湖南省自然科学基金(04JJ3102)
- 作品数:3 被引量:12H指数:2
- 相关作者:田勇泉刘仲奇张秋红彭聪周鸣更多>>
- 相关机构:中南大学北京大学第三医院更多>>
- 发文基金:湖南省自然科学基金国家自然科学基金首都医学发展科研基金更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 纯化鼻咽组织全基因组表达谱在筛选鼻咽癌相关靶基因中的应用被引量:6
- 2005年
- 目的:通过全基因组寡核苷酸基因芯片构建鼻咽部纯化组织基因表达谱,筛选鼻咽癌相关靶基因。 方法:采用RNA保护技术保护组织标本,显微切割纯化分离鼻咽癌组织标本中的癌细胞、鼻咽部非癌组织标本中 的黏膜上皮细胞,提取每一例纯化组织标本RNA,线性扩增获得足量aRNA,标记探针后与HG U133.Plus2.0杂 交,构建每一例鼻咽部纯化组织标本基因表达谱,通过组间信息比对筛选鼻咽癌相关靶基因。结果:鼻咽癌组与非 鼻咽癌组基因表达谱比对,筛选出了与鼻咽癌发病相关的候选靶基因。通过鼻咽癌标本中颈部转移组和非颈部转 移组表达谱比对,找出了与鼻咽癌颈部淋巴结转移相关的候选靶基因。结论:利用全基因组基因芯片构建基因表 达谱,可准确、高效地筛选出鼻咽癌相关的候选靶基因。
- 刘仲奇田勇泉黄河周厚德张秋红周鸣彭聪李小玲李桂源
- 关键词:鼻咽癌显微切割基因芯片靶基因
- 染色体分离基因在纯化鼻咽癌组织中的表达被引量:1
- 2007年
- 目的研究染色体分离基因(homosapiens chromosome segregation gene,CSE1L)在纯化鼻咽癌及非癌组织中的表达。方法首先从全基因组表达谱中筛选到鼻咽癌候选癌基因CSE1L。结合RNA保护、显微切割及线性扩增技术,获得纯化鼻咽组织中反义RNA(antisense RNA,aRNA),采用半定量逆转录聚合酶链式反应(semi-quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction,sqRT-PCR)研究从全基因组表达谱中筛选的候选癌基因—CSE1L在两种不同纯化鼻咽组织aRNA中的表达。结果在纯化鼻咽癌组织和鼻咽部非癌组织全基因组表达谱中,CSE1L基因表达值分别为1.056±0.296和0.465±0.835,相差2.27倍,两组比较有显著性差异(df=16,t=4.317,P=0.001<0.01)。sqRT-PCR检测纯化鼻咽癌组织及非癌组织aRNA中CSE1L基因的表达,分别为1.740±1.105和0.618±0.183,两组比较有显著性差异(df=30,t=3.159,P=0.004<0.01)。结论利用全基因组芯片构建基因表达谱可筛选到鼻咽癌发病相关的候选靶基因,sqRT-PCR可验证芯片杂交结果,CSE1L基因是鼻咽癌发生、发展过程中重要的候选癌基因。
- 刘仲奇田勇泉刘俊秀张迎宏马芙蓉胡永芳
- 关键词:鼻咽肿瘤显微切割芯片分析技术染色体分离逆转录聚合酶链式反应
- 肿瘤基因组学研究中纯化技术的应用与发展被引量:6
- 2004年
- 为了获得尽可能纯净的肿瘤组织、细胞用于肿瘤基因组学研究,人们发展了一系列的肿瘤组织纯化技术。从各种手工显微切割纯化技术,到借助各种机械手段并经显微切割纯化肿瘤组织,再发展到激光技术在组织纯化领域内的全面应用,推动了肿瘤基因组学研究的发展。每一种纯化技术都有其各自的优势与不足,究竟采取哪种方式,取决于研究者对实验的要求以及研究者所处的环境条件。
- 刘仲奇田勇泉
- 关键词:纯化显微切割