辽宁省科技厅农业攻关重大项目(2008214001)
- 作品数:4 被引量:40H指数:2
- 相关作者:郭晓华刘广纯张卓张媛孙娜更多>>
- 相关机构:沈阳大学沈阳农业大学更多>>
- 发文基金:辽宁省科技厅农业攻关重大项目辽宁省自然科学基金更多>>
- 相关领域:生物学更多>>
- 丽金龟亚科(Rutelinae)部分种类16S rRNA-ND1基因序列分析被引量:2
- 2012年
- 将测得的丽金龟亚科(Rutelinae)7个样本的16S rRNA-ND1基因部分序列与GenBank数据库中的11条同源序列进行比较,应用DNAStar5.0和Mega 3.1软件,分析核苷酸序列组成和遗传距离,构建分子系统发育树。结果表明:在获得的810bp序列长度中,变异位点218个,简约信息位点155个;A+T使用表现明显的偏向性(73.3%)。丽金龟亚科9个属间的遗传距离在0.054~0.152之间变动;属内种间的距离为0.021~0.064。中华弧丽金龟(Popillia quadriguttata)和日本弧丽金龟(Popillia japonica)具有十分相近的亲缘关系。以白星花金龟(Potosia brevitarsis)和太异爪犀金龟(Heteronychus lioderes)为外群重建的NJ、ME树均支持丽金龟亚科中9属16个种分为2个分支格局的结果 :原喙丽金龟属(Prodoretus)、鳞喙丽金龟属(Lepadoretus)、喙丽金龟属(Adoretus)聚为一支;弧丽金龟属(Popillia)、藜丽金龟属(Blitopertha)、发丽金龟属(Phyllopertha)、彩丽金龟属(Mimela)、塞丽金龟属(Anisoplia)分化为第二分支。其中,异丽金龟属(Anomala)的不同种优先聚集在该属分支下,证实基于分子分类与形态分类的一致性。
- 郭晓华张媛刘广纯张卓王剑峰方红
- 关键词:线粒体DNA
- DNA条形码在鞘翅目昆虫分子系统学研究中的应用被引量:26
- 2011年
- 近年来,DNA条形码(DNA Barcoding)技术已经成为生物分类学研究中备受关注的新型技术,并在鞘翅目昆虫系统发育研究中得到广泛应用。本文总结了鞘翅目昆虫DNA条形码研究所用COⅠ基因序列,概述了DNA条形码在鞘翅目昆虫的物种分类鉴定、发现新种和隐存种、系统发育关系研究等方面的应用,并对DNA条形码研究技术新进展和标准序列筛选需要注意的问题进行了讨论。
- 张媛郭晓华刘广纯张卓
- 关键词:鞘翅目DNA条形码分子系统学
- 基因序列在金龟总科(Scarabaeoidea)分子系统学研究中的应用被引量:2
- 2012年
- 基因序列分析是揭示金龟总科系统发育关系的重要工具。统计了应用于金龟总科中13个科的线粒体和核基因序列,综述了COⅠ、16S rRNA、28S rRNA、18S rRNA等基因序列在金龟总科分子系统学研究的新进展,探讨了不同基因序列在分类鉴定、隐存种发现、系统发育关系重建等方面的作用,对未来研究趋势进行了展望,为进一步阐明金龟总科系统发育机制奠定基础。
- 方晨晨郭晓华刘广纯张卓
- 关键词:金龟总科基因序列分子系统学线粒体基因核基因
- 金龟子部分种类COI基因序列比较分析被引量:11
- 2009年
- 对金龟总科(Scarabaeoidea)6种金龟子线粒体细胞色素氧化酶I(COI)基因部分序列进行了PCR扩增和序列测定,并从GenBank中检索4个种的COI基因序列,比较其同源性并获得了长度为624bpCOI片段。10个种的COI序列分析结果表明:该基因序列共有440个变异位点,192个简约信息位点,表现出明显的A+T偏倚(63.6%)。转换(TV)和颠换(TS)在科内、科间存在明显差异。科内种间TV+TS小,各科不同种与外群之间TV+TS较大;TV/TS则呈现相反的趋势。以黑蜣科(Passalidae)的具角黑艳甲(Odontotaenius disjunctus)作为外群,采用P-distance法重建了10种金龟子邻接树(N-J)和最小进化树(ME)拓扑结构,结果表明:丽金龟属内科内、鳃金龟科内的不同种分别优先聚集,再与其他科相聚集,显示科内、属内的种间有较近的亲缘关系,说明COI基因序列可用来研究属内或科内种群的系统发育问题。
- 孙娜郭晓华刘广纯
- 关键词:金龟总科COI基因