国家科技基础条件平台建设计划(2006DKA30470017)
- 作品数：4 被引量：23H指数：3
- 相关作者：尤锋王倩胡金伟辛梦娇谭训刚更多>>
- 相关机构：中国科学院中国科学院大学中国科学院研究生院更多>>
- 发文基金：国家科技基础条件平台建设计划国家高技术研究发展计划国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 斑马鱼GSTM单核苷酸多态性与低温耐受性的相关分析被引量：5
- 2015年
- 为分析谷胱甘肽硫-转移酶M基因(glutathione S-transferases M,GSTM)与鱼类低温耐受性的相关性,本实验运用PCR-SSCP技术研究了130尾斑马鱼(Danio rerio)GSTM基因5?UTR、3?UTR和第一内含子序列的单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms,SNPs),同时分析了筛选到的基因型与其低温耐受性状的关联性。结果显示,在其5UTR区域检测到AB、BC、AC 3种基因型个体,共A、B、C 3个等位基因,其观测杂合度和期望杂合度分别是1.000和0.570,多态信息含量为0.472,所检测群体在该座位偏离了Hardy-Weinberg平衡;第1内含子中检测到DD、DE和EE 3种基因型个体,共D、E两个等位基因,其观测杂合度和期望杂合度分别为0.408和0.477,多态信息含量为0.362,群体在该座位符合Hardy-Weinberg平衡。3'UTR区域中没有发现多态性。上述2个SNP座位与斑马鱼低温耐受性状的关联分析结果表明,5'UTR区3种基因型与低温耐受性状均没有显著相关性(χ2=4.029,P>0.05)。而第1内含子3种基因型与低温耐受性状显著相关(χ2=8.498,P<0.05):DD基因型在耐低温群体中占优势(50.00%),并表现为对受低温胁迫斑马鱼的保护性因素(OR=0.520,95%CI=0.255–1.061),而DE基因型在不耐低温群体中占优势(51.31%),表现为低温胁迫下斑马鱼的危险因素(OR=3.012,95%CI=1.413–6.419)。研究结果为GSTM基因SNPs位点与斑马鱼低温耐受性能关联分析提供了依据,也将为海水经济鱼类抗寒标记筛选育种提供参考。
- 王倩尤锋辛梦娇胡金伟谭训刚
- 关键词：SNPS
- 牙鲆耐寒相关基因CIRP、HMGB1的克隆及表达特征分析被引量：7
- 2015年
- 为鲆鲽鱼耐低温标记辅助育种研究和应用提供候选基因，并了解耐寒相关基因在低温下的表达图示，作者通过同源克隆以及5￠/3￠RACE 的方法扩增得到了牙鲆（Paralichthys olivaceus）CIRP 和HMGB1基因。组织表达谱分析显示，这两个基因在脑、鳃、心脏、肌肉、肝脏、肠等组织均有表达，但HMGB1基因在鳃中表达较弱。低温胁迫后，两基因随着胁迫时间的延长其表达量在肌肉中都出现先上升后下降的趋势：在0~12 h逐渐上升并达到最大值，然后下降恢复至最初水平。但在肝脏和脑组织中的变化趋势却不同，低温胁迫后0~2 h HMGB1基因在脑中的表达量上升至最高，然后下降至最初水平，在肝脏中变化不大。而CIRP基因在低温胁迫后0~2 h在肝脏中表达量处于上升趋势，然后下降至初始水平，在脑中变化不大。由此推测，这两个基因在低温条件下都参与了机体对外界的抵抗，特别是在抵抗外界寒冷的主要组织—肌肉中发挥作用，可能共同参与了机体的免疫反应，对低温胁迫环境下的鱼体进行保护，可以作为鱼类耐低温标记筛选的候选基因。
- 胡金伟尤锋王倩王丽娟翁申达辛梦娇
- 关键词：低温胁迫RT-PCR
- 牙鲆NPY的体外表达及体内检测被引量：1
- 2014年
- 神经肽Y(Neuropeptide Y,NPY)被普遍认为是一种重要的促食因子,在调节鱼类的摄食行为方面起着至关重要的作用。为进一步研究牙鲆NPY蛋白的生物学功能,作者克隆了牙鲆NPY成熟肽序列(m-NPY)及含有信号肽的全长序列(f-NPY),利用原核表达系统分别进行体外重组表达,筛选出诱导剂IPTG最佳诱导浓度为0.8 mmol/L及最佳诱导时间3 h;此外,根据牙鲆NPY第49-64位氨基酸序列制备了多克隆抗体并通过Western blot验证该多抗能够有效检验重组NPY及牙鲆体内NPY的表达。研究结果为研究重组牙鲆NPY蛋白在牙鲆水产养殖产业中的应用及检测提供了依据。
- 王倩谭训刚孙威尤锋张培军
- 关键词：原核表达重组蛋白多克隆抗体
- 一株桑沟湾赤潮藻的分子鉴定被引量：11
- 2012年
- 2011年5月山东荣成桑沟湾近海海域暴发赤潮,其规模在桑沟湾历史上罕见,较严重地影响了该海域水产动物的人工养殖。本文作者分离得到了赤潮暴发过程中海水里的一株优势种,并对其核糖体18S RNA基因(18S rDNA)和转录单元内间隔区(ITS)进行了序列扩增和分析。依据这两种序列构建的系统进化树都显示这株藻与卡罗藻Karlodinium veneficum(=K.micrum)完全聚在一起,因此推断出其应为K.veneficum,是一种常见有害赤潮藻。本文是卡罗藻在桑沟湾海域暴发的首次报道。
- 徐娜逄少军刘峰
- 关键词：赤潮分子鉴定
