“十五”国家科技攻关计划(2003BA712A05-04)
- 作品数：6 被引量：94H指数：6
- 相关作者：阚飙崔志刚李伟章丽娟景怀琦更多>>
- 相关机构：中国疾病预防控制中心传染病预防控制所江苏省疾病预防控制中心四川省疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：国家科技重大专项更多>>
- 相关领域：医药卫生轻工技术与工程更多>>
- 我国霍乱弧菌的脂肪酸分型研究被引量：9
- 2007年
- 目的:对脂肪酸分型方法在霍乱弧菌菌株鉴定、菌株相似性分析等方面的应用价值进行评价。方法:选取了分离自我国的两个主要致病血清群的194株霍乱弧菌菌株(1961年以来的ElTor型和1992年以来的O139群),提取脂肪酸,应用MIDI公司的脂肪酸分型系统,进行数据分析。结果:检测的所有菌株都含有的脂肪酸成分有13种。霍乱弧菌的判断符合率为88.6%。二维聚类分析没有成明显可区分的群,O139群霍乱弧菌的脂肪酸组成与O1群的相似,产毒与非产毒霍乱弧菌的脂肪酸成分没有显著差异。结论脂肪酸分型对弧菌种的快速鉴定有应用价值,对霍乱弧菌的现场分离鉴定有辅助意义,在小样本暴发资料的研究中能够反映菌株之间的亲缘关系,但其对霍乱弧菌种属内的各种特征性菌群不具有鉴别能力。
- 王瑞白刘海洪邱海燕宋亚军杨瑞馥阚飙
- 关键词：霍乱弧菌脂肪酸
- 江苏省南通地区小肠结肠炎耶尔森菌分布特征初步研究被引量：15
- 2005年
- 目的了解江苏省南通地区小肠结肠炎耶尔森菌的分布特点和毒力特征。方法用常规方法从家畜家禽粪便标本中分离小肠结肠炎耶尔森菌,PCR法检测其五种毒力相关基因,同时对国内分离到的O:8血清型菌株进行脉冲场凝胶电泳分析。结果从该地区293份家畜家禽粪便标本中分离到91株小肠结肠炎耶尔森菌,分离率为31.06%。未分离到国内主要流行血清型O:3和O:9,其中有39.57%菌株毒力基因分布特征为:ail-、ystA-、ystB-、yadA-、virF-,有60.43%菌株为ail-、ystA-、ystB+、yadA-、virF-,两株国外引进的强毒菌株具有相同的脉冲图形,与国内分离到的O:8血清型菌株存在显著的差异。结论致病性小肠结肠炎耶尔森菌的分布具有局限性,江苏省南通地区小肠结肠炎耶尔森菌的分布可能以非致病菌为主。
- 顾玲汪华朱凤才史智扬曾小燕谭兆营肖玉春邱海燕王鑫金东崔志刚王冰阚飙王新生景怀琦徐建国
- 关键词：小肠结肠炎耶尔森菌血清型毒力基因
- 脉冲场凝胶电泳分型技术在追溯O139霍乱传染来源中的应用被引量：36
- 2006年
- 目的分析四川省2004年7起因聚餐暴发霍乱疫情的分离菌株之间,及其与常规监测中从外环境、水产品中分离的霍乱弧菌之间的分子分型特征和遗传相关性,查找霍乱传染来源。方法利用聚合酶链反应检测霍乱毒力基因(ctxAB),用脉冲场凝胶电泳(PFGE)对菌株进行分子分型,所得结果以BioNumerics V4.0软件UPGMA方法进行聚类分析。结果所试72株O139群霍乱弧菌中所有4株从河水分离的菌株ctxAB阴性,其余均具有ctxAB,为产毒株。对其中的67株菌以NotⅠ酶切后PFGE可分为16个型别。从甲鱼分离的O139群霍乱弧菌与同期流行的O139群霍乱弧菌优势PFGE型别一致,并且也为产毒株。7起暴发中分离的菌株型别各不相同。结论2004年四川省O139霍乱暴发感染来源复杂,提示并非因为菌株在该地持续存在而引起,但甲鱼可能是2004年度霍乱聚餐暴发的主要传染来源之一。
- 刘红露张京云冯泽惠李伟崔志刚章丽娟祝小平阚飙
- 关键词：霍乱脉冲场凝胶电泳分子分型
- 中国六省致病小肠结肠炎耶尔森菌的脉冲场凝胶电泳分析被引量：16
- 2006年
- 目的对中国致病小肠结肠炎耶尔森菌分离株进行脉冲场凝胶电泳分析。方法参照美国疾病预防控制中心PulseNet实验方法对中国6省165株致病小肠结肠炎耶尔森菌进行脉冲场凝胶电泳分析,使用BioNumerics软件进行聚类分析,并按照PulseNet命名原则对带型进行命名。结果将114株O:3血清型小肠结肠炎耶尔森菌分成25个带型;K6GN11C30012(50株)、K6GN11C30015 (19株)及K6GN11C30016(10株)是其主要带型,三个主要带型之间聚类相似性很高。将51株O:9血清型小肠结肠炎耶尔森菌分为14个带型;其中K6GN11C90004(22株)与K6GN11C90010(13株)是其主要带型,K6GN11C90004与K6GN11C90010带型之间有一定的差异。O:3与O:9血清型的主要带型之间有明显的差异。结论O:3血清型的小肠结肠炎耶尔森菌可能起源于一个克隆系,且在不同地区和年代变异很小;O:9血清型的小肠结肠炎耶尔森菌可能起源于两个不同的克隆系,且各自有一定的变异。O:3与O:9血清型的小肠结肠炎耶尔森菌亲缘关系较远。
- 金东崔志刚肖玉春王鑫顾锋夏胜利胡万富杨晋川汪华顾玲徐建国阚飙景怀琦
- 关键词：小肠结肠炎耶尔森菌脉冲场凝胶电泳分子分型
- 中国四省甲型副伤寒分离株脉冲场凝胶电泳分析及分型数据库建立被引量：16
- 2006年
- 目的对中国4个甲型副伤寒流行省份的分离株进行标准化脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型分析。方法对来自4个省的甲型副伤寒沙门菌利用XbaⅠ酶切染色体DNA进行PFGE分析,利用BioNumerics建立数据库和进行相似性聚类。结果分离自1998-2002年的89株甲型副伤寒分离株共有11种PFGE带型,这些菌株中具有优势带型。有3种带型相似性在96．3％,这3种带型的菌株占到分析菌株的86．5％,并在不同省份和年度中出现。结论建立了中国甲型副伤寒沙门菌的用于网络监测分析的PFGE技术和数据库,近年中国部分省份的甲型副伤寒沙门菌分离株PFGE型别集中,存在同型菌株的广泛流行。
- 李伟崔志刚张政田克诚钟豪杰朱凤才梁未丽章丽娟阚飙
- 关键词：甲型副伤寒沙门菌脉冲场凝胶电泳
- 荧光定量PCR检测细菌染色体上基因拷贝数被引量：7
- 2006年
- 目的建立一种以细菌染色体上1个已知拷贝管家基因作为基准、通过荧光定量PCR 检测其他被检基因拷贝数的方法。方法利用荧光定量PCR检测El Tor型霍乱弧菌染色体上目的基因zot与基准基因thyA的Ct(threshold cycle)值差值,根据已知拷贝数菌株N16961的两基因Ct值之差来推算待测菌株中zot基因的拷贝数。结果利用thyA基因作参照,确定11株El Tor型霍乱弧菌中 zot基因的拷贝数在1-5个之间,对较少拷贝数的检测与Southern blot确认的相同,对多拷贝数检测优于Southern blot的判定。结论本方法可以准确检测菌株染色体上的基因拷贝数。
- 刘广文闫梅英梁未丽高守一阚飙
- 关键词：荧光定量PCR基因拷贝数霍乱弧菌
