国家自然科学基金(10372118) 作品数:3 被引量:2 H指数:1 相关作者: 吴建华 方颖 凌颖琛 向雪 更多>> 相关机构: 中山大学 更多>> 发文基金: 教育部留学回国人员科研启动基金 国家自然科学基金 广东省自然科学基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 更多>>
“靶心”型细胞接触面荧光恢复实验的理论数值模拟 2007年 目的揭示"靶心"型细胞接触面荧光恢复实验中黏附分子扩散-反应动力学机制,发展一种利用荧光恢复实验测量二维反应动力学速率与扩散系数的新方法。方法建立"靶心"型细胞接触面荧光恢复实验的黏附分子扩散-反应偶联数学模型,数值模拟接触面荧光恢复的物理过程,分析荧光恢复的参数依赖特性。结果荧光恢复的起始阶段,在靶环区域内先将经历一个与反应无关的自由配体扩散过程,尔后,细胞接触面内的荧光恢复,将从分子扩散为主导逐步过渡到反应为主导的过程;细胞接触面荧光恢复的时间历程曲线,与二维反应动力学速率与扩散系数密切相关。结论本文提出的"靶心"型细胞接触面荧光恢复实验数学模型不但可以预报荧光恢复的物理过程,而且可以用来发展一种测量二维反应动力学速率与扩散系数的新技术。 方颖 凌颖琛 向雪 吴建华关键词:反应速率 分子扩散 受弹性生物试件约束的矩形AFM悬臂梁的热响应 被引量:1 2007年 原子力显微术(Atomic force microscopy,AFM)是在分子与细胞水平上研究生物学问题的一个日益重要的工具。利用AFM测定生物样本的力学特性,其精度受环境热噪声的影响。我们分析了其探针受弹性生物试件(如蛋白质和DNA分子)约束的矩形AFM悬臂梁的热动力响应过程,发现该耦合系统为试件弹簧与悬臂梁弹簧的并联系统,导出悬臂梁的偏转与位移间的解析关系式,并给出考虑了窄谱效应的用于估计生物样本刚度的有理函数逼近式,从而提出一种的从AFM悬臂梁的热动力响应特征中提取生物样本刚度的新方法。 方颖 吴建华关键词:原子力显微镜 蛋白质 DNA 热分析方法方法在细胞与分子生物力学中的应用 <正>许多细胞过程与受体/配体间的相互作用,均是在一定的环境条件下进行的。环境外力,作为调控生命过程的信使之一,将改变生物分子(如蛋白)与细胞结构的形态,进而影响其功能的发挥。如在生理溶液中的 吴建华文献传递 双粘附分子系统接触面FRAP的理论模型 <正>许多细胞过程均受到受体-配体相互作用的反应速率和结合亲和力的调控。T细胞的识别需要两个细胞间的直接物理接触,使得受体-配体间的结合是二维的。测量二维结合参数,现有力学与荧光方法。建构在小系统动力学概率模型基础之上的... 方颖 凌颖琛 向雪 吴建华文献传递 细胞接触面内的扩散阻尼 <正>许多细胞的免疫应答过程,均发生于细胞与细胞间的接触面之中。如位于淋巴细胞与抗原呈递细胞(antigen present cell,APC)之间的超分子结构—免疫突触(Immunological synapse,IS... 方颖 向雪 凌颖琛 吴建华文献传递 细胞接触面内的扩散阻塞效应的估计 被引量:1 2007年 目的揭示细胞接触面这一复杂的拓扑结构内的分子扩散机制,深入了解T细胞的免疫应答的生物物理过程,建立估计黏附分子在接触面内的扩散系数的方法。方法通过提出一种多孔介质细胞接触面理论模型,导出计及阻塞效应的自由扩散方程。在各向同性情形下,得到扩散阻塞系数γ与孔隙密实度σ关系的解析表达式;在轴对称情形下,得到γ的对数型径向分布特性。结果发现分子在孔隙结构内的扩散的减缓,与扩散阻塞系数γ成正比,而与孔隙密实度σ成反比。FRAP实验数据表明,对黏附分子系统CD2/CD58和CD28-CD80而言,参数σ,γ和ξ的值分别介于0.2~0.4,0.40~0.56和0.73~0.75之间。结论可通过测量细胞接触面内激光漂白区域的荧光恢复水平来估计黏附分子扩散迟缓系数ξ。 方颖 向雪 凌颖琛 吴建华关键词:分子扩散 多孔介质 免疫突触 粘附分子