国家自然科学基金(30976611)
- 作品数：11 被引量：36H指数：3
- 相关作者：朱瑞新康宏康廷国刘琦陈志龙更多>>
- 相关机构：同济大学辽宁中医药大学东华大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家教育部博士点基金上海市技术标准专项更多>>
- 相关领域：医药卫生理学轻工技术与工程生物学更多>>
- 基于配体、受体和复合物指纹的虚拟筛选方法比较被引量：3
- 2011年
- 近年来,作为基于配体和基于受体两种方法的补充,以复合物指纹为基础的药物筛选方法相关研究正受到广泛的重视.那么这种新兴的方法相对于传统方法在筛选结果准确率上是否具有优势?同时,由于复合物指纹可以通过复合物结构测定和将相应蛋白和配体进行分子对接两种方式获得,那么基于这两种方式获得的复合物指纹所得的筛选结果准确率是否有显著性差异呢?通过对一系列HIV-1蛋白酶复合物晶体结构同时进行基于配体的相似性搜索、分子对接传统的能量打分、基于复合物晶体结构的复合物指纹的相似性搜索和基于分子对接所得复合物结构的复合物指纹的相似性搜索的筛选比较,结果表明:(1)如果三种方法都是直接基于实验结构,那么复合物指纹和分子对接两种方法都因为是兼顾了受体和配体两个方面,准确率都要高于仅仅基于配体的方法;(2)实际运用中,通过实验测定所有复合物结构并不可行,因此需要进行分子对接才能大量的获得复合物结构并进一步生成相应的复合物指纹,令人兴奋的是,基于此种方式获得的复合物指纹与直接基于实验复合物结构获得的复合物指纹在筛选结果上并无显著性差异,从而可以作为实验复合物指纹筛选方法的有效补充.
- 黄琦康宏张端峰盛振刘琦朱瑞新曹志伟
- 关键词：药物筛选
- HIV-1蛋白酶抑制剂靶点的广谱性研究
- 背景:HIV-1蛋白酶是治疗艾滋病的主要靶点之一,然而其非常高的突变率成为了治疗该疾病的一大瓶颈。找到一种能有效预测对突变病毒株具有抗病毒能力的药物的方法,对于艾滋病的临床治疗将有很大帮助。为此,我们引入能够同时对多个蛋...
- 黄琦高军康宏刘琦曹志伟朱瑞新
- 关键词：人类免疫缺陷病毒广谱性
- 嘧啶衍生物对牛蒡子苷元片段修饰的研究
- 2012年
- 用一系列具有生物活性的嘧啶衍生物修饰牛蒡子苷元,旨在寻找增强牛蒡苷元子抗肿瘤活性的同时又能降低嘧啶抗肿瘤副作用的先导化合物.本研究通过把卤代后的嘧啶衍生物与牛蒡子苷元酚羟基相接,合成得到11个新的化合物,通过1H NMR与LC-MS表征确定其结构.最终,增加了牛蒡子苷元抗肿瘤化合物库中化合物的数量,为接下来的体外活性筛选做准备.
- 王欢欢吴平康宏许亮朱瑞新康廷国
- 关键词：牛蒡子苷元结构修饰嘧啶衍生物
- AT1受体的中药活性成分筛选模型及其作用机理研究
- 背景:心血管类疾病是中老年人的多发病,严重的危害人民身体健康。中医临床治疗此类疾病时多处以活血化瘀、益气扶正或平肝潜阳类药物,在临床中疗效显著。有资料进一步表明,AT1受体直接参与调节心脑血管生理变化,因此,本文从探寻治...
- 吴琼康宏王欢欢朱瑞新康廷国
- 关键词：AT1受体中药活性成分同源模建分子对接
- 文献传递
- IOPY/ISPY类HIV-1逆转录酶抑制剂的定量构效关系研究被引量：3
- 2011年
- C-5修饰的3-碘-4-芳氧基/芳硫基吡啶酮(IOPY/ISPY)类化合物是一类潜在的HIV-1非核苷类逆转录酶抑制剂,特别是这类化合物因具有同时抑制野生型和突变型病毒株的特性,而受到更加广泛的关注.首先利用两套2D通用描述符同时构建了该类化合物的线性和非线性定量构效关系模型.结果表明这些模型都具有较好的预测能力,并且非线性模型较线性模型预测能力更好些.为了更好、更形象地描述逆转录酶抑制剂的特征,进一步结合三维定量构效关系(3D-QSAR)模型,以及SAReport分析对该类化合物同时抑制野生型和突变型病毒株的结构特征进行了分析,发现在对这类化合物进行结构修饰时,需要服从如下三条理论指导原则:(1)R基团中的正负电场分布情况对化合物的活性起着关键作用;(2)R基团最好具有芳香环或芳香杂环和(3)R基团的环结构上连接的取代基不宜太多.
- 朱瑞新王飞刘琦康廷国
- 关键词：定量构效关系非核苷类逆转录酶抑制剂HIV-1
- 光敏剂荧光成像的应用和研究
- 光敏剂荧光诊断(PFD)是指通过特定波长激光照射光敏剂产生光物理作用而用于手术过程监测和药物剂量测定的一种方法。目前PFD联合光动力治疗受到国内外学者地广泛关注,为肿瘤的诊断与治疗带来新的福音。本文简要的概述了光敏剂荧光...
- 毛荟菁叶颖陈志龙
- 关键词：PFD荧光
- 文献传递
- 抗菌防霉剂的研究进展及其在纺织品中的应用被引量：17
- 2011年
- 介绍了国内外无机、有机、天然抗菌防霉剂的研究进展以及其在纺织品上的应用。具体包括金属离子型抗菌剂,TiO2等光催化氧化型抗菌剂,金属离子光催化氧化物型复合纳米抗菌剂,有机无机复合抗菌剂,双胍类、卤代胺类、苯酚、季铵盐类、季鏻盐类等有机抗菌剂,壳聚糖及其衍生物等天然抗菌剂。着重介绍了季铵和季鏻盐类有机抗菌剂。对纤维和纺织品抗菌处理方法进行了分类,有共混纺丝法、纤维化学改性法、复合纺丝法、纤维整理法、纺织品后整理法。对抗菌防霉性及安全性检测方法进行了概述,并对抗菌剂的发展进行了展望。
- 郑皓徐少俊杨晓霞陈志龙
- 关键词：抗菌剂季铵盐季鏻盐纺织品抗菌整理
- AT_1受体的中药活性成分筛选模型及其作用机理研究被引量：10
- 2012年
- 传统中药对治疗心血管类疾病疗效显著,例如钩藤、黄芪、益母草等在临床应用广泛.现代药理研究表明钩藤碱可以降压;黄芪中毛蕊异黄酮能舒张血管平滑肌、保护心脑血管;益母草碱可扩张微血管,改善血液流变异常,但它们分子层面作用机制尚不明确.首先以牛视紫红质蛋白为模板,模建出心血管疾病主要靶点AT1受体的三维结构.然后将AT1受体拮抗剂和中药活性成分与受体模型结合的作用方式进行了对比研究,据此提出了中药活性成分治疗心血管疾病的作用机理,并建立了AT1受体的中药活性成分筛选模型.结果表明:黄芪毛蕊异黄酮等中药活性成分能与AT1受体活性口袋中的残基发生氢键作用,结合方式与AT1受体拮抗剂相似.每一种AT1受体拮抗剂均与His183,Lys199,His256,Gln257,Ser105,Ser109,Tyr113,Asn200中多个发生氢键作用;黄芪毛蕊异黄酮与Try113,Lys199,Gln257,Ser105发生氢键作用.本研究从分子层面上阐释了一些中药活性小分子的治病机理,为进一步挖掘中药资源,研究AT1受体相关的心脑血管类药物,合理设计和筛选AT1受体的拮抗剂提供重要依据.
- 吴琼康宏王欢欢高军朱瑞新康廷国
- 关键词：AT1受体中药活性成分同源模建分子对接分子机理
- 化合物结构特征与其基因表达信息的互补性研究被引量：2
- 2010年
- 化合物分子指纹在化合物相似性比较、生物芯片技术在分子标记识别中都有着重要的应用,因而受到广泛的重视.但是由于这两个研究对象依传统的观点,分属于化学信息学和生物信息学两个不同的研究领域,因此一直未能在同一研究对象中同时得到应用.近年来,小分子刺激的生物芯片数据的大量出现,使得联合化合物的结构特征及其基因表达谱信息共同的用于药物筛选成为可能.为此,根据本质和外延互补的哲学思想,提出了综合运用这两种数据来共同描述化合物的新方法.通过(1)只利用化合物分子指纹,(2)只利用化合物基因表达谱信息和(3)前面两种方法互补等三种方法在化合物相似性比较的研究中,发现本文提出的互补方法比前两种方法的查询结果更准确:(1)使结构和功能两方面均相似的化合物之间的相似性更高,(2)并且能有效使那些仅在某一方面表现非常特殊的化合物能够暴露出来,而得到有效地排除.本研究给化学信息者和生物信息者重新审视以往的数据,联合致力于药物的筛选提供了线索.化合物分子指纹(本质)和基因表达谱(外延)的互补原理则为药物的筛选提供更有效的依据,并最终加快药物的研发进程.
- 盛振康宏戴天力刘琦朱瑞新
- 关键词：分子指纹基因表达药物筛选
- 关于中药小分子动力学模拟扩散系数的讨论被引量：1
- 2012年
- 文章对中药小分子动力学模拟扩散系数作了系统的研究。总结和归纳出普适的选择模拟时间的规律,并且解释了实际模拟时所出现的拖尾现象,为模拟中药小分子在生物体系中扩散打下了基础。
- 王欢欢吴琼朱瑞新康廷国
- 关键词：分子动力学拖尾现象
