国家自然科学基金(31160390)
- 作品数：5 被引量：27H指数：3
- 相关作者：廖惠红黄宏明王茜徐宁李文信更多>>
- 相关机构：广西农业科学院广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室荔浦县科学技术情报研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金广西壮族自治区自然科学基金广西壮族自治区科学研究与技术开发计划更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 广西南丰蜜桔感染黄龙病的调查研究被引量：2
- 2013年
- 为了解广西南丰蜜桔黄龙病感染情况,在南宁、柳州和桂林等地采集南丰蜜桔黄龙病疑似样品,对样品按症状分类并记录,然后利用黄龙病亚洲种的16SrDNA特异引物fD1/fD2和OI1/OI2c进行PCR扩增,扩增结果在1%琼脂糖凝胶电泳上检测。结果表明,共收集了193份南丰蜜桔黄龙病疑似样品,其中,61份为斑驳型黄化,3份为均匀黄化,19份为缺锌状黄化,35份为表现正常,5份为叶脉黄化,70份为其他类型黄化。检出阳性样品共75份,总阳性率为38.9%,96%阳性样品出自非正常叶疑似样品。斑驳型黄化叶、缺锌状黄化叶、其他黄化叶和正常叶疑似样品阳性率分别是82.0%、31.6%、22.9%和8.6%,另两类样品阳性率为0。来自南宁、柳州和桂林的疑似样品检出阳性率分别为25.0%、36.6%和42.9%。黄龙病已经在广西的南丰蜜桔上发生严重为害。
- 王茜黄宏明廖惠红方仁李文信罗瑞鸿韦宗便
- 关键词：南丰蜜桔黄龙病NESTED-PCR
- 柑橘黄龙病病原DNA提取方法比较被引量：13
- 2013年
- 【目的】筛选出一种快速高效获取柑橘黄龙病病原DNA的提取方法,为黄龙病亚洲种病原的检测奠定基础。【方法】选取5份疑似黄龙病症状柑橘叶片样品,分别采用4种试剂盒(快捷型基因组DNA提取系统、新型植物基因组DNA提取试剂盒、植物基因组DNA提取试剂盒、快速DNA提取扩增套装)及CTAB法提取柑橘叶脉基因组DNA,并用柑橘黄龙病亚洲种的16SrDNA特异引物fD1/fD2和OI1/OI2c进行PCR扩增,DNA提取产物及PCR扩增产物在1%琼脂糖凝胶电泳上检测。【结果】快捷型基因组DNA提取系统获得的DNA质量最好,植物基因组DNA提取试剂盒和CTAB法提取DNA方法提取得到的DNA质量较好,新型植物基因组DNA提取试剂盒所获得的DNA质量较差,快速DNA提取扩增套装所获得的DNA质量最差。除快速DNA提取扩增套装外,其余4种DNA提取方法均扩增出黄龙病亚洲种病原。【结论】快捷型植物基因组DNA提取系统试剂盒操作简单快捷,耗时短,提取的DNA效果较好,能够满足黄龙病病原PCR检测的要求。
- 王茜廖惠红黄宏明陆玉英李文信徐宁韦宗便李一伟
- 关键词：柑橘黄龙病CTABDNA提取PCR
- 广西砂糖橘黄龙病亚洲种的Nested-PCR检测被引量：8
- 2013年
- 【目的】利用柑橘黄龙病病原亚洲种16S rDNA序列的特异引物检测疑似黄龙病的砂糖橘叶片样品,为砂糖橘黄龙病的综合防控提供理论依据。【方法】选取采自广西9市17个采样点的214份疑似黄龙病及无症状砂糖橘叶片样品,用试剂盒法提取叶脉基因组DNA,采用柑橘黄龙病亚洲种16S rDNA特异引物进行PCR扩增,扩增结果在1%琼脂糖凝胶电泳上检测,统计待检样品柑橘黄龙病病原菌亚洲种的带菌率。【结果】对214份样品的Nested-PCR扩增结果,部分样品可得到1160 bp左右的特异条带,与预期大小相符但条带明暗不同。来自广西9市17个采样点的砂糖橘叶片样品均检测出黄龙病亚洲种病原,平均检出率均在66.0%以上,其中检出率最高的是来自东兴市的样品,检出率为100.0%,检出率最低的是来自南宁市的样品,检出率为66.9%;斑驳、缺素型黄化、叶脉黄化、小叶和无症状叶片样品中均可检测出黄龙病亚洲种。【结论】Nested-PCR技术具有灵敏度高、特异性强的特点,能够快速、准确检测出各种症状样品的黄龙病病原,可用于柑橘黄龙病的早期诊断。
- 黄宏明王茜徐宁韦宗便廖惠红
- 关键词：砂糖橘黄龙病病原检测率
- 广西及广东惠州沙糖桔黄龙病亚洲种检测初报被引量：2
- 2014年
- 采用柑桔黄龙病亚洲种(Candidatus Liberibacter asiaticus)的16SrDNA特异引物fD1/fD2和OI1/OI2c,对采自广西沙糖桔主要产区及广东惠州的234份沙糖桔叶片样品DNA进行NestedPCR扩增,扩增产物在1%琼脂糖凝胶电泳上检测。结果表明,广西南宁、桂林、柳州、百色、崇左、梧州、来宾、防城港、东兴及广东惠州的沙糖桔部分或大部分感染了柑桔黄龙病亚洲种病原,检出率分别为35.7%、66.7%、70.0%、74.5%、54.5%、29.7%、88.9%、20.0%、33.3%、95.0%。
- 黄宏明王茜方仁韦宗便廖惠红
- 关键词：沙糖桔黄龙病PCR
- 柑橘黄龙病病原菌非洲种和美洲种23S-5S rDNA序列的克隆及分析被引量：3
- 2011年
- 【目的】克隆柑橘黄龙病病原菌非洲种和美洲种23S-5S rDNA序列并和亚洲种相应区域进行比对,阐明黄龙病3个种核糖体RNA操纵子之间的关系。【方法】根据亚洲种23S-5S rRNA基因区域序列的保守性设计引物,在非洲种和美洲种DNA样品上扩增,对PCR产物进行克隆和测序,并对新获得的序列进行序列验证和分析。【结果】非洲种获得了3 057 bp序列包括23S rRNA基因、细胞壁脱氢酶假基因和5S rRNA基因;美洲种获得了3 033 bp序列包括23S rRNA基因、glpK基因和5S rRNA基因。3个种核糖体基因顺序分别是:亚洲种16S rRNA、tRNAIle、tRNAAla、23S rRNA、细胞壁脱氢酶假基因、5S rRNA和tRNAMet;非洲种16S rRNA、tRNAIle、tRNAAla、23S rRNA、细胞壁脱氢酶假基因和5S rRNA;美洲种16S rRNA、tRNAIle、tRNAAla、23S rRNA、glpK基因和5S rRNA。【结论】黄龙病病原菌核糖体RNA基因有特殊的排列方式,即在23S rRNA和5S rRNA基因区间均有反向编码的细胞壁脱氢酶基因,其中亚洲种和非洲种为假基因,美洲种为glpK基因。
- 廖惠红李杨瑞杨丽涛徐宁
- 关键词：柑橘黄龙病RDNA
