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国家自然科学基金(31272411)

作品数:18 被引量:114H指数:7
相关作者:昝林森王洪宝成功付常振王洪程更多>>
相关机构:西北农林科技大学国家肉牛改良中心许昌职业技术学院更多>>
发文基金:国家自然科学基金国家高技术研究发展计划国家科技支撑计划更多>>
相关领域:农业科学生物学医药卫生文化科学更多>>

文献类型

  • 16篇期刊文章
  • 2篇学位论文

领域

  • 16篇农业科学
  • 4篇生物学
  • 1篇医药卫生
  • 1篇文化科学

主题

  • 9篇基因
  • 3篇多态
  • 3篇多态性
  • 3篇重组腺病毒
  • 3篇腺病
  • 3篇腺病毒
  • 3篇基因组
  • 3篇测序
  • 2篇肉用
  • 2篇肉用性状
  • 2篇全基因
  • 2篇全基因组
  • 2篇全基因组测序
  • 2篇转录
  • 2篇基因多态性
  • 2篇基因重组
  • 2篇基因重组腺病...
  • 2篇基因组测序
  • 2篇SNPS
  • 1篇单倍型

机构

  • 17篇西北农林科技...
  • 11篇国家肉牛改良...
  • 1篇内蒙古大学
  • 1篇青海省畜牧兽...
  • 1篇渭南职业技术...
  • 1篇许昌职业技术...
  • 1篇杨凌职业技术...

作者

  • 15篇昝林森
  • 8篇王洪宝
  • 5篇王洪程
  • 5篇成功
  • 4篇付常振
  • 3篇李安宁
  • 3篇姜碧杰
  • 3篇桂林生
  • 2篇赵春平
  • 2篇李耀坤
  • 2篇王国庆
  • 2篇王虹
  • 2篇刘扬
  • 2篇张松
  • 2篇邓冠群
  • 1篇赵志东
  • 1篇魏著英
  • 1篇郝瑞杰
  • 1篇高建斌
  • 1篇白春玲

传媒

  • 7篇西北农林科技...
  • 5篇畜牧兽医学报
  • 2篇中国农业科学
  • 1篇Journa...
  • 1篇计算生物学

年份

  • 2篇2017
  • 6篇2016
  • 5篇2015
  • 3篇2014
  • 2篇2013
18 条 记 录,以下是 1-10
排序方式:
牛SREBP1基因shRNA序列的筛选及其腺病毒载体的构建与鉴定被引量:2
2013年
【目的】筛选可靶向干扰牛的SREBP1基因的有效shRNA,构建相应腺病毒载体并包装重组腺病毒,为在细胞水平上研究SREBP1基因的功能和作用机制提供基础。【方法】以秦川牛SREBP1基因为研究对象,首先靶向其编码区(coding sequence,CDS)序列设计并合成6条干扰和1条阴性对照shRNA,并构建表达载体pENTR-U6-shRNA。然后与载体psiCHECK-Ⅱ-SREBP1共转染293A细胞,筛选有效的pENTR-U6-shRNA。其次将筛选的pENTR-U6-shRNA和阴性对照pENTR-U6-NC分别与腺病毒骨架载体pAd/PL-DEST体外重组,得到腺病毒重组载体,并在293A细胞包装扩繁得到高滴度腺病毒,GFP标记法测定病毒滴度。最后将病毒侵染牛前体脂肪细胞,实时荧光定量法(qRT-PCR)检测干扰效率。【结果】筛选出靶向牛SREBP1基因干扰效率为87.4%的shRNA-1053。构建了pAd-1053和阴性对照pAd-NC重组腺病毒载体并包装得到Ad-1053和Ad-NC高滴度病毒,测定得到的病毒滴度分别为7×108 GFU·mL-1和9×108 GFU·mL-1。Ad-1053和Ad-NC分别侵染牛前体脂肪细胞,qRT-PCR检测结果显示Ad-1053可显著降低SREBP1基因的mRNA水平(干扰率>85%),而Ad-NC对SREBP1基因表达无明显影响。【结论】成功筛选得到靶向干扰牛SREBP1基因的有效shRNA,并包装扩繁获得相应的高滴度重组病毒。
付常振昝林森王虹成功王洪宝李耀坤姜碧杰高建斌杨宁
关键词:SHRNA重组腺病毒
秦川牛CD36基因多态性检测及其与肉用性状的相关性研究被引量:5
2014年
旨在研究秦川牛脂肪酸转位酶基因(Cluster of differentiation 36,CD36)的多态性及其对秦川牛肉用性状的影响,以探索改善秦川牛肉用性状的分子育种方法。本研究选取288头同等饲养条件下的24月龄健康秦川牛母牛,采用DNA测序技术检测了CD36基因的多态性,并结合PCR-RFLP技术对所发现的多态位点进行基因型分型,然后将不同基因型与秦川牛肉用性状(背膘厚、眼肌面积、眼肌深度和肌内脂肪含量)进行关联性分析。结果表明,在CD36基因上发现4个多态位点,分别命名为SV1、SV2、SV3和SV4。连锁不平衡和单倍型分析表明,SV1-SV2为连锁位点,与SV3为强连锁,SV4与其他3个位点均为弱连锁,单倍型ITA属于优势单倍型(频率为60.4%)。关联分析结果表明,除SV4在眼肌深度指标中存在显著性差异外,单个多态位点的基因型之间和不同多态位点的组合基因型之间均在肌内脂肪含量指标中存在显著性或极显著性差异。其中,IITTAG型个体在肌内脂肪含量指标中显著低于IWTCAA型个体(P<0.05),极显著低于WWCCAA型个体(P<0.01)。结果提示,CD36基因对秦川牛肉用性状有显著的影响,可通过人工选择降低群体中IITTAG型个体的比例以改善肉用性状。
张松昝林森王洪宝王国庆付常振张亚冉梅楚刚邓冠群
关键词:CD36PCR-RFLP多态性单倍型肉用性状
基于全基因组测序研究中国黄牛群体历史及其适应性
原牛(Bos primigenius)大约在150-200万年前起源于南亚地区,在更新世时期扩张到亚洲、非洲北部和欧洲等地区。现在的家牛在生物学分类上可分为瘤牛和普通牛,瘤牛有瘤峰,主要分布在南亚和非洲东部地区;普通牛没...
王洪程
关键词:全基因组中国黄牛适应性
文献传递
牛全基因组测序研究进展被引量:1
2015年
牛作为反刍动物的代表,具有独特的生物学特征和重要的哺乳动物进化地位,是人类生产活动的重要工具和肉、奶等物质需求的主要来源。近10年来,牛全基因组研究取得了很多重要的进展,为解释牛的生物学特征和加快品种的分子育种进程发挥了重要作用,文章重点介绍了牛全基因组测序的相关研究成果,以及测序工作完成后的研究进展,讨论了牛全基因组测序工作的机遇、研究重点,以及今后面临的挑战。
王洪程梅楚刚昝林森成功李安宁王洪宝
关键词:全基因组测序
基于高通量测序的动物基因组研究进展被引量:11
2016年
动物基因组学研究是进行动物遗传资源保护和利用以及分子育种的一项重要基础工作,高通量测序技术的出现为动物基因组学研究带来了革命性飞跃。文章对基于高通量测序技术的动物基因组从头测序、重测序、简化基因组测序等基因组学研究进行了综述,总结了相关的生物信息分析内容,并对不同分析工具及方法进行了比较分析。最后,讨论了当前高通量测序技术存在的问题,对该技术未来发展方向进行了展望。
梅楚刚王洪程昝林森成功李安宁赵春平王洪宝
关键词:高通量测序动物基因组数据处理
SIRT1和SIRT2基因多态性及合并基因型与秦川牛肉用性状的关联分析被引量:9
2015年
旨在探讨SIRT1和SIRT2基因的多态性与秦川牛肉用性状的关系,寻找与秦川牛肉用性状相关的分子标记。本研究利用DNA测序和PCR-PFLP方法检测秦川牛SIRT1和SIRT2基因的多态位点并对其进行基因分型,同时分析了单个多态位点不同基因型及合并基因型与秦川牛肉用性状的关联性。结果发现,在SIRT1基因3′侧翼区检测到两个多态位点(G25764A和A25846G),同样在SIRT2基因3′侧翼区也检测到两个突变位点(C19501T和C19518T)。关联性分析表明,在本试验所选取的505头秦川牛样本中,G25764A位点上AA基因型个体的眼肌面积极显著高于AB基因型(P<0.01);A25846G位点上AA基因型个体的眼肌面积与AB和BB两组基因型分别存在显著性差异(P<0.05)和极显著性差异(P<0.01);C19501T位点的不同基因型对眼肌面积和肌间脂肪影响显著(P<0.05),优良基因型为AA;C19518T的BB基因型个体背膘厚显著高于AA基因型(P<0.05)。通过合并基因型发现,AB-BB-AA-BB的各个肉用性状表现最优(P<0.01或P<0.05)。以上结果提示,SIRT1和SIRT2基因单核苷酸多态性及合并基因型对秦川牛肉用性状有一定的影响,可以作为进行秦川牛肉用性状分子标记辅助选择的候选基因。
桂林生昝林森王洪宝王洪程
关键词:SIRT1肉用性状合并基因型
牛PRKAA2基因SNP检测及与其生长和肉质性状的关联分析被引量:8
2016年
【目的】研究秦川牛、南阳牛、鲁西牛和安格斯牛共630头个体的单磷酸腺苷激活的蛋白激酶α2亚基(AMPKα2)基因PRKAA2的多态性,并分析其多态性与200头秦川牛生长及肉质性状的关联性。【方法】利用PCRSSCP、DNA测序、飞行质谱(MALDI-TOF)等技术,分析检测4个品种牛PRKAA2基因6个外显子的单核酸多态性(SNPs);采用生物信息学方法结合统计分析软件,分析秦川牛各多态位点的遗传变异特性与体尺及肉质性状的关联性。【结果】PRKAA2基因第2、4、6、7、8、9外显子中,只检测到第4外显子27G>C和60T>C 2个突变位点;关联分析表明,27G>C位点与秦川牛背膘厚和眼肌面积显著关联(P<0.05);60T>C位点与秦川牛体斜长极显著相关(P<0.01),与体高、尻长、腰角宽、坐骨端宽、眼肌面积显著相关(P<0.05)。【结论】PRKAA2基因对秦川牛部分体尺及肉质性状有极显著或显著影响,可作为秦川肉牛新品种早期选择的候选基因和分子辅助标记。
田万强梅楚刚付常振辛亚平张松王国庆昝林森
关键词:体尺性状肉质性状
维生素E对小鼠体内精子品质及精子DNA的保护作用被引量:9
2015年
旨在研究维生素E对小鼠精子DNA的保护作用及对精液中抗氧化物酶活性的影响。以小鼠为动物模型,选日龄、大小相同的健康雄性小白鼠50只,随机分成5组,在试验组小鼠的每千克日粮中分别添加4、8、12、16g的维生素E,对照组添加量为0,饲喂30d后,通过颈椎脱臼处死小鼠,解剖后通过附睾和曲精细管获得小鼠精液。通过单细胞凝胶电泳及相关检测试剂盒检测分析各组间精液DNA的完整性、精子活力、密度、畸形率、精浆中的超氧化物歧化酶(SOD)、谷胱甘肽过氧化物酶(GSH)、谷胱甘肽还原酶(GR)和过氧化氢酶(CAT)的活性。结果表明:每千克日粮中维生素E的添加量为12g时,0级精子百分率与对照组相比差异显著(P<0.05);添加量为8~16g时,精子活力与对照组相比差异显著(P<0.05);GR和SOD酶的活性与对照组相比差异显著(P<0.05)。每千克日粮中维生素E添加量为12~16g时,CAT酶的活性与对照组相比差异显著(P<0.05)。综上表明,在饲粮中添加维生素E浓度为12g·kg-1时可以明显提高小鼠精液中CAT、GR、GSH和SOD酶的活性及精子DNA的完整性。
赵宪林曹少杰赵春平郝瑞杰桂林生昝林森
关键词:小鼠维生素E精子DNA完整性
基于多组学的秦川牛、黑毛和牛、安格斯牛与大额牛遗传特性研究
我国地方黄牛品种数较多且适应性强,但肉质生产性能等方面相较于国外黑毛和牛及安格斯牛等仍有一定的差距,这也是目前国内高档牛肉长期依赖进口问题的根源所在。另外,国内一些盲目引种杂交,造成了很多地方品种纯种数量急剧下降,有些品...
梅楚刚
关键词:安格斯牛大额牛基因组转录组
文献传递
Expression analysis,single nucleotide polymorphisms within SIRT4 and SIRT7 genes and their association with body size and meat quality traits in Qinchuan cattle被引量:4
2016年
Silent information regulator 2 (Sir2) proteins, or sirtuins, are nicotine adenine dinucleotide (NAD)-dependent deacetylases that connect metabolism with longevity in lower organisms. In mammals, there are seven Sir2 homologs, namely, silent information regulators (SIRT1-7). SIRT4 and SIRT7 genes play a crucial role in regulating lipid metabolism, cellular growth and metabolism. This suggests that they are potential candidate genes for affecting body size and meat quality traits in animals. Hence, this study aimed to detect genetic variations of both SIRT4 and SIRT7 bovine genes in Qinchuan cattle, and to evaluate the effect of these variations on economically important body size and meat quality traits. Expression analysis using quantitative real-time PCR (qPCR) indicated that SIRT4 and SIRT7 were broadly expressed in all thirteen studied tissues. The expression of SIRT4 was higher in liver, muscle, and in subcutaneous fat tissue. In the case of SIRT7, the expression was higher in lung, abomasum, and subcutaneous fat. Using DNAsequencing, a total of three single nucleotide polymorphisms (SNPs) were identified within SIRT4 and SIRT7 genes in 468 Qinchuan cattle. These included one novel SNP within 3' untranslated regions (UTR) of SIRT4 (SNP1: g. 13915A〉G) and two novel synonymous substitutions in SIRT7 (SNP2: g.3587C〉T and SNP3: g.3793T〉C). Statistical analyses indicated that all three SNPs could significantly influence some body size and meat quality traits in Qinchuan cattle. These novel findings will provide a background for application of bovine SIRT4 and SIRT7 genes in the selection program of Chinese cattle.
GUI Lin-shengXIN Xiao-lingWANG Jia-liHONG Jie-yunZAN Lin-sen
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