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国家自然科学基金(31071203)

作品数:9 被引量:14H指数:2
相关作者:阴彬彭小忠张靖韩为杨彬更多>>
相关机构:中国医学科学院基础医学研究所中国医学科学院北京协和医学院北京协和医学院更多>>
发文基金:国家自然科学基金更多>>
相关领域:医药卫生生物学更多>>

文献类型

  • 9篇中文期刊文章

领域

  • 8篇医药卫生
  • 1篇生物学

主题

  • 3篇细胞
  • 2篇小鼠
  • 2篇基因
  • 2篇非编码
  • 2篇大脑
  • 1篇蛋白
  • 1篇凋亡
  • 1篇应激反应
  • 1篇原位
  • 1篇原位杂交
  • 1篇脂质体
  • 1篇脂质体转染
  • 1篇质谱鉴定
  • 1篇神经干
  • 1篇神经干细胞
  • 1篇神经胶质
  • 1篇神经胶质瘤
  • 1篇神经胶质瘤细...
  • 1篇生物信息
  • 1篇生物信息学

机构

  • 6篇中国医学科学...
  • 3篇中国医学科学...
  • 2篇北京协和医学...
  • 1篇河北北方学院

作者

  • 9篇阴彬
  • 6篇彭小忠
  • 5篇张靖
  • 2篇杨彬
  • 2篇赵阿妮
  • 2篇韩为
  • 1篇刘雪梅
  • 1篇谈小超
  • 1篇刘枭
  • 1篇叶飞
  • 1篇吴朝
  • 1篇王明
  • 1篇包雯
  • 1篇李爱花
  • 1篇朱丽媛
  • 1篇舒鹏程
  • 1篇林细华
  • 1篇袁建刚
  • 1篇夏启胜
  • 1篇赵祥宇

传媒

  • 6篇基础医学与临...
  • 2篇中国医学科学...
  • 1篇Chines...

年份

  • 1篇2018
  • 5篇2013
  • 3篇2011
9 条 记 录,以下是 1-9
排序方式:
小鼠脑皮质神经干细胞体外培养及miRNAs影响其分化能力被引量:6
2011年
目的系统建立小鼠脑皮质神经干细胞(NSCs)体外培养的技术平台,并探索一组microRNA对NSCs分化能力的影响。方法胎鼠(E14)脑皮质分离NSCs进行体外培养;免疫荧光法检测NSCs向神经元和星型胶质细胞的自然分化;Real-time定量PCR筛选一组分化前后表达水平有显著性差异的microRNA;应用新一代脂质体高效转染NSCs,将该组microRNA或其抑制物导入NSCs;Western blot检测导入的RNA序列对NSCs分化能力的影响。结果基于小鼠NSCs体外培养模型,筛选出一组NSCs分化前后表达水平存在显著性差异的microRNA(miR-124,137,128)。Western blot结果显示miR-124的反义链能够明显下调β-tubulinⅢ的表达(P<0.01),过表达miR-137和miR-128后β-tubulinⅢ的表达量有所升高。结论脂质体转染技术能够将miRNAs高效导入NSCs中;microRNA-124,137,128能够影响NSCs的分化。
赵祥宇舒鹏程张靖阴彬彭小忠
关键词:神经干细胞脂质体转染分化
肠道病毒71型的全长cDNA感染性克隆的构建与鉴定
2013年
目的构建一株肠道病毒71型的全长cDNA克隆并验证感染性。方法用长片段高保真RT-PCR方法扩增肠道病毒71型87-2008 Xi'an株的cDNA,装入pBR322载体。将该克隆线性化,体外转录后转染RD细胞后,通过观察CPE及RT-PCR验证其感染性。随后利用空斑法测定拯救病毒的一步生长曲线。结果成功构建了肠道病毒71型87-2008 Xi'an株的全长cDNA克隆;体外转录及转染RD细胞60 h后可观察到明显的CPE现象;RT-PCR在转染RD细胞中检测到病毒的存在;成功利用空斑法测定了拯救病毒的一步生长曲线,最大滴度达到2×107pfu/mL。结论成功构建了肠道病毒71型87-2008 Xi'an株的全长cDNA克隆并验证了其感染性,同时测定了拯救病毒的一步生长曲线,与野生型病毒相近。
王冠洲叶飞赵阿妮韩为阴彬彭小忠
关键词:肠道病毒71型感染性克隆
Recombinant Expression and Purification of Mouse Nectin-like 4 Glycoprotein in 293ET Cell Line
2018年
Objective To screen the transient and stable cell lines with high production of Nectin-like 4(Necl-4)protein.Methods First,c DNA sequences encoding the extracellular domain of Necls were cloned into the modified vector p APtag at the N terminus of alkaline phosphatase(AP)for fusion expression.Next,293ET cells stably expressed Necls-AP fusion protein and secreted it into the culture medium which were detected by the AP activity assay and Western blot analysis.Then,by adding N-glycosylation processing inhibitor kifunensine into the medium,complex glycan was inhibited to generate.The residual glycan of purified protein was removed by endoglycosidase H.Finally,AP protein was removed by using human rhinovirus protease and size exclusion chromatography.The concentration of purified Necl-4 protein was monitored by measuring the absorbance at280 nm and analyzed by SDS-PAGE.Results The transient and stable cell lines with high production of Necl-4 protein were screened by the color reaction with the AP-tag in the recombinant vector.The soluble and active form of purified Necl-4 protein was obtained after deglycosylation of native N-glycan protein with an expression level of 4 mg/L culture and purity of 95%.Conclusions By using modified AP mammalian protein expression system,we can easily screen the high productive stable cell lines by using AP activity assay.By adding mannosidase inhibitor kifunensine into the medium and cutting purified protein by using endoglycosidase H,we can obtain deglycosylated Necl-4 protein in milligram quantities.Our method might throw a light on the expression and purification of glycoprotein for structural and functional studies.
李冬冬安泰刘枭阴彬彭小忠舒鹏程
关键词:IMMUNOGLOBULINGLYCOSYLATION
miR-16促进Neuro2a细胞的凋亡
2011年
目的检测过表达miR-16对小鼠Neuro2a细胞周期和凋亡的影响,探讨miR-16在肿瘤发病过程中的可能机制。方法 构建能够在细胞中过表达miR-16的真核表达载体pcDNA3.1-miR-16,利用Real-time PCR验证了表达载体的过表达效应。应用pcDNA3.1-miR-16载体转染Neuro2a细胞,利用流式细胞术和TUNEL法检测Neuro2a细胞周期及凋亡改变情况。结果 转染过表达pcDNA3.1-miR-16载体后,成熟的miR-16表达与对照组相比明显升高(P<0.05)。在Neuro2a细胞中过表达miR-16后,用流式细胞术检测发现,Neuro2a细胞周期未见明显改变,与对照组相比,凋亡细胞数量有显著增加;进一步通过TUNEL法验证,发现miR-16的过表达能够促进Neuro2a的细胞凋亡。结论 过表达miR-16能够显著促进Neuro2a细胞凋亡而对细胞周期并无影响,提示miR-16可能对肿瘤治疗起作用。
刘畅刘伟刘伟王明阴彬
关键词:细胞周期凋亡肿瘤
神经接头蛋白Dok6下游作用蛋白的鉴定及初步功能分析
2013年
目的 Dok6下游作用蛋白的鉴定和初步功能分析。方法利用anti-Dok6的抗体进行免疫共沉淀实验,然后通过Western blot,银染分析,质谱鉴定以及后续的生物信息学预测及分析其潜在的生理功能。结果本实验得到了26个可能与Dok6发生直接或间接相互作用的蛋白,这些蛋白分别参与了体内众多的生理过程。为了缩小研究范围,选取了与神经系统发育及细胞内信号传导相关的9个蛋白作为研究对象进行后续的功能研究。结论通过质谱鉴定以及生物信息学综合分析得到的潜在Dok6下游蛋白将给研究Dok6的生理功能及阐述其相关分子机制提供重要的依据。
潘艳芳李玮琦杨彬张靖阴彬彭小忠
关键词:免疫共沉淀质谱鉴定功能分析
PCBP2基因座位上长非编码RNA的筛选与鉴定
2013年
目的从EST鉴定入手利用生物信息学方法筛选验证PCBP2基因内部UC.338基因座位附近的长非编码RNA。方法首先利用生物信息学方法筛选包含内含子转录区域的ESTs,经CPC分析和统计学比较,共筛选到4个(人、鼠各两个)可能的lncRNAs,用PCR方法进行鉴定,克隆到pGEM-T载体测序验证,并用PCR,real-time PCR的方法检测各ESTs在人源细胞系或小鼠不同组织,小鼠发育不同时间点大脑中的表达谱。结果筛选到4个ESTs中有3个ESTs均具有一定的非编码特征,并最终测序正确:1个人源,2个鼠源,并且其中有些lncRNAs具有一定的细胞、组织特异性,有些lncRNAs具有广谱表达模式。结论使用了一种新的寻找lncRNAs的方法,从EST鉴定入手,对现有数据库进行了挖掘。找到了可能在小鼠大脑发育过程中起作用的lncRNAs。
赵阿妮朱丽媛吴朝刘雪梅阴彬张靖
关键词:ESTS生物信息学分析LONG表达谱分析
小鼠大脑皮层层次特异表达基因天然反义转录物的筛选与鉴定被引量:1
2011年
目的筛选并鉴定小鼠大脑皮层发育过程中皮层层次特异表达的基因是否存在天然反义转录物(NAT)。方法对63个小鼠大脑皮层层次特异表达的基因进行生物信息学预测,筛选出31个可能存在NAT的基因,从小鼠脑组织及神经系统来源的细胞系提取总RNA,采用RT-PCR方法对筛选阳性基因进行鉴定并克隆到pGEM-T载体中进行测序。结果 31个经生物信息学预测的基因中,8个为NAT阳性。结论小鼠大脑皮层发育过程中皮层层次特异表达的基因存在NAT,NAT可能通过调控编码基因影响小鼠皮层发育。
李萍张靖李爱花王珊谈小超阴彬彭小忠
关键词:小鼠大脑皮层
长链非编码RNA-TP53TG1在神经胶质瘤细胞中对糖剥夺应激反应的影响被引量:6
2013年
目的构建长链非编码RNA-TP53TG1的真核表达克隆,并探索其在神经胶质瘤中对糖剥夺应激反应的影响。方法用RT-PCR方法从人胶质瘤细胞中扩增出TP53TG1;构建了TP53TG1的全长真核表达克隆;实时定量PCR检测其在U87MG细胞内的表达;同时用低糖(0.3 g/L葡萄糖、8 h)处理;real-time PCR检测GRP78、IDH1和PKM2的表达水平。结果成功构建了真核重组表达质粒pCIG-TP53TG1;在转染U87MG细胞36 h后,可见绿色荧光的表达,U87MG细胞中TP53TG1 mRNA升高了2.9×106倍(P<0.05);过表达TP53TG1的同时低糖处理,GRP78和IDH1 mRNA的表达水平显著升高(P<0.05),而PKM2 mRNA的表达水平显著降低(P<0.05)。结论在U87MG细胞中,TP53TG1可能通过影响GRP78、IDH1和PKM2 mRNA的表达,而参与到对糖剥夺的应激反应过程。
包雯杨彬夏启胜林细华韩为阴彬彭小忠
关键词:GRP78IDH1
Dlx1的天然反义转录物在大脑发育中的功能探索被引量:2
2013年
目的探索Dlx1的天然反义转录物(Dlx1as)在小鼠大脑发育过程中的功能。方法根据生物信息学分析与分子生物学实验验证Dlx1as是否具有多聚腺苷酸尾,采用实时定量PCR检测Dlx1as与Dlx1 mRNA在小鼠大脑发育过程中随时间的变化,利用原位杂交的技术比较Dlx1as与Dlx1 mRNA空间表达谱。结果 Dlx1as具有多聚腺苷酸尾,在小鼠的胚胎发育过程中,从E14.5到E18.5高表达,与Dlx1 mRNA在各时间点表达水平虽比较接近,但在表达区域存在互补的特点。结论 Dlx1as在小鼠大脑发育过程中有一段时间的高表达,与蛋白编码基因Dlx1 mRNA空间互补,推测其可能是通过调控Dlx1 mRNA来影响小鼠的大脑发育。
吴朝赵阿妮朱丽媛阴彬张靖
关键词:原位杂交
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