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磷酸二酯酶4抑制剂药效团模型的构建被引量：6: 2008年; 目的构建磷酸二酯酶4(PDE4)抑制剂药效团模型,为中草药的相关虚拟筛选研究提供新的方法。方法以22个具有PDE4抑制活性的化合物作为训练集化合物,其半数抑制浓度(IC50)范围在0.042～23000nmol·L-1。利用Catalyst/HypoGen系统,对训练集化合物进行构象分析,通过对训练集化合物多个构象进行叠合,提取药效团特征及三维空间限制构建药效团模型。结合数据库搜索命中率筛选最优药效团。结果最优药效团模型包含2个氢键受体、1个脂性疏水基团和1个芳香环特征,排除体积数为6个。模型相关系数、Total cost值、Fixedcost值、Null cost值、△cost值和Configuration cost值分别为0.9047、117.7、90.84、180.4、62.7和15.71。利用所得较优模型对MDL药物数据报道数据库进行搜索,该模型的命中已知活性化合物数与命中已知活性化合物总数比值为58.95%。结论利用Catalyst系统构建的PDE4抑制剂药效团具有较好的预测能力,可作为提问结构用于数据库的搜索,有助于中草药中具有抑制PDE4活性的化合物的虚拟筛选研究。; 鲍红娟张燕玲乔延江; 关键词：磷酸二酯酶抑制剂药物设计中草药数据库

中药有效成分族辨识信息技术研究被引量：5: 2008年; 中药有效成分族是指作用于同一靶点、具有相同作用机理的中药有效成分之总称。整合信息学、化学、生物学等多学科技术的中药有效成分族辨识信息技术是揭示中药物质基础的方法和技术之一。本文从中药化学成分数据库的构建、中药有效成分族的辨识与验证三个环节探讨了中药有效成分族辨识信息技术的建立及应用。; 张燕玲王耘史新元乔延江; 关键词：药效团

基于中药有效成分族的方剂物质基础研究被引量：4: 2008年; 本文以血管紧张素转化酶(Angiotensin Converting Enzyme,ACE)抑制剂、3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(3-Hydroxy-3-Methylglutaryl Coenzyme A Reductase,HMG-CoAR)抑制剂和血管紧张素Ⅱ(AngiotensinⅡ,AngⅡ)、血小板活化因子(Platelet Activating Factor,PAF)受体拮抗剂三维药效团为辨识模型,以三维数据库柔性搜索技术为辨识算法,发现了18首活血化瘀方剂及其所含20味中药可能具有的ACE、AngⅡ、PAF和HMG-COAR受体活性的物质基础。结果表明,中药有效成分族的研究将为从分子层次上揭示方剂物质基础提供方法学支撑。; 张燕玲王耘艾路乔延江; 关键词：活血化瘀

距离比较法构建HMG-CoA还原酶抑制剂药效团被引量：1: 2008年; 目的:考察不同模板分子对距离比较法(DIStance COmparison,DISCO)构建HMG-CoA还原酶抑制剂药效团模型的影响。方法:以MDDR数据库中作用于大鼠肝细胞的13个HMG-CoA还原酶抑制剂为训练集,将活性最高的6个活性分子逐一作为模板分子,用DISCO方法构建的HMG-CoA还原酶抑制剂三维药效团模型和比较分子力场分析法(Comparative Molecular Field Analysis,CoMFA)进行分析。结果:最优HMG-CoA还原酶抑制剂药效团模型包含两个氢键受体和两个疏水中心,其模板分子的刚性和活性适中。结论:利用DISCO方法构建药效团模型时,合理选择模板分子是保证药效团可靠的关键因素之一。; 崔建华张燕玲乔延江; 关键词：药效团模板分子

中药功效网络的构建及应用被引量：24: 2008年; 中药功效相关的多成分、多靶点、多环节之间组成了密切联系、相互协同与制约的复杂网络,发现这一复杂网络的内在联系,揭示各成分间相互协同的机理,明确这一复杂作用关系的整体效应,对于基本清楚中药的物质基础和作用机理具有关键作用,是中药学理论与现代研究成果相融合的基本途径。本文探讨了中药功效网络的基本概念,提出中药功效网络的三个层次,分别为中药功效的分子网络、模块网络和概念网络。提出中药功效网络构建的三种基本途径,分别为基于中药作用靶点辨识、基于药理指标相关作用环节和基于中医理论与中药基本信息的网络构建,并以活血化瘀功效网络为例探讨了中药功效网络可能的应用途径。; 王耘张燕玲史新元乔延江; 关键词：中药功效复杂系统

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