安徽省教育厅重点项目(KJ2009A052Z)
- 作品数：3 被引量：42H指数：3
- 相关作者：李明赵亮许木启刘志瑾谢本贵更多>>
- 相关机构：中国科学院宿州学院更多>>
- 发文基金：安徽省教育厅重点项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 乔氏新银鱼基于细胞色素b序列的种群遗传结构和种群历史被引量：16
- 2010年
- 为促进乔氏新银鱼(Neosalanx jordani)种质资源的保护,采集了长江流域和淮河流域5个乔氏新银鱼地理种群计129个样本,利用线粒体细胞色素b基因(Cyt b)全序列作为分子标记,初步分析了乔氏新银鱼种群的遗传多样性、遗传结构及种群历史动态。研究结果共检测到18个Cyt b单倍型,发现和其他鱼类相比,乔氏新银鱼具有较高的单倍型多样性(h,0.590±0.047),但核苷酸多样性较低(π,0.00088±0.00011)。分子变异分析(AMOVA)表明,乔氏新银鱼5个地理种群内个体间和流域内种群间均存在显著的遗传差异,而长江流域与淮河流域之间遗传分化不明显,显示乔氏新银鱼遗传分化与当前水系的分布格局不吻合。结果表明乔氏新银鱼目前的遗传格局主要是由于长距离独立的建群事件、基因流限制以及种群的持续扩张的共同作用而形成的。种群历史动态分析结果显示乔氏新银鱼种群为近期扩张种群,其大部分变异发生在1.897万年之内,与最后一次冰期全面消退、海平面上升、长江流域及淮河流域中下游大量湖泊(适宜生境)形成的时间相吻合。建议对现存的乔氏新银鱼种群,特别是遗传多样性较高的那些种群(如鄱阳湖、太湖及洪泽湖种群)分别保护。
- 赵亮张洁刘志瑾许木启李明
- 关键词：细胞色素B种群历史
- 太湖新银鱼线粒体D-loop和Cyt b片段序列结构与进化速率比较被引量：21
- 2010年
- 共获得49个太湖新银鱼(Neosalanx taihuensis)个体的线粒体细胞色素b(Cyt b)全序列和控制区(D-loop)部分序列。所测线粒体D-loop部分序列长度变化范围为648～680bp,识别到位于前端的一个串联重复序列、一个终止相关序列(ETAS),3个中央保守区保守序列(CSB-F、CSB-E、CSB-D)及一个保守序列区保守序列(CSB-1),结构与其他鱼类的研究结果类似。太湖新银鱼线粒体Cyt b和D-loop片段的相对进化速率的比较研究结果表明,太湖新银鱼D-loop总的序列多态性位点的比例为0.83%,低于线粒体Cyt b部分总的序列多态性位点的比例(1.31%)。假设太湖新银鱼Cyt b基因平均进化速率相对值为1,贝叶斯(Bayes)MCMC模拟给出Cyt b基因的相对速率区间估计为1.000±0.131,而D-loop基因的相对速率为0.859±0.261,表明太湖新银鱼D-loop基因的进化速率低于Cyt b基因,同时,后验概率分布的变异方差也比较大。说明Cyt b基因比D-loop基因具有相对较高的进化速率,也相对更接近分子钟假设。因此,可以认为Cyt b基因比D-loop基因更适于太湖新银鱼种内及近缘种间相关分子生态及系统地理格局的研究。
- 赵亮谢本贵刘志瑾许木启李明
- 关键词：太湖新银鱼D-LOOPCYTB进化速率
- Bootstrap方法及其在生物学研究中的应用被引量：6
- 2010年
- Bootstrap方法是以原始数据为基础的模拟抽样统计推断法,特别适用于那些难以用常规方法导出的参数的区间估计、假设检验等问题。本文介绍了该方法的基本思想及具体步骤,并附有生物学研究中应用的实例。生物科学中有许多数据总体分布信息往往很难确定,难以用常规的方法进行统计分析,因此Bootstrap方法在生物科学研究中具有很大的应用价值。
- 赵亮程锦秀许木启李明
- 关键词：BOOTSTRAP方法
