江苏省自然科学基金(BK2010305)
- 作品数：6 被引量：29H指数：2
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- 相关机构：扬州大学苏州市农业科学院更多>>
- 发文基金：江苏省自然科学基金国家科技重大专项江苏省农业科技自主创新基金更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 油菜Bnpgip2-1基因的克隆表达与生物信息学分析被引量：1
- 2014年
- 据GenBank及相关文献提供的序列设计引物,从油菜基因组DNA中扩增出Bnpgip2-1基因完整开放阅读框。该基因全长1 068bp,与已发表的Bnpgip2基因序列(登录号:AF529694)有98%的相似性。RT-PCR分析表明,该基因(已申请序列号为KJ820998)具一个72bp的内含子(544-615),编码区为996bp,含4个限制性内切酶酶切位点(AvaⅠ,185;HindⅢ,536;EcoRⅠ,929;Apa LⅠ,972)。原核表达该基因,表达产物能显著抑制油菜菌核病菌多聚半乳糖醛酸酶(PG)活性,抑制率达52.96%。生物信息学分析表明,表达产物Bn PGIP2-1有331个氨基酸,理论分子量为36.99k Da,p I为8.35,具强疏水性,主要存在于细胞壁。信号肽切点位于第22和23位氨基酸之间(SFS-KNL),N端和C端各存在5个和3个半胱氨酸残基,可形成3个二硫键;二级结构以α-螺旋(31.12%)、β折叠(16.01%)和无规则线圈(52.87%)为结构元件,具典型的LRR结构;三级结构为10个LRR按右手螺旋规则形成的一个开放裂隙区,可能负责其与病菌PG的互作。该基因的表达受病原菌侵染的强烈诱导,但对水杨酸(SA)处理不敏感,茉莉酸(JA)处理反而使其下调表达。
- 陈夕军张磊陈羽张家豪童蕴慧徐敬友
- 关键词：多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白原核表达生物信息学分析核盘菌
- 抗白粉病黄瓜品种的叶片组织结构及其生理生化被引量：14
- 2015年
- 为明确不同黄瓜品种对白粉病的抗性机制,采用组织切片和田间接种的方法,从近130份种质中筛选出高抗(GY14A、GY4)、中抗(津春4号、津优30号)、中感(W12757、仪黄)、高感(DE843、平望乳瓜)黄瓜品种各2份,并对8份黄瓜品种的形态结构与抗性生理生化进行研究。结果表明,高抗品种叶片组织结构紧凑,栅栏组织排列整齐、紧密,且细胞壁较厚;而高感品种则细胞壁较薄,叶片组织间出现大量空隙;中抗和中感品种虽具清晰的栅栏组织,但空隙较大,说明叶片组织细胞的排列整齐和紧密度以及细胞壁的厚度与黄瓜品种对白粉病的抗性密切相关。病原菌接种后,抗性品种体内防御酶活性上升速度与幅度都明显高于感病品种,且过氧化物酶(POD)同功酶谱带较深,H2O2积累较慢。另外,抗性品种叶片中可溶性蛋白质含量明显高于感病品种,而可溶性糖含量则明显低于感病品种,还原糖含量无明显差异。
- 陈夕军朱键鑫陈羽张青张家豪张孝然黄奔立
- 关键词：生理生化机制白粉病抗病性黄瓜
- 不同种植方式对水稻纹枯病发生的影响被引量：10
- 2013年
- 为了解不同种植方式条件下水稻纹枯病的发生与危害,进行多年连续调查。结果表明,在抛秧、移栽、机插和直播田块中,前期抛秧田病害发生最重,直播田最轻。随着时间的推移,除直播田外,各田块病害扩展迅速,但不同种植方式间发病率无明显差异。直播田从水稻分蘖盛期开始,病害扩展呈快速上升趋势,成为不同种植方式中病害最严重的田块,出现大面积的枯死、倒伏。不同种植方式下病害造成的损失率与发病严重程度呈正相关。
- 陈银凤张家豪张孝然徐蕾陈夕军
- 关键词：水稻纹枯病
- 水稻纹枯病菌Rspg1基因的克隆、表达及其编码产物生物信息学分析被引量：1
- 2014年
- 【目的】为克隆、表达水稻纹枯病菌Rspg1基因,明确其编码产物的生物学特性,为研究该基因在病菌致病过程及与寄主互作中的作用提供理论依据。【方法】据GenBank提供的相关序列设计特异引物扩增目的基因,并对之进行原核表达和生物信息学分析。【结果】从水稻纹枯病菌基因组DNA中扩增出一1395 bp的目的片段。RT-PCR分析表明,该片段为Rspg1基因的完整开放阅读框,含有5个内含子(278-334,57 bp;545-601,57 bp;657-715,59 bp;1090-1155,66 bp;1244-1304,61 bp),编码区为1 095 bp,编码一含有364个氨基酸的蛋白。原核表达Rspg1基因,表达产物大小约为40 kDa,具明显的多聚半乳糖醛酸酶(Polygalacturonase,PG)活性,活性值为277.78 U/mg。生物信息学分析表明,RsPG1中含有所有生物PG特有的严格保计序列180NTD、202DD、223GHG和255RIK,存在一18个氨基酸的信号肽分子;二级结构以α-螺旋、β-折叠和随机卷曲为其基本结构单元,6个半胱氨酸残基形成3个二硫键,跨膜结构预测以从胞内向胞外分泌为主;三级结构为10个重复的β-折叠环按右手螺旋规则排列形成的螺旋结构,形成一个开放的有活性的裂隙结构。【结论】Rspg1基因编码产物为一40 kDa蛋白,具明显的PG(Polygalacturonase,PG)活性,以胞外分泌为主,且有一个开放的有活性的裂隙结构。
- 陈夕军王友德张家豪左示敏童蕴慧潘学彪徐敬友
- 关键词：生物信息学分析水稻纹枯病菌
- 小麦纹枯病菌多聚半乳糖醛酸酶及其理化性质研究被引量：1
- 2012年
- 为了解小麦纹枯病菌产生的多聚半乳糖醛酸酶(Polygalacturonase,PG)的理化性质,先用丙酮法提取PG粗蛋白,再经DEAE-Sepharose Fast Flow离子交换柱、Phenyl-Sepharose 6Fast Flow疏水柱和Sephadex G-75凝胶柱纯化,得到一种具有较高活性的PG纯蛋白。该蛋白分子量为41.78kD;等电点为5.34;含有糖基,含糖量为9.10%;含有α氨基酸,但不含芳香族氨基酸;不含脂基。这种蛋白在pH 4～12范围内均具有活性,pH为6时活性最大;对热不稳定,100℃下水浴20min,活性完全丧失;对胰蛋白酶和蛋白酶K敏感,酶处理后其活性只有对照的15.7%和10.2%;对紫外线和氯仿亦敏感,处理后活性仅为对照的18.6%和14.9%。
- 纪兆林郭菊张丽娜陈夕军童蕴慧徐敬友
- 关键词：小麦纹枯病菌多聚半乳糖醛酸酶理化性质
- 水稻抗感纹枯病品种Ospgip1基因的表达特征被引量：2
- 2012年
- 从水稻基因组DNA中扩增出1 184bp的Ospgip1基因片段。该片段包含930bp的完整开放阅读框,终止密码子为TAA,无内含子。RT-PCR结果表明,Ospgip1基因在水稻抗、感纹枯病品种中均能表达,但不同生育期、不同部位表达量有差异。实时PCR结果显示,抗病品种YSBR1和中感品种Jasmine 85中Ospgip1的表达量要明显高于感病品种Lemont;稻苗黄化处理后,无论是抗病品种还是感病品种的Ospgip1表达量均显著提高;纹枯病菌侵染使得抗病品种Ospgip1表达量大大增加,而对感病品种影响不大。
- 陈夕军刘晓维左示敏童蕴慧潘学彪徐敬友
- 关键词：水稻品种抗性
