中国博士后科学基金(20090451404)
- 作品数：3 被引量：20H指数：3
- 相关作者：巩振辉李大伟陈儒钢尹延旭朱文超更多>>
- 相关机构：西北农林科技大学更多>>
- 发文基金：中国博士后科学基金陕西省“13115”科技创新工程重大科技专项国家教育部博士点基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 辣椒冷诱导差异表达基因分析被引量：3
- 2010年
- 采用cDNA-AFLP技术分析了4℃低温诱导前后耐寒辣椒(Capsicumannuum L.)品系P70的基因表达差异谱。结果获得了120个差异片段,对阳性克隆中的12个差异片段进行测序和Blast-x比对,发现其中有4个片段(KH-1、KH-2、KH-3和KH-4)与抗逆性相关,其碱基数分别为185、160、269和511 bp,4个片段分别与编码抗坏血酸过氧化物酶基因的同源性达98%、与细胞色素p450基因的同源性达98%、与牛血清蛋白(BSA)基因的同源性达94%、与水孔通道蛋白(AQP)基因的同源性达90%。4个差异基因表达模式为:基因KH-1、KH-2、KH-3上调表达,KH-4下调表达。
- 朱文超巩振辉陈儒钢李大伟尹延旭
- 关键词：辣椒CDNA-AFLP
- 辣椒水通道蛋白基因CaAQP的克隆与序列分析被引量：14
- 2010年
- 【目的】分析辣椒水通道蛋白基因CaAQP的序列特征,并研究其在抗寒品种P70中经4℃低温胁迫处理后的表达模式,为探讨辣椒的耐寒机理及辣椒品种耐寒性改良积累资料。【方法】利用RACE技术进行cDNA全长克隆,采用生物信息学软件分析克隆基因的编码蛋白特性,并以4℃低温胁迫处理不同时间的抗寒品种P70为材料,利用Realtime-PCR分析所克隆基因在辣椒低温胁迫前后的表达模式,以25℃处理为对照。【结果】在4℃低温胁迫处理后的耐寒辣椒品种P70叶片中分离到与水通道蛋白基因相关的差异表达片段,并利用RACE技术克隆得到该基因的全长cDNA,命名为CaAQP,登录号为GU116569。序列分析表明,该基因大小为1032bp,含5′非编码区为69bp,3′非编码区为210bp,CDS长753bp,编码250个氨基酸,蛋白分子量为25.7kD。应用生物信息学软件对CaAQP分析表明,CaAQP含有6个跨膜区,有2个NPA单元,其氨基酸残基与MIP家族蛋白保守区序列完全一致。氨基酸序列比对发现,该序列与其它物种TIP类液泡膜水通道蛋白氨基酸序列有很高的同源性。聚类分析表明,CaAQP与番茄液泡膜水通道蛋白遗传距离最近,与禾本科的玉米和大麦遗传距离相对较远。Realtime-PCR分析结果证实,该基因在低温胁迫下呈现下调表达的趋势。【结论】利用cDNA-AFLP并结合RACE技术首次在耐寒辣椒品种中克隆了水通道蛋白基因CaAQP,该基因属于MIP蛋白家族的一员,具有其典型的功能域,表达模式分析表明,该基因在低温胁迫过程中具有重要的调控作用,该研究结果为进一步探讨辣椒逆境胁迫过程中基因表达调控机制提供了重要信息。
- 陈儒钢朱文超巩振辉李大伟尹延旭逯明辉
- 关键词：辣椒水通道蛋白基因克隆REAL
- 辣椒多聚半乳糖醛酸酶基因CaPG的克隆与序列分析被引量：3
- 2010年
- 以耐贮辣椒品系P98为材料,采用RACE方法,首次获得辣椒果实多聚半乳糖醛酶(PG)基因的全长cD-NA,命名为CaPG,登录号为FJ596175。序列分析结果表明,该基因cDNA长1 668 bp,5′非编码区为119 bp,3′非编码区为442 bp,CDS长1 107 bp,编码368个氨基酸。Blast比对发现,该基因核苷酸序列与已报道的番茄和番木瓜PG基因具有84%和85%的相似性。聚类分析表明,该基因与番茄和番木瓜的亲缘关系较近,与拟南芥PG基因的亲缘关系较远。
- 陈儒钢杨瑞平巩振辉李大伟SHA Hjahan
- 关键词：多聚半乳糖醛酸酶基因克隆辣椒
