国家高技术研究发展计划(2006AA10Z1C9)
- 作品数：11 被引量：103H指数：7
- 相关作者：屈淑平崔崇士侯喜林张鲁刚张彤更多>>
- 相关机构：东北农业大学南京农业大学西北农林科技大学更多>>
- 发文基金：国家高技术研究发展计划北京市科技新星计划国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 白菜叶缘裂刻近等基因系的cDNA-AFLP分析及SCAR标记的转化被引量：9
- 2010年
- 【目的】寻找与白菜叶缘裂刻发育相关的表达基因,了解叶缘裂刻调控的分子机理。【方法】应用cDNA-AFLP技术从mRNA表达水平研究白菜叶全缘和裂刻近等基因系间基因表达的差异。【结果】共获得57条差异片段,合并归属于55条非重复序列,其中在叶全缘株系中增强或特异表达的有25条,叶裂刻株系中增强或特异表达的有30条。54条差异片段可以在NCBI数据库中找到同源序列(包括EST)、其中42条为已知基因,1条没有找到同源序列。按照其参与的生物学途径归类,已知基因片段参与了代谢、转录、细胞囊泡运输、蛋白质合成和降解、蛋白质储藏与运输、信号传导、光合系统、基因转座等相关过程。用AFLP转化的SCAR标记在分离群体上验证结果表明,SEL7B16-SCAR检测片段的表达模式与cDNA-AFLP结果一致。【结论】构建了白菜叶缘裂刻发育调控基因表达谱,识别了与已知NAC036、DP-2、MYB77、TCP24参与调控裂刻发生基因密切相关的片段。基于cDNA-AFLP特异序列,开发了1条与裂刻紧密连锁的SCAR标记,命名为SEL7B16-SCAR,可用于裂叶纯合和杂合的分子辅助选择。
- 惠麦侠王晗张鲁刚何玉科
- 关键词：白菜CDNA-AFLPSCAR标记
- 大白菜抗软腐病性状的SRAP标记分析被引量：3
- 2010年
- 以大白菜高抗软腐病的自交系A32-2和感病自交系A19-2进行杂交的F2代225个单株作为构建遗传图谱的作图群体,采用SRAP标记方法构建了包含10个连锁群,由103个SRAP遗传标记组成的大白菜分子遗传图谱,该图谱覆盖长度为1223.6cM,平均图距11.9cM。运用软件Windows QTL Cartographer V2.5和复合区间作图法共检测到4个抗软腐病的QTL位点。
- 徐莹莹崔崇士屈淑平
- 关键词：大白菜软腐病SRAP
- SRAP标记在蔬菜作物遗传育种中的应用被引量：20
- 2009年
- SRAP标记是一种新的DNA分子标记技术,文章对其基本原理、技术流程做了简要介绍,从遗传多样性分析、遗传图谱的构建、重要性状的标记、比较基因组学与基因克隆、QTL分析、杂种优势预测等方面概述了SRAP标记在蔬菜作物遗传育种中的应用进展,并对其应用前景进行了探讨。
- 张彤屈淑平崔崇士
- 关键词：SRAP蔬菜作物遗传育种
- 不结球白菜BrCOR14基因cDNA全序列克隆及结构特征分析被引量：4
- 2007年
- 通过设计保守的基因特异引物,运用RT-PCR、RACE技术从不结球白菜中获得1个抗寒相关基因,命名为BrCOR14,登录号为DQ192529,cDNA全长549 bp,含有387 bp的完整开放阅读框,编码128个氨基酸。该基因编码的氨基酸序列与油菜、拟南芥、荠菜编码的氨基酸序列有极高的同源性。
- 蒋芳玲侯喜林史公军崔秀敏
- 关键词：不结球白菜CDNA克隆结构特征
- 大白菜SSR锚定标记分子遗传图谱的构建被引量：11
- 2008年
- 为了将已有的大白菜分子遗传图谱和国际上A基因组参考图谱对应起来,利用国际上发表的大白菜和甘蓝型油菜A基因组特异SSR标记作为锚定标记,以100个DH株系组成的群体为作图群体进行了分子遗传图谱的构建研究。利用双亲和F1对230个SSR标记和8个STS标记进行了筛选,共获得67个多态性分子标记。在此基础上整合了已有的263个AFLP标记、150个RAPD标记、17个SSR标记、3个SCAR标记、14个同工酶标记和1个形态标记,最终构建了一张由10个连锁群组成,包含了497个标记的大白菜高密度分子遗传图谱。该图谱覆盖基因组长度1086.7cM,标记间平均图距2.19cM。此图谱上包含了已在A基因组参考图谱上定位的34个SSR标记和2个STS标记,分布于10个连锁群上,由此可将该图谱按A基因组参考图谱的连锁群进行命名,即A1～A10,并与10条染色体对应起来,A1～A10分别对应3、6、2、8、5、4、7、9、1、10号染色体。
- 于仁波于拴仓戚佳妮张凤兰余阳俊赵岫云张德双
- 关键词：大白菜SSR
- 大白菜分子连锁图谱的构建与分析被引量：13
- 2009年
- 构建大白菜分子连锁图谱,旨在为紫色等性状的QTL定位奠定基础。以紫菜薹(B.compestris L.var.purpurea Bailey)和结球白菜(B.campestris L.ssp.Pekinensis(Lour.)Olsson)杂交的F2群体为试材,基于231个多态性标记,利用JoinMap3.0软件,得到包含163个标记、11个连锁群和4个片段的大白菜分子连锁图谱,其中包括117个RSAP标记、38个SRAP标记、5个SSR标记和3个RAPD标记。图谱覆盖基因组长度为821.3cM,标记间平均图距为5.04cM。连锁群上23.31%的标记表现偏分离,偏分离标记在连锁群上聚集出现。基于与紫色性状连锁的RAPD标记,推断LG4与大白菜1号染色体对应。该图谱可有效的用于紫色等性状的QTL定位分析。
- 张明科张鲁刚巩振辉惠麦侠
- 关键词：大白菜分子图谱
- 大白菜裂球性状的遗传与RAPD标记被引量：2
- 2010年
- 以有裂球现象的杂交一代大白菜单株自交构建的F2群体为试材,研究了大白菜裂球性状的遗传规律及其分子标记。调查统计分析表明:延长生育期20d为大白菜裂球性状的最佳分析时期,其F2群体中不裂球与裂球植株符合3∶1分离比例,说明裂球性状是受1对隐性主基因控制的,同时发现分离后代单株间裂球的速度和程度存在差异,说明裂球性状还受到微效基因和环境条件的影响。同时以06J31×92S24产生的F2群体为材料,采用BSA法进行裂球性状RAPD标记,从600个随机引物中筛选出1个与裂球基因紧密连锁的RAPD标记S15-222。连锁分析发现,标记S15-222与裂球基因间的遗传距离为8.876cM,可用于大白菜耐裂球材料的分子标记辅助选择。
- 牛娜郑晨光张鲁刚胥宇建张立志付文婷
- 关键词：大白菜RAPD标记
- 白菜抽薹性状相关基因的cDNA-AFLP分析被引量：12
- 2009年
- 先期抽薹严重制约着我国春大白菜及高原或高海拔地区的春夏白菜栽培,给生产造成重大损失,因而研究白菜作物低温春化途径抽薹和开花的相关基因对白菜育种具有重要意义。文章选取极早抽薹株系DH-54和极晚抽薹株系DH-43为材料,利用256对引物组合进行cDNA-AFLP分析,筛选到与抽薹开花相关的差异表达的转录衍生片段(Transcript-derived fragment,TDF)191条,对其中82个TDF进行克隆测序。结果表明:52个TDF与NCBI或TIGR已有序列同源,功能涉及代谢、胁迫及逆境应答、信号转导、转录调控等等;22个TDF在NCBI或TIGR找到同源序列,但功能未知;有8个TDF在NCBI或TIGR找不到同源序列,可能是一些新基因。
- 邹艳敏于拴仓张凤兰余阳俊赵岫云张德双
- 关键词：RAPA春化抽薹
- 大白菜抗TuMV-C_3的QTL分析被引量：11
- 2009年
- 本研究以大白菜高抗TuMV-C3株系的自交系A52-2和感病自交系P9805杂交的F2代202个单株作为构建遗传图谱的作图群体,采用SRAP标记方法构建包含8个连锁群,由95个SRAP遗传标记组成的大白菜分子遗传图谱,该图谱覆盖长度为1151.1cM,平均图距12.1cM。运用软件Windows QTL Cartographer V2.5和复合区间作图法共检测到4个抗TuMV-C3的QTL位点。这一研究成果为开展大白菜TuMV抗性分子标记辅助育种提供了理论基础。
- 屈淑平张彤张俊华崔崇士
- 关键词：大白菜SRAP
- 利用DH群体构建不结球白菜遗传连锁图谱被引量：20
- 2007年
- 以不结球白菜品种暑绿的112个双单倍体(double haploid,DH)株系构成的群体作为作图群体,利用SRAP、SSR、RAPD和ISSR 4种分子标记来构建不结球白菜分子遗传连锁图谱。通过Mapmaker 3.0/EXP软件分析,得到1张不结球白菜分子遗传图谱,图谱总长度1 116.9 cM,共包括14个连锁群,186个多态性分子标记,其中包括114个SRAP、33个SSR、24个RAPD和15个ISSR标记,其中偏分离标记44个,占23.7%。每条连锁群上的标记数在4-27个之间,连锁群的长度在30.3-165.8 cM的范围内,平均图距在3.4-11.1 cM之间,总平均距离6.0 cM。
- 耿建峰侯喜林张晓伟成妍李英原玉香蒋武生韩永平姚秋菊
- 关键词：不结球白菜DH群体分子标记
