自养生长,不利用柠檬酸盐、甲酸盐进行光异养生长,需盐酸硫胺素和泛酸钙做生长因子等。【结论】菌株wps可能为Rhodopseudomonas属的一个新种,且在养殖水体水质调控中具有重要应用前景。
- 陈慧张德民王龙刚潘志崇
- 关键词：光合细菌红假单胞菌亚硝酸盐反硝化
- 一株反硝化光合细菌的生物学特性及系统发育分析
- 养殖水体中亚硝酸盐的过量积累会对养殖生物产生毒害作用,应用脱氮细菌去除亚硝酸盐是养殖水质调控的重要手段之一。从淡水养殖塘中分离筛选到一株可高效还原亚硝氮的光合细菌,命名为wps。该菌株为革兰氏阴性菌,细胞杆状,菌体大小为...
- 陈慧张德民王龙刚潘志崇
- 关键词：光合细菌红假单胞菌亚硝酸盐反硝化
- 文献传递
- 中华鳖体表和体内菌群多样性分析被引量：2
- 2010年
- 采用16S rDNA分析方法,分别提取中华鳖体表和体内细菌总DNA,以之为模板进行PCR扩增获得细菌16S rDNA基因片段,并构建16S rDNA克隆文库。从2个文库中分别随机选取100个重组克隆子,抽提重组质粒,用HaeⅢ和MspⅠ限制性内切酶进行酶切,获得酶切指纹图谱,从每种图谱随机挑选克隆子测序,获得其16S rDNA部分序列,构建了系统进化树。在中华鳖体表和体内细菌克隆文库中分别包含13种和10种RFLP谱型,分别挑选了70个和60个克隆子进行测序。结果表明,中华鳖体表和体内文库克隆子分别归为15类和11类OTU,体表和体内菌群多样性较强,优势细菌类群分别为拟杆菌和变形菌,并在文库中检测到了几株益生菌和条件致病菌。
- 胡广洲李登峰苏秀榕李太武贺静静
- 关键词：中华鳖RDNARFLP细菌多样性
- 溶藻弧菌相关分离株的分子及VITEK鉴定被引量：12
- 2012年
- 哈维群弧菌是弧菌属的核心菌群,包括溶藻弧菌在内的6个种在表型和遗传型上均十分相似,要准确鉴定各种有一定难度。看家基因的研究及生化鉴定系统的出现为弧菌鉴定提供了多种方法,本文比较了16S rRNA基因、toxR基因和pyrH基因以及VITEK 2 COMPACT GN鉴定卡对溶藻弧菌相关分离株的分辨力。哈维群弧菌基因组内16S rRNA基因是多拷贝的,且拷贝间序列差异大于种间差异,不适用于种的鉴定。单拷贝基因toxR和pyrH序列种内差异均小于种间差异。基于toxR基因相似性比较可清楚地将18个疑似溶藻弧菌分离株和5个参比株归并到4个种;toxR基因系统发育学分析也显示,哈维群弧菌各种独立地聚类分支,且溶藻弧菌种内存在两个明显的聚类分支,说明两个分支的溶藻弧菌具有独立的进化方向。pyrH基因的相似性比较和发育学分析也得到类似的结果,但pyrH基因具有较强的保守性,因而分辨力稍低于toxR基因。VITEK 2 COMPACT GN鉴定卡在鉴定溶藻弧菌时也有一定的错误率,且鉴定谱较窄。因此,建议在实际应用中采用toxR基因比对作为溶藻弧菌快速鉴定的主要手段,可再选用pyrH基因对鉴定结果进行验证。
- 郭静Liswaniso Gadafii郭安南阎永伟张德民裘琼芬黄素文戴海平
- 关键词：溶藻弧菌RDNA
- 复合载体固定亚硝酸盐氧化菌处理养殖废水被引量：3
- 2013年
- 利用新型复合载体固定亚硝酸盐氧化菌,确定了挂膜条件,考察了水力停留时间对NO-2-N去除率的影响,并进行对虾养殖水处理。结果表明,新型载体可以较好地固定亚硝酸盐氧化菌,在水力停留时间为12 h、6 h、3 h、1h的条件下,NO-2-N的最大去除率分别为100%、98.77%、90.59%、59.02%。在HRT为1 h时,固定化的亚硝酸盐氧化菌可以高效去除养殖水体中的NO-2-N,去除率达76.94%。
- 马寿光郭安南章文军张德民
- 关键词：亚硝酸盐氧化菌水力停留时间养殖废水
- 一株高效去除亚硝酸氮细菌的分离鉴定及其脱氮特性研究被引量：12
- 2013年
- 【目的】从南美白对虾养殖塘中分离到高效去除亚硝酸氮的细菌,对其分类和脱氮特性进行了研究。【方法】以除亚硝酸氮为主要指标,取养殖塘底层水样分离筛选菌株;依据16S rRNA基因序列和生理生化特征初步鉴定菌株;研究不同碳源、碳氮比、起始pH、温度、摇床转速和氯化钠浓度对反硝化除亚硝酸氮的影响,并考查了菌株对硝酸氮和氨氮的利用情况。【结果】得到的菌株中菌株FP6活性最高,初步鉴定菌株FP6属于地衣芽孢杆菌。菌株FP6的生长最适脱氮碳源为蔗糖,菌株FP6去除亚硝酸氮有高活性的条件范围为:C/N值15 25、起始pH 7.0 10.0、温度20°C 37°C、摇床转速0 200 r/min和氯化钠浓度0 40 g/L。菌株FP6对硝酸氮和氨氮都有一定的去除能力,利用硝酸氮时不积累亚硝酸氮。【结论】地衣芽孢杆菌FP6具有优良的除亚硝氮特性,适宜的温度、pH和盐度范围较宽。
- 聂欢欢赵群芬李长红王一农张德民
- 关键词：亚硝酸氮地衣芽孢杆菌脱氮
- 一株新属紫色非硫光合细菌的初步鉴定被引量：1
- 2008年
- 利用特异性培养基对采自宁波象山地区养殖虾池底泥样品进行富集、分离和纯化,得到了一株紫色非硫细菌(PNSB),依据形态特征观察、无机碳源利用、活细胞吸收光谱测定、pufM基因检测及16S rRNA基因序列分析等实验,初步鉴定其为comamonadaceae科中一新属.
- 王龙刚潘志崇张德民
- 关键词：紫色非硫光合细菌RDNA
- 原核生物16S rRNA基因多重拷贝及其序列异化被引量：6
- 2013年
- 核糖体小亚基RNA(16S rRNA)分子存在于所有细胞生物中,在细胞中执行恒定的功能,其分子序列既有高度保守性片段,又有相对可变性部分,因而成为研究原核生物系统发育的理想分子,其基因已成为原核生物系统分类学研究的核心标识基因。但是,近年来的大量研究表明,原核生物基因组内16S rRNA基因是多拷贝的。16SrRNA基因拷贝数在种属水平上基本是稳定的,但在更高分类阶元上则是不确定的。在拷贝数多的菌株中各拷贝间还存在差异,这种差异有时会大于不同菌株间甚至不同种间的差异。原核生物基因组内16S rRNA基因拷贝数和异化与其利用环境资源的生态策略和对环境的适应性有关。原核生物16S rRNA基因拷贝数及其异化研究对深入理解原核生物的环境生态功能具有重要意义。
- 阎永伟张德民
- 关键词：原核生物RRNA基因异化
