湖南省自然科学基金(10JJ7003)
- 作品数：9 被引量：47H指数：5
- 相关作者：曾朝阳李桂源熊炜龚朝建李小玲更多>>
- 相关机构：中南大学国防科技大学中南大学湘雅二医院更多>>
- 发文基金：湖南省自然科学基金国家自然科学基金中央高校基本科研业务费专项资金更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生更多>>
- lncRNAs参与基因表达调控机制的研究进展被引量：7
- 2014年
- 长链非编码RNAs(long non-coding RNAs,lncRNAs)是一组内源性、长度超过200 nt、缺少特异完整的开放阅读框(open reading frame,ORF)、无或很少有蛋白编码功能的RNAs分子。近年来的研究发现,lncRNAs与许多重要的生物学过程相关,如基因组印记、细胞分化、免疫反应等。lncRNAs在表观遗传水平、转录水平和转录后水平等多个层面调节基因的表达,通过介导染色质重塑和组蛋白修饰、干扰转录、调节选择性剪接模式、生成小RNAs、调节蛋白质活性、改变蛋白质定位等方式,参与机体生长、发育、衰老及死亡等重要生命活动的调控。关于lncRNAs参与基因表达调控的机制有待进一步研究,这将有助于深入理解疾病的发病机制,为寻找疾病分子标记物、药物靶点提供新的方向。
- 杨倩黄宏斌龚朝建熊炜曾朝阳李桂源
- 关键词：表观遗传调控转录调控转录后调控
- 染色质免疫沉淀-测序:全基因组范围研究蛋白质-DNA相互作用的新技术被引量：5
- 2013年
- 染色质免疫沉淀-测序(ChIP-seq)是近年来新兴的将染色质免疫沉淀(ChIP)与深度测序技术相结合,在全基因组范围内分析DNA结合蛋白结合位点、组蛋白修饰、核小体定位和DNA甲基化的高通量技术.在新一代测序(NGS)技术的大力推动下,ChIP-seq提供了一种相对于ChIP-chip高分辨率、低噪音、高覆盖率的研究方法.随着测序成本的降低,ChIP-seq逐步成为研究基因调控和表观遗传机制的一种常用手段.本文就该技术的最近研究进展进行综述,并着重介绍ChIP-seq数据分析过程及该技术的实际应用情况.
- 梁芳徐柯龚朝建李俏马健熊炜曾朝阳李桂源
- 关键词：基因调控表观遗传学
- 抗癌蛋白NOR1基因工程重组蛋白表达条件的优化和纯化被引量：2
- 2011年
- 目的:构建NOR1基因原核表达载体,并在大肠杆菌中原核表达NOR1重组蛋白,对其诱导条件进行优化,并纯化NOR1蛋白。方法:PCR扩增人NOR1基因全长开放阅读框,克隆入原核表达载体pET28b。重组质粒转化大肠杆菌,采用不同温度、不同抗生素浓度、不同IPTG浓度诱导NOR1蛋白表达。选择最佳条件大量诱导NOR1蛋白表达,采用Ni-IDE树脂纯化NOR1重组蛋白,并通过SDS-PAGE凝胶电泳检测重组蛋白的纯度。结果:成功构建了pET28b-NOR1基因原核表达载体,并转化E.coli Rosettablue(DE3)。利用IPTG诱导His-NOR1蛋白表达,结果发现IPTG浓度、温度、抗生素浓度均可影响NOR1重组蛋白的表达效率。0.25mmol/L IPTG即可诱导NOR1融合蛋白的表达,分子质量为43 kD;随着IPTG浓度提高,重组蛋白表达量增加。温度对NOR1蛋白原核表达有重要影响,低温条件(30℃)无法诱导NOR1蛋白表达。提高卡那霉素筛选浓度可以提高NOR1蛋白表达量。原核表达的NOR1重组蛋白绝大部分形成包涵体,采用6 mol/L盐酸胍溶解包涵体,通过Ni-IDE树脂纯化得到高纯度的His-NOR1重组蛋白。结论:构建了pET28b-NOR1原核表达载体。研究发现在37℃条件下,采用1 mmol/L IPTG,200μg/mL卡那霉素可以高效诱导NOR1蛋白表达。纯化得到高纯度的NOR1重组蛋白。
- 向波王理王卫李文娟易梅李小玲曾朝阳李桂源
- 关键词：鼻咽癌原核表达重组蛋白纯化
- 缺氧对于间充质干细胞分化的影响
- 2012年
- 间充质干细胞(mesenchymal stem cell,MSC),是来源于中胚层的具有自我更新能力和多向分化潜能干细胞,在体内外可以分化成骨、软骨、脂肪、肌腱和肌细胞等.由于其强大的分化潜能,MSC在组织工程与再生医学方面具有广泛的应用前景.MSC存在于高度受调控的被称为"壁龛"的微环境中.干细胞壁龛处于一个缺氧的环境中,氧分压可以低至7.2 mmHg.同时MSC是肿瘤微环境的重要的细胞组成成分,肿瘤微环境也是存在于一个缺氧的环境中.了解MSC在缺氧状态下的分化能力,对于组织工程、再生医学和肿瘤的发生发展研究具有重要的意义.缺氧相关的信号转导参与MSC定向分化能力的过程.目前MSC在缺氧状态下的成脂和成骨分化的研究存在着差异,这些研究结果的差异可能是由于MSC的异质性以及实验操作不同所引起.
- 江琛向娟娟
- 关键词：缺氧间充质干细胞分化
- 天然免疫分子乳铁蛋白抑制鼻咽癌的发生发展被引量：1
- 2013年
- 鼻咽癌（nasopharyngeal carcinoma,NPC）的发病具有明显的区域和人种聚集性,主要高发于中国南方和东南亚一些国家;鼻咽癌发病还具有明显的家族聚集性,有癌家族史的鼻咽癌患者约占10%,而且大部分发生在一级亲属中.明显的区域和人群聚集以及高比例的家族性发病提示遗传因素在鼻咽癌的发病过程中具有重要作用．
- 黄宏斌邓敏郑瑛马健张文玲周艳宏廖前进熊炜李小玲曾朝阳李桂源
- 关键词：鼻咽癌乳铁蛋白免疫分子发病过程聚集性
- microRNAs与TP53基因调控网络研究进展被引量：20
- 2012年
- TP53基因(编码p53蛋白)作为一个重要的抑瘤基因,通过调控一系列信号转导通路广泛参与了多种恶性肿瘤的发生发展,一直是肿瘤分子生物学研究领域的热点.最近的研究发现,microRNAs(miRNAs)参与了TP53的信号通路,它们之间存在着复杂的调控网络.一方面,p53通过调控一些miRNAs的转录及转录后成熟,促进细胞周期阻滞、诱导细胞凋亡和衰老,抑制肿瘤发生.另一方面,许多miRNAs,如miR-25、miR-30d、miR-125b和miR-504等可直接调控p53的表达与活性,参与TP53信号通路的调节,还有一些miRNAs则通过调节p53上下游基因,发挥重要的生物学功能.其中,最具有代表性的是miR-34家族,它们受p53直接调控并参与TP53信号通路,通过靶向抑制多个TP53信号通路关键分子的表达,发挥抑瘤作用.此外,它们还可以通过抑制沉默信息调节子,增强p53的活性,反馈调节TP53信号通路.miRNAs与TP53之间调控网络的研究,是对TP53抑瘤机制的重要补充.
- 龚朝建黄宏斌徐柯梁芳李小玲熊炜曾朝阳李桂源
- 关键词：MIRNAS信号通路转录
- MicroRNAs与非可控性炎症相关肿瘤被引量：6
- 2013年
- 非可控性炎症与肿瘤之间存在密切的联系,约25%的人类肿瘤是由于非可控性炎症所引起,在几乎所有的肿瘤微环境中存在炎症细胞浸润,炎症细胞及分子影响着肿瘤发生、发展的每一步。MicroRNAs(miRNAs)通过调控一些关键基因及其信号通路,参与了非可控性炎症相关肿瘤起始和进展过程的调控。深入研究miRNAs作用的分子机制,可能为肿瘤的预防、早期诊断及治疗提供新的策略。
- 龚朝建张姗姗唐珂李夏雨向波向娟娟周鸣马健曾朝阳熊炜李桂源
- 关键词：MICRORNAS肿瘤
- 生物信息技术加速开发旧药新用途被引量：6
- 2012年
- 传统的技术路线研发新药,不仅周期很长而且耗资巨大,开发已获批准药物新的治疗用途,又称为药物重定位,比传统的新药研发具有明显的优势.基于芯片的基因表达谱分析,已常规地广泛用于各种人类疾病的临床研究,提供了在全基因组水平描述疾病状态的特征信号.同时,基因芯片也广泛地用于对比药物处理前后细胞基因表达模式的变化,这也提供了反映药物效应的高质量信号.最近出版的Science Translational Medicine杂志同时发表了一个研究组的两篇论文,为我们展示了如何利用生物信息学手段重新解析和比较全基因组基因表达谱数据,以高效地预测药物的新用途.这两篇论文使用了公共数据库中的100种疾病基因表达谱数据,以及164种药物处理前后细胞基因表达谱数据,通过比较和配对疾病与药物基因表达谱,得到了一些可以逆转疾病异常表达基因的药物,其中证实了一些已知的药物-疾病组合,也预测了一些新的药物-疾病组合.最后通过实验验证了抗溃疡药可用于治疗肺癌,而抗癫痫药可治疗炎症性肠道疾病,进一步证实了他们所采用研究策略的正确性.于是,肺癌和炎性肠道疾病这两种临床上难治的疾病有了新的候选治疗药物,我们也有了一种挖掘已有数据快速发现药物新用途的思路和方法.
- 黄宏斌梁芳熊炜李小玲曾朝阳李桂源
- 关键词：生物信息学基因表达谱
- CSPG4基因在鼻咽癌中的表达分析被引量：1
- 2012年
- 目的:研究硫酸软骨素多糖蛋白4(CSPG4)基因在鼻咽癌及对照组织中的表达。方法:采用实时荧光定量PCR测定CSPG4基因在4例正常鼻咽上皮和18例鼻咽癌组织(其中Ⅱ期6例,Ⅲ期5例,Ⅳ期7例)中的表达情况;通过构建包含92例对照和187例鼻咽癌的组织芯片,应用免疫组织化学检测CSPG4蛋白的表达和分布。结果:正常鼻咽上皮中CSPG4基因mRNA表达水平较低,在鼻咽癌中CSPG4表达上调且与临床分期呈正相关,差异具有统计学意义(P=0.017)。免疫组织化学结果表明鼻咽癌中CSPG4蛋白表达水平高于对照组,91.98%的鼻咽癌组织中CSPG4为强阳性表达,而对照组的强阳性率为76.09%(P=0.001)结论:CSPG4在鼻咽癌中随着临床进展表达逐渐上调,可能参与了鼻咽癌的发生发展,具体机制及临床应用前景值得进一步深入研究。
- 宋亚莉李小玲黄丽丽李俏孙梦熙张文玲石磊范松青龚朝建喻正源向波彭淑平熊炜阳剑波曾朝阳李桂源
- 关键词：鼻咽癌组织芯片
