国家自然科学基金(30771752) 作品数:5 被引量:32 H指数:5 相关作者: 曾燕如 沈林 郭金剑 池伟 王丽 更多>> 相关机构: 浙江林学院 浙江农林大学 佛罗里达大学 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 浙江省自然科学基金 浙江省重中之重学科开放基金 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 更多>>
山核桃SSR标记的初步开发 被引量:6 2012年 基于山核桃Carya cathayensis脂肪代谢相关cDNA文库的部分测序结果,发现43条cDNA序列具有简单重复序列(SSR)碱基重复特点,用Primer Premier 5设计了34对表达序列标签-简单重复序列(EST-SSR)引物;建立了适用于山核桃的SSR分析体系,并用设计的SSR引物对对天然群体山核桃40个样品进行了初步的应用性试验。结果表明:34对引物中有4对无扩增产物,3对引物的扩增产物超过了设计范围,27对引物在供试的40个山核桃材料中有较清晰且稳定的目标扩增产物,其中有18对引物的扩增产生了22个多态性位点,占总扩增位点数的47.8%。将SSR标记分析结果与山核桃已有的显性标记分析结果进行比较,发现SSR标记多态性位点的比例较高,且能够区分显性纯合位点及显性杂合位点。结论:设计开发山核桃的EST-SSR标记是可行有效的。 宋双 黄银芝 董雷鸣 黄有军 曾燕如 吴智敏关键词:经济林学 山核桃 CDNA文库 山核桃AFLP实验技术体系的建立 被引量:12 2008年 以充分展开的山核桃Carya cathayensis嫩叶为材料,利用改良CTAB(十六烷基三甲基溴化铵)法与CTAB裂解-硅珠吸附法提取山核桃总DNA,对适合于山核桃叶片的AFLP(扩增片段长度多态性)分析体系进行了摸索。结果表明:"!改良CTAB法适用于从山核桃叶中提取高质量的DNA,提取的DNA可用于AFLP的分析;#"采用EcoR I/MseⅠ酶切组合,酶切连接一步法与两步法的效果没有明显的差异,但一步法操作更为简便;&%适合于山核桃叶AFLP分析的引物组合为E-ACT+M-CAT,E-ACT+M-CTG,E-ACG+M-CAT,E-ACG+M-CTG。扩增产物经60 g.L-1变性聚丙烯酰胺凝胶电泳后进行银染,条带信号强度一致性好,条带分布均匀、清晰,分辨率较高。 郭金剑 池伟 赵鑫珠 王丽 曾燕如 张秋月关键词:植物学 山核桃 DNA提取 基于AFLP分析的山核桃群体结构及遗传多样性 被引量:6 2009年 利用显性AFLP标记,从连锁不平衡的角度对山核桃天然群体的遗传多样性开展了研究,结果表明:11对引物共产生了32个多态性标记;所有可能的4 692个三位点组合中检测到779个组合(或15.7%)明显地存在连锁不平衡;总的杂合度为0.36。说明山核桃基因的多态性水平低,遗传多样性为低至中等水平。 沈林 郭金剑 李阳 曾燕如关键词:山核桃 AFLP分析 杂合度 山核桃SRAP体系的建立及与RAPD和ISSR标记的比较 被引量:11 2011年 以山核桃Carya cathayensis基因组DNA为模板,对聚合酶链式反应(PCR)体系各组分进行了梯度实验,优化出条带清晰、重复性好的相关序列扩增多态性聚合酶链式反应(SRAP-PCR)扩增体系,并筛选了引物。该体系(25.00μL)为:1×缓冲液0.20 mmol.L-1,脱氧核糖核苷酸(dNTPs),0.20μmol.L-1引物,2.00 mmol.L-1镁离子(Mg2+),33.34 nkat Taq DNA聚合酶,0.80 mg.L-1基因组DNA(以上均为终浓度)。反应条件为94℃预变性5 min;94℃变性30 s,35℃退火30 s,72℃延伸2 min,5个循环;94℃变性30 s,50℃退火30 s,72℃延伸2 min,30个循环;72℃延伸8 min,4℃保存,反应时间比其他体系缩短了一半。从100对引物中筛选出了适用于山核桃的引物15对。在山核桃中,随机扩增多态性DNA(RAPD),简单序列重复区间(ISSR),SRAP等3种标记,以SRAP标记每对引物扩增的位点数及每对引物扩增的多态性位点数为多,但SRAP多态性引物的比例、多态性位点比例居于另2种标记之间。在山核桃研究中可以考虑使用SRAP及RAPD标记。 李元春 沈林 曾燕如关键词:经济林学 山核桃 山核桃与美国山核桃正反交种实及苗期性状的分析 被引量:9 2009年 采用人工控制授粉的方式开展了山核桃与美国山核桃种间正反杂交。基于两年重复杂交授粉试验,对杂交产生的种实及幼苗生长性状进行了测量分析。结果表明:山核桃与美国山核桃之间不论正反交都是可孕的,杂种果实及种子在一定程度上受母本的影响;不同授粉类型对果实质量、种子质量、果皮厚度、果型指数、出籽率这些参数均产生了极显著的影响;不同年份对果皮厚度有显著影响,对种子质量及出籽率有极显著影响,对果实质量、果形指数没有影响;杂交类型和年份两因素的交互作用对果实质量、种子质量、果型指数、出籽率有极显著的影响,对果皮厚度没有影响;正反交种子的出苗率高于母本自然授粉的种子;不同授粉类型对苗高及小叶数/复叶有极显著的影响,对地径没有影响。 沈林 张慧 曾燕如 王飞飞关键词:杂交 方差分析 山核桃 美国山核桃