四川省科技支撑计划(2011FZ0034)
- 作品数：4 被引量：6H指数：2
- 相关作者：饶妮妮王中科杨玲李益侯小叶更多>>
- 相关机构：电子科技大学成都信息工程大学更多>>
- 发文基金：四川省科技支撑计划国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术医药卫生生物学更多>>
- 结合主成分与独立成分分析识别胃癌相关差异表达基因的方法研究被引量：2
- 2013年
- 筛选潜在的差异表达基因能够帮助人们了解基因的功能及基因在疾病发生发展中的作用。由于主成分与独立成分分析的侧重点不同,因此,结合两种方法发展了一种识别胃癌相关差异表达基因新方法,以提高结果的准确度和可信度。从包含7129个基因和29个样本的胃癌基因表达谱数据中,新方法识别了16个与胃癌发生发展显著相关的差异表达基因,这些基因被认为值得进一步开展实验研究。研究结果对揭示胃癌发生与发展机制具有促进作用。
- 陈战雷李博宇李益饶妮妮
- 关键词：胃癌基因表达数据差异表达基因主成分分析
- 局部信息约束的形状导向水平集算法对下颌管的分割被引量：4
- 2012年
- 针对下颌管在CT成像中相对于周围组织的模糊特性,提出一种基于局部信息约束的形状导向水平集算法,对下颌管进行高精度分割。首先根据下颌管分布的位置,重建出下颌管相应部位的多个侧断面,并进行下颌管提取;然后利用主成分分析方法(PCA),对下颌管进行先验形状统计;之后在形状导向水平集算法的基础上,引入下颌管周围组织的局部信息,对水平集演化的能量函数进行约束,以改进在模糊区域水平集的分割效果,从而有效地实现对任意侧断面中下颌管的分割。通过利用分割精度对感兴趣目标的分割结果进行度量,得出形状导向水平集算法的平均分割精度为4.19%,而本算法的平均分割精度为1.82%。该方法能有效对患者的下颌管进行精确的分割,为临床下颌管的定位提供了一种行之有效的新方法。
- 杨玲侯小叶王中科饶妮妮
- 关键词：CT图像下颌管先验形状局部信息
- 牙周膜胶原纤维组织切片的显微图像配准
- 2012年
- 针对牙周膜胶原纤维组织切片在制作过程中对力度和方向非常敏感,极易造成组织变形和空间位移的问题,采用了一种有效的图像配准方法,以便后期对胶原纤维组织空间结构的重建。在Masson染色制成的兔牙周膜石蜡切片的基础上,利用高倍光学显微镜获得了牙周膜的序列切片图像;再采用基于正规步长梯度下降的二维刚性配准和基于对数域对称Demons微分同胚非刚性配准相结合的方法,对牙周膜序列切片图像进行级联配准。实验结果表明,相对于有限元非刚性配准而言,对数域对称Demons微分同胚非刚性配准方法具有较好的优势,其配准每张图片的平均时间为有限元法的3.1%,而配准均方误差平均为有限元法的89%。
- 杨玲孙翠刚王中科饶妮妮
- 关键词：显微图像胶原纤维图像配准
- 蓝藻非编码RNA Yfr7的生物学特征分析
- 2014年
- Yfr家族是广泛存在于蓝藻基因组中的一类非编码RNA,在细胞代谢和环境适应方面发挥重要作用。文中选取Yfr7作为研究对象,首先根据序列特征确定Yfr7的二级结构,然后结合动态规划和自由能的计算方法预测Yfr7的调控基因,从细胞定位、分子功能和调控路径三方面对这些基因进行分析,以快速发现Yfr7的功能,最后通过构建进化树来揭示Yfr7的遗传特征。结果表明:Yfr7拥有独立的启动子区和操纵子,通过保守片段5'-GTGCTCTGATCTGACT-3'与目标mRNA序列互补来调控特定基因的表达;目标基因包括看家基因和酶基因,这些目标基因的功能说明Yfr7广泛参与细胞的次级代谢;进化树聚类表明Yfr7与菌株光照类型有关,参与蓝藻最重要的光合反应;Yfr7与6S RNA在序列、结构和遗传距离上都高度一致,推测可能来自同一个祖先。这些研究结果可为进一步开展相关实验研究提供理论基础。
- 李益饶妮妮杨峰杨阳张莹
- 关键词：蓝藻分子功能进化
